Influencia de Sistemas Buffer en la Interacción de Aptámeros y Células Salmonella enterica subsp. Enterica ser. Typhimurium (S. Typhi)

Introducción: Salmonella entérica subsp. Enterica ser. Typhimurium (S. Typhi) es uno de los agentes etiológicos de una de las enfermedades transmitidas por alimentos conocida como salmonelosis. Como estrategia en la búsqueda de nuevos sistemas diagnósticos se ha estudiado el uso de nucleótidos de cadena sencilla (aptámeros) cuyo desarrollo se realiza por el procedimiento SELEX. Cada grupo de investigación cuenta con sus propios parámetros para el desarrollo del sistema SELEX variando las condiciones de reacción lo que puede influir en los resultados obtenidos. En este trabajo se estudió la influencia de tres diferentes buffers y cuatro concentraciones de cloruro de magnesio en la capacidad de unión de una biblioteca de secuencias aleatorias de ADN de cadena sencilla (SAACS) a las células de Salmonella enterica. Materiales y Métodos: las células de Salmonella Typhimurium fueron incubadas simultáneamente con una biblioteca de oligonucleótidos de cadena sencilla en presencia de PBS, TBS o buffer TK o en presencia de concentraciones crecientes de MgCl2. Luego de la exposición se realizó la separación las secuencias unidas a las bacterias de las no unidas (o unidas débilmente) mediante centrifugación para ser cuantificadas posteriormente por qPCR. Se estudiaron también la relación secuencias unidas por células de Salmonella y la significancia de las diferencias encontradas fueron evaluadas por ANOVA. Resultados: no se encontró una influencia significativa en la recuperación de secuencias unidas a las células de S. Typhimurium al utilizar de forma independiente cada uno de los sistemas buffer a una concentración constante de MgCl2, sin embargo, se identificó que una concentración de 2.5 mM de MgCl2 aumenta significativamente el número de secuencias unidas a S. Typhimurium. No obstante, este efecto es limitado puesto que en concentraciones superiores se observó menor recuperación de secuencias. Conclusiones: En este estudio se encontró que la interacción de la biblioteca de SAACS puede unirse de a las células de Salmonella en función de la concentración de MgCl2 más que de la composición del buffer de reacción.

• Autores: Gómez-Guarnizo, Sharon Sofía
• Tipo de recurso: Trabajo de grado de pregrado
• Fecha de publicación: 2023
• Institución: Universidad de Santander
• Repositorio: Repositorio Universidad de Santander
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.udes.edu.co:001/9837
• Acceso en línea: https://repositorio.udes.edu.co; https://repositorio.udes.edu.co/handle/001/9837
• Palabra clave: Aptámeros; SAACS; Salmonella Typhimurium; Sistema buffer; Cloruro de magnesio; Aptamers; SAACS; Salmonella Typhimurium; Buffer system; Magnesium chloride
• Rights: openAccess
• License: http://purl.org/coar/access_right/c_abf2