Use of metabolomic and dereplication tools in the study of the chemical composition of some octocorals of the colombian caribbean and their cytotoxic activity
Los océanos cubren un poco mas de dos terceras partes de la superficie de la tierra y los organismos que en ellos viven constituyen cerca del 2% de la materia orgánica presente en los mares; en particular, las aguas cálidas del Mar Caribe contribuyen a la diversidad de la fauna marina, en donde, los...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad de la Sabana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad de la Sabana
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:intellectum.unisabana.edu.co:10818/42976
- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/10818/42976
- Palabra clave:
- Animales marinos
Organismos marinos
Biotecnología molecular
Resonancia magnética nuclear
Análisis multivariante
- Rights
- License
- Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional
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Use of metabolomic and dereplication tools in the study of the chemical composition of some octocorals of the colombian caribbean and their cytotoxic activityAnimales marinosOrganismos marinosBiotecnología molecularResonancia magnética nuclearAnálisis multivarianteLos océanos cubren un poco mas de dos terceras partes de la superficie de la tierra y los organismos que en ellos viven constituyen cerca del 2% de la materia orgánica presente en los mares; en particular, las aguas cálidas del Mar Caribe contribuyen a la diversidad de la fauna marina, en donde, los octocorales son la macrofauna arrecifal más visible. Estos organismos, son fuente productiva de una gran diversidad de compuestos químicos los cuales les sirven como defensa química contra depredadores, pero también mucho de ellos han presentado actividades biológicas importantes para combatir diferentes enfermedades; por lo cual, es importante investigar sobre nuevas herramientas de estudio que permitan explorar este gran potencial. Por lo anterior, en este proyecto se estudió la relación de la actividad citotóxica de algunos octocorales del Caribe Colombiano con respecto a su composición metabólica, usando diferentes herramientas como la dereplicación, útil en la identificación temprana de compuestos nuevos o conocidos con actividad biológica, el uso de Redes Moleculares de Productos Naturales (GNPS) que con el uso del software Cytoscape permitió observar ¿cluster¿ o agrupaciones de moléculas con patrones de fragmentación similares y finalmente; la herramienta metabolómica, que permitió detectar un gran número de metabolitos presentes en los organismos estudiados. Para el desarrollo de este proyecto, se utilizaron técnicas cromatográficas de alta eficiencia: cromatografía líquida ultra eficiente junto con espectrometría de masas de alta resolución (UPLCHRMS / Agilent 6540) y resonancia magnética nuclear (RMN / Agilent 600 MHz); que ayudó en la determinación del perfil global de los metabolitos presentes en los extractos octocorales; además, en los modelos generados a partir del análisis multivariado de componentes principales (PCA) y análisis discriminantes.Doctor en BiocienciasDoctoradoUniversidad de La SabanaDoctorado en BiocienciasFacultad de IngenieríaCamacho, Edisson T.Thomas, Olivier P.Santacruz Cifuentes, Liliana Andrea8/24/2020 10:458/24/2020 10:452020-06-11Tesis/Trabajo de grado - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://purl.org/redcol/resource_type/TD102 páginasapplication/pdfapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/10818/42976277707TE10735engAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2oai:intellectum.unisabana.edu.co:10818/429762026-02-17T16:49:39Z |
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Los océanos cubren un poco mas de dos terceras partes de la superficie de la tierra y los organismos que en ellos viven constituyen cerca del 2% de la materia orgánica presente en los mares; en particular, las aguas cálidas del Mar Caribe contribuyen a la diversidad de la fauna marina, en donde, los octocorales son la macrofauna arrecifal más visible. Estos organismos, son fuente productiva de una gran diversidad de compuestos químicos los cuales les sirven como defensa química contra depredadores, pero también mucho de ellos han presentado actividades biológicas importantes para combatir diferentes enfermedades; por lo cual, es importante investigar sobre nuevas herramientas de estudio que permitan explorar este gran potencial. Por lo anterior, en este proyecto se estudió la relación de la actividad citotóxica de algunos octocorales del Caribe Colombiano con respecto a su composición metabólica, usando diferentes herramientas como la dereplicación, útil en la identificación temprana de compuestos nuevos o conocidos con actividad biológica, el uso de Redes Moleculares de Productos Naturales (GNPS) que con el uso del software Cytoscape permitió observar ¿cluster¿ o agrupaciones de moléculas con patrones de fragmentación similares y finalmente; la herramienta metabolómica, que permitió detectar un gran número de metabolitos presentes en los organismos estudiados. Para el desarrollo de este proyecto, se utilizaron técnicas cromatográficas de alta eficiencia: cromatografía líquida ultra eficiente junto con espectrometría de masas de alta resolución (UPLCHRMS / Agilent 6540) y resonancia magnética nuclear (RMN / Agilent 600 MHz); que ayudó en la determinación del perfil global de los metabolitos presentes en los extractos octocorales; además, en los modelos generados a partir del análisis multivariado de componentes principales (PCA) y análisis discriminantes. |
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