BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates

UNISANGIL has one of Colombia's five collections of aquatic macroinvertebrates, being the only one in the Department of Santander. The bioinformatics platform "Biological Collection - BiolCol" seeks to digitize the biological reference collection of macroinvertebrates of UNISANGIL-CBM...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2023
Institución:
Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia
Repositorio:
RiUPTC: Repositorio Institucional UPTC
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.uptc.edu.co:001/14369
Acceso en línea:
https://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/15525
https://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/14369
Palabra clave:
colección biológica
macroinvertebrados acuáticos
plataforma bioinformática
SCRUM
ingeniería de software
aquatic macroinvertebrates
bioinformatics platform
computational fluid dynamics
subsidence
software
Rights
License
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0
id REPOUPTC2_42914d35ed08f3199ac8a2513fb96e0d
oai_identifier_str oai:repositorio.uptc.edu.co:001/14369
network_acronym_str REPOUPTC2
network_name_str RiUPTC: Repositorio Institucional UPTC
repository_id_str
dc.title.en-US.fl_str_mv BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
dc.title.es-ES.fl_str_mv BiolCol: Plataforma tecnológica para la difusión de la colección biológica de referencia de macroinvertebrados acuáticos
title BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
spellingShingle BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
colección biológica
macroinvertebrados acuáticos
plataforma bioinformática
SCRUM
ingeniería de software
aquatic macroinvertebrates
bioinformatics platform
computational fluid dynamics
subsidence
software
title_short BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
title_full BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
title_fullStr BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
title_full_unstemmed BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
title_sort BiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic Macroinvertebrates
dc.subject.es-ES.fl_str_mv colección biológica
macroinvertebrados acuáticos
plataforma bioinformática
SCRUM
ingeniería de software
topic colección biológica
macroinvertebrados acuáticos
plataforma bioinformática
SCRUM
ingeniería de software
aquatic macroinvertebrates
bioinformatics platform
computational fluid dynamics
subsidence
software
dc.subject.en-US.fl_str_mv aquatic macroinvertebrates
bioinformatics platform
computational fluid dynamics
subsidence
software
description UNISANGIL has one of Colombia's five collections of aquatic macroinvertebrates, being the only one in the Department of Santander. The bioinformatics platform "Biological Collection - BiolCol" seeks to digitize the biological reference collection of macroinvertebrates of UNISANGIL-CBMUS. The design of BioCol was led by three students and the coordinator of the GIBD-SI of the UNISANGIL Systems Engineering Program. The work methodology applied in the development process was Scrum. Additionally, we followed the method Sampieri proposed to identify the needs, establish the objectives, define the scope, formulate the projected activities over time, and define the deliverables for developing the application. Based on the Darwin Core standard used by the Colombian biodiversity information system (SiB Colombia), we designed the system architecture, built models, and designed the database. To develop the interface, we used Laravel for the back end and NodeJS for the front end, and we integrated the images and 3D models of those specimens with available information. The platform allows the online registration, storage, and visualization of information CBMUS collection specimens. It also generates a label with a QR code for each individual, which enables queries of the data stored for each specimen. Overall, this platform aims to facilitate the registration, administration, and dissemination of biological collection information for researchers and the community in general.
publishDate 2023
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2024-07-05T19:12:10Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2024-07-05T19:12:10Z
dc.date.none.fl_str_mv 2023-05-06
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a147
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/15525
10.19053/01211129.v32.n64.2023.15525
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/14369
url https://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/15525
https://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/14369
identifier_str_mv 10.19053/01211129.v32.n64.2023.15525
dc.language.none.fl_str_mv eng
dc.language.iso.spa.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv https://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/15525/12874
https://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/15525/13446
dc.rights.en-US.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by/4.0
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf64
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by/4.0
http://purl.org/coar/access_right/c_abf64
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
text/xml
dc.publisher.en-US.fl_str_mv Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia
dc.source.en-US.fl_str_mv Revista Facultad de Ingeniería; Vol. 32 No. 64 (2023): April-June 2023 (Continuous Publication); e15525
dc.source.es-ES.fl_str_mv Revista Facultad de Ingeniería; Vol. 32 Núm. 64 (2023): Abril-Junio 2023 (Publicación Continua); e15525
dc.source.none.fl_str_mv 2357-5328
0121-1129
institution Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional UPTC
repository.mail.fl_str_mv repositorio.uptc@uptc.edu.co
_version_ 1839633795218669568
spelling 2023-05-062024-07-05T19:12:10Z2024-07-05T19:12:10Zhttps://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/1552510.19053/01211129.v32.n64.2023.15525https://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/14369UNISANGIL has one of Colombia's five collections of aquatic macroinvertebrates, being the only one in the Department of Santander. The bioinformatics platform "Biological Collection - BiolCol" seeks to digitize the biological reference collection of macroinvertebrates of UNISANGIL-CBMUS. The design of BioCol was led by three students and the coordinator of the GIBD-SI of the UNISANGIL Systems Engineering Program. The work methodology applied in the development process was Scrum. Additionally, we followed the method Sampieri proposed to identify the needs, establish the objectives, define the scope, formulate the projected activities over time, and define the deliverables for developing the application. Based on the Darwin Core standard used by the Colombian biodiversity information system (SiB Colombia), we designed the system architecture, built models, and designed the database. To develop the interface, we used Laravel for the back end and NodeJS for the front end, and we integrated the images and 3D models of those specimens with available information. The platform allows the online registration, storage, and visualization of information CBMUS collection specimens. It also generates a label with a QR code for each individual, which enables queries of the data stored for each specimen. Overall, this platform aims to facilitate the registration, administration, and dissemination of biological collection information for researchers and the community in general.UNISANGIL posee una de las 5 colecciones de macroinvertebrados acuáticos del país y es la única en el departamento de Santander, a continuación, se describe el proceso de desarrollo de una plataforma bioinformática llamada "Biological Collection - BiolCol" por parte de tres estudiantes y la coordinadora del semillero GIBD-SI del programa de Ingeniería de Sistemas de UNISANGIL, con el objetivo de digitalizar la colección biológica de referencia de macroinvertebrados de UNISANGIL-CBMUS. La metodología de trabajo aplicada en el proceso de desarrollo fue SCRUM, adicionalmente se utilizó la metodología propuesta por el Sampieri para identificar la necesidad, establecer los objetivos, definir el alcance, formular las actividades proyectadas en el tiempo y definir los entregables del proyecto. Se diseñó la arquitectura del sistema, se construyeron modelos y se diseñó la base de datos tomando como referente el estándar Darwin Core utilizado por el sistema de información de biodiversidad de Colombia (SiB Colombia). Para el desarrollo de la interfaz de usuario se utilizaron las herramientas Laravel para el backend y NodeJS para el frontend, se integraron las imágenes y los modelos 3D de los especímenes que tenían la información disponible. La plataforma permite el registro, almacenamiento y visualización de información de los especímenes de la colección CBMUS a través de Internet y genera una etiqueta con código QR para cada individuo que permite la consulta de la información almacenada sobre cada macroinvertebrado registrado. Esta plataforma tiene como objetivo facilitar el registro, la administración y la divulgación de la información de la colección biológica, siendo muy importante para investigadores y la comunidad en general.application/pdftext/xmlengengUniversidad Pedagógica y Tecnológica de Colombiahttps://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/15525/12874https://revistas.uptc.edu.co/index.php/ingenieria/article/view/15525/13446Copyright (c) 2023 Luz-Yamile Caicedo-Chacón, Henry-Javier Barón-González, Juan-Carlos Sánchez-Pedroza, Carlos-Alberto Aguilar-Carreño, Kevin-Santiago Vega-Otálora, Kevin-Giancarlo Borja-Acostahttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0http://purl.org/coar/access_right/c_abf64http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Revista Facultad de Ingeniería; Vol. 32 No. 64 (2023): April-June 2023 (Continuous Publication); e15525Revista Facultad de Ingeniería; Vol. 32 Núm. 64 (2023): Abril-Junio 2023 (Publicación Continua); e155252357-53280121-1129colección biológicamacroinvertebrados acuáticosplataforma bioinformáticaSCRUMingeniería de softwareaquatic macroinvertebratesbioinformatics platformcomputational fluid dynamicssubsidencesoftwareBiolCol: Technological Platform for the Dissemination of the Biological Reference Collection of Aquatic MacroinvertebratesBiolCol: Plataforma tecnológica para la difusión de la colección biológica de referencia de macroinvertebrados acuáticosinfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1info:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a147http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Caicedo-Chacón, Luz YamileBarón-González, Henry JavierSánchez-Pedroza, Juan CarlosAguilar-Carreño, Carlos AlbertoVega-Otálora, Kevin SantiagoBorja-Acosta, Kevin Giancarlo001/14369oai:repositorio.uptc.edu.co:001/143692025-07-18 11:53:14.426metadata.onlyhttps://repositorio.uptc.edu.coRepositorio Institucional UPTCrepositorio.uptc@uptc.edu.co