Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales
Este proyecto se enfoca en el desarrollo de una herramienta para la segmentación celular en imágenes de microscopía, permitiendo a los investigadores, científicos y profesionales del área de la salud simplificar y acelerar el proceso de investigación para el desarrollo de fármacos y tratamientos con...
- Autores:
-
Fuentes Acosta, Martín Elías
Primo Barrios, Carlos Alberto
Ricardo Ariza, Juan Pablo
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad del Norte
- Repositorio:
- Repositorio Uninorte
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:manglar.uninorte.edu.co:10584/11231
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10584/11231
- Palabra clave:
- Segmentación de imágenes
Célula neuronal
Detección celular
Segmentación de instancias
Red Neuronal Convolucional
Visión por ordenador
Image segmentation
Neural cell
Cell detection
Instance segmentation
Convolutional neural network
Computer vision
- Rights
- License
- Universidad del Norte
| id |
REPOUNORT2_30d5d564ce4ac8221849b6a10f4df11e |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:manglar.uninorte.edu.co:10584/11231 |
| network_acronym_str |
REPOUNORT2 |
| network_name_str |
Repositorio Uninorte |
| repository_id_str |
|
| dc.title.es_ES.fl_str_mv |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales |
| dc.title.en_US.fl_str_mv |
Application of computer vision algorithms (Convolutional Neural Networks) for cell segmentation in microscopy images focused on neuronal cells |
| title |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales |
| spellingShingle |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales Segmentación de imágenes Célula neuronal Detección celular Segmentación de instancias Red Neuronal Convolucional Visión por ordenador Image segmentation Neural cell Cell detection Instance segmentation Convolutional neural network Computer vision |
| title_short |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales |
| title_full |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales |
| title_fullStr |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales |
| title_full_unstemmed |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales |
| title_sort |
Aplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronales |
| dc.creator.fl_str_mv |
Fuentes Acosta, Martín Elías Primo Barrios, Carlos Alberto Ricardo Ariza, Juan Pablo |
| dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Nieto Bernal, Wilson |
| dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Fuentes Acosta, Martín Elías Primo Barrios, Carlos Alberto Ricardo Ariza, Juan Pablo |
| dc.subject.es_ES.fl_str_mv |
Segmentación de imágenes Célula neuronal Detección celular Segmentación de instancias Red Neuronal Convolucional Visión por ordenador |
| topic |
Segmentación de imágenes Célula neuronal Detección celular Segmentación de instancias Red Neuronal Convolucional Visión por ordenador Image segmentation Neural cell Cell detection Instance segmentation Convolutional neural network Computer vision |
| dc.subject.en_US.fl_str_mv |
Image segmentation Neural cell Cell detection Instance segmentation Convolutional neural network Computer vision |
| description |
Este proyecto se enfoca en el desarrollo de una herramienta para la segmentación celular en imágenes de microscopía, permitiendo a los investigadores, científicos y profesionales del área de la salud simplificar y acelerar el proceso de investigación para el desarrollo de fármacos y tratamientos contra los trastornos neurodegenerativos. Se utilizarán redes neuronales convolucionales (CNNs) para reconocer de una forma muy precisa los patrones no uniformes en imágenes que no son fáciles de identificar, como lo son las células neuronales en imágenes de microscopía; específicamente, la solución a este problema de segmentación celular se fundamentará en la red neuronal convolucional UNET, la cual se basa en la segmentación de imágenes mediante el uso de CNNs. Se pretende lograr segmentar de manera automatizada células neuronales, y dado que la segmentación de este tipo de célula presenta una oportunidad de mejora y gran impacto, se espera que esta solución simplifique y acelere el progreso en las disciplinas de la ciencia de la vida y bioprocesamiento, así como para mejorar el estado del arte en este aspecto de la investigación. |
| publishDate |
2022 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2022-12-07T16:18:48Z |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2022-12-07T16:18:48Z |
| dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2022-12-01 |
| dc.type.es_ES.fl_str_mv |
article |
| dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10584/11231 |
| url |
http://hdl.handle.net/10584/11231 |
| dc.language.iso.es_ES.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.rights.es_ES.fl_str_mv |
Universidad del Norte |
| dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| rights_invalid_str_mv |
Universidad del Norte http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| dc.publisher.es_ES.fl_str_mv |
Barranquilla, Universidad del Norte, 2022 |
| institution |
Universidad del Norte |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/1/Segmentacion%20celular%20aplicando%20redes%20neuronales.pdf https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/2/celulas%20sin%20segmentar.png https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/3/celulas%20segmentadas%20por%20modelo.png https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/4/license.txt |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
53d1e1d35efc195bb74c333280f58752 49f0b6022d2e3f5250177b4f6594fa05 e26316ebda98ce78ca2d8b53678b140b 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Digital de la Universidad del Norte |
| repository.mail.fl_str_mv |
mauribe@uninorte.edu.co |
| _version_ |
1812183108814897152 |
| spelling |
Nieto Bernal, WilsonFuentes Acosta, Martín ElíasPrimo Barrios, Carlos AlbertoRicardo Ariza, Juan Pablo2022-12-07T16:18:48Z2022-12-07T16:18:48Z2022-12-01http://hdl.handle.net/10584/11231Este proyecto se enfoca en el desarrollo de una herramienta para la segmentación celular en imágenes de microscopía, permitiendo a los investigadores, científicos y profesionales del área de la salud simplificar y acelerar el proceso de investigación para el desarrollo de fármacos y tratamientos contra los trastornos neurodegenerativos. Se utilizarán redes neuronales convolucionales (CNNs) para reconocer de una forma muy precisa los patrones no uniformes en imágenes que no son fáciles de identificar, como lo son las células neuronales en imágenes de microscopía; específicamente, la solución a este problema de segmentación celular se fundamentará en la red neuronal convolucional UNET, la cual se basa en la segmentación de imágenes mediante el uso de CNNs. Se pretende lograr segmentar de manera automatizada células neuronales, y dado que la segmentación de este tipo de célula presenta una oportunidad de mejora y gran impacto, se espera que esta solución simplifique y acelere el progreso en las disciplinas de la ciencia de la vida y bioprocesamiento, así como para mejorar el estado del arte en este aspecto de la investigación.— This project focuses on the development of a tool for cell segmentation in microscopy images, allowing researchers, scientists and health professionals to simplify and accelerate the research process for the development of drugs and treatments against neurodegenerative disorders. Convolutional neural networks (CNNs) will be used to accurately recognize non-uniform patterns in images that are not easy to identify, such as neuronal cells in microscopy images; specifically, the solution to this cell segmentation problem will be based on the U-NET convolutional neural network, which is based on image segmentation through the use of CNNs. It is intended to achieve automated segmentation of neuronal cells, and since the segmentation of this type of cell presents an opportunity for improvement and great impact, it is expected that this solution will simplify and accelerate progress in the disciplines of life science and bioprocessing, as well as to improve the state of the art in this aspect of research.spaBarranquilla, Universidad del Norte, 2022Universidad del Nortehttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Segmentación de imágenesCélula neuronalDetección celularSegmentación de instanciasRed Neuronal ConvolucionalVisión por ordenadorImage segmentationNeural cellCell detectionInstance segmentationConvolutional neural networkComputer visionAplicación de algoritmos de visión por ordenador (Redes Neuronales Convolucionales) para la segmentación celular en imágenes de microscopía enfocado en células neuronalesApplication of computer vision algorithms (Convolutional Neural Networks) for cell segmentation in microscopy images focused on neuronal cellsarticlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501ORIGINALSegmentacion celular aplicando redes neuronales.pdfSegmentacion celular aplicando redes neuronales.pdfInforme principal del proyecto de gradoapplication/pdf688766https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/1/Segmentacion%20celular%20aplicando%20redes%20neuronales.pdf53d1e1d35efc195bb74c333280f58752MD51celulas sin segmentar.pngcelulas sin segmentar.pngCélulas neuronales sin segmentarimage/png224368https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/2/celulas%20sin%20segmentar.png49f0b6022d2e3f5250177b4f6594fa05MD52celulas segmentadas por modelo.pngcelulas segmentadas por modelo.pngCélulas neuronales segmentadas por el modeloimage/png10724https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/3/celulas%20segmentadas%20por%20modelo.pnge26316ebda98ce78ca2d8b53678b140bMD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://manglar.uninorte.edu.co/bitstream/10584/11231/4/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5410584/11231oai:manglar.uninorte.edu.co:10584/112312022-12-07 11:18:48.671Repositorio Digital de la Universidad del Nortemauribe@uninorte.edu.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 |