Interpretabilidad de un modelo basado en aprendizaje profundo para el diagnóstico de retinopatía diabética
En este documento se presenta el desarrollo de una red neuronal convolucional profunda para la clasificación de imágenes de retina con retinopatía diabética y la implementación de mapas de activaciones de clase ponderados por gradientes (Grad-CAM) a los resultados obtenidos por el modelo. El modelo...
- Autores:
-
Torres Revelo, Isabella
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad Autónoma de Occidente
- Repositorio:
- RED: Repositorio Educativo Digital UAO
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:red.uao.edu.co:10614/12751
- Acceso en línea:
- http://red.uao.edu.co//handle/10614/12751
- Palabra clave:
- Ingeniería Biomédica
Retinopatía diabética
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Interpretabilidad
Técnicas de explicación
Grad-CAM
Mapas de activación de clase
Deep learning
Redes neurales (Computadores)
Imágenes diagnósticas-Técnicas digitales
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En este documento se presenta el desarrollo de una red neuronal convolucional profunda para la clasificación de imágenes de retina con retinopatía diabética y la implementación de mapas de activaciones de clase ponderados por gradientes (Grad-CAM) a los resultados obtenidos por el modelo. El modelo fue entrenado con un conjunto de imágenes de retina (aproximadamente 88.000) de alta resolución tomadas bajo diferentes condiciones de captura. Las imágenes fueron sometidas a un preprocesamiento con el objetivo de homogeneizar su tamaño y color. Además, fueron etiquetadas por expertos médicos con los cinco niveles de severidad de la enfermedad. El desempeño de la red neuronal fue evaluado por medio del cálculo de métricas estadísticas obtenidas de la matriz de confusión y con la métrica Kappa. Con esta última se obtuvo un porcentaje de acuerdo de 77% para los datos de prueba entre la clasificación dada por el modelo y la de los expertos médicos. También, con la matriz de confusión se identificaron los errores de tipo I y II cometidos por la red neuronal. Grad-CAM es una técnica de explicación que aporta información sobre las representaciones internas de los modelos de aprendizaje profundo. La aplicación de esta técnica en las imágenes de la retina resaltó regiones donde se encuentran lesiones características de la enfermedad con un mapa de calor. Estos resultados permitieron conocer los patrones y características que la red neuronal aprendió a reconocer y se comprendieron las razones por las cuales la red neuronal clasifica una imagen en un nivel de severidad determinado. Así mismo, facilitó el reconocimiento de falsos positivos y negativos en los resultados de la clasificación permitiendo que se desarrollen alternativas y mejoras al modelo de red neuronal para aumentar su desempeño y su capacidad de reconocimiento |
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Paniagua Jaramillo, Jose Luis73d13f53cb9b70bbb37f862962f684e4Torres Revelo, Isabella4622482e6d098d96022b4d335fb96423Ingeniero BiomédicoUniversidad Autónoma de Occidente. Calle 25 115-85. Km 2 vía Cali-Jamundí2020-12-18T19:13:48Z2020-12-18T19:13:48Z2020-11-30http://red.uao.edu.co//handle/10614/12751En este documento se presenta el desarrollo de una red neuronal convolucional profunda para la clasificación de imágenes de retina con retinopatía diabética y la implementación de mapas de activaciones de clase ponderados por gradientes (Grad-CAM) a los resultados obtenidos por el modelo. El modelo fue entrenado con un conjunto de imágenes de retina (aproximadamente 88.000) de alta resolución tomadas bajo diferentes condiciones de captura. Las imágenes fueron sometidas a un preprocesamiento con el objetivo de homogeneizar su tamaño y color. Además, fueron etiquetadas por expertos médicos con los cinco niveles de severidad de la enfermedad. El desempeño de la red neuronal fue evaluado por medio del cálculo de métricas estadísticas obtenidas de la matriz de confusión y con la métrica Kappa. Con esta última se obtuvo un porcentaje de acuerdo de 77% para los datos de prueba entre la clasificación dada por el modelo y la de los expertos médicos. También, con la matriz de confusión se identificaron los errores de tipo I y II cometidos por la red neuronal. Grad-CAM es una técnica de explicación que aporta información sobre las representaciones internas de los modelos de aprendizaje profundo. La aplicación de esta técnica en las imágenes de la retina resaltó regiones donde se encuentran lesiones características de la enfermedad con un mapa de calor. Estos resultados permitieron conocer los patrones y características que la red neuronal aprendió a reconocer y se comprendieron las razones por las cuales la red neuronal clasifica una imagen en un nivel de severidad determinado. Así mismo, facilitó el reconocimiento de falsos positivos y negativos en los resultados de la clasificación permitiendo que se desarrollen alternativas y mejoras al modelo de red neuronal para aumentar su desempeño y su capacidad de reconocimientoIn this document is presented the development of a deep convolutional neural network for the classification of retinal images with diabetic retinopathy and the implementation of gradient-weighted class activation maps (Grad-CAM) to the results obtained by the model. The model was trained with a set of high-resolution retinal images (approximately 88,000) taken under different capture conditions. The images were subjected to pre-processing in order to homogenize their size and color. In addition, they were labeled by medical experts with the five levels of disease severity. The performance of the neural network was evaluated by calculating statistical metrics obtained from the confusion matrix and with Kappa metrics. With the latter, a percentage agreement of 77% was obtained for the test data between the classification given by the model and that of the medical experts. Also, with the confusion matrix, errors of type I and II committed by the neuronal network were identified. Grad-CAM is an explanation technique that provides information about the internal representations of the deep learning models. The application of this technique in retinal images highlighted regions where characteristic lesions of the disease are found with a heat map. These results made it possible to know the patterns and characteristics that the neuronal network learned to recognize and to understand the reasons why the neuronal network classifies an image at a given level of severity. It also facilitated the recognition of false positives and negatives in the classification results allowing alternatives and improvements to the neural network model to increase its performance and recognition capacity.Proyecto de grado (Ingeniero Biomédico)-- Universidad Autónoma de Occidente, 2020PregradoIngeniero(a) Biomédico(a)application/pdf102 páginasspaUniversidad Autónoma de OccidenteIngeniería BiomédicaDepartamento de Automática y ElectrónicaFacultad de IngenieríaDerechos Reservados - Universidad Autónoma de Occidentehttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2instname:Universidad Autónoma de Occidentereponame:Repositorio Institucional UAOIngeniería BiomédicaRetinopatía diabéticaRedes neuronales convolucionalesInterpretabilidadTécnicas de explicaciónGrad-CAMMapas de activación de claseDeep learningRedes neurales (Computadores)Imágenes diagnósticas-Técnicas digitalesArtificial intelligenceNeural networks (Computer science)Diagnostic imaging-Digital techniquesInterpretabilidad de un modelo basado en aprendizaje profundo para el diagnóstico de retinopatía diabéticaTrabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85ACEVEDO Eder; SERNA Alexei y SERNA Edgar. 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