Deep learning aplicado a imágenes de retina como herramienta de tamizaje en un proceso de diagnóstico médico
El diagnóstico asistido por computador, es un método que brinda a los expertos médicos una asistencia en la interpretación de imágenes médicas, para obtener un diagnóstico óptimo. Entre estos métodos, el deep learning ha sido utilizado para crear sistemas de detección automáticos, que permiten tener...
- Autores:
-
Álvarez Triviño, María Camila
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2017
- Institución:
- Universidad Autónoma de Occidente
- Repositorio:
- RED: Repositorio Educativo Digital UAO
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:red.uao.edu.co:10614/9568
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10614/9568
- Palabra clave:
- Ingeniería Mecatrónica
Redes neurales (Computadores)
Diagnóstico por imágenes
Retinopatía diabética
Deep learning
Diabetic retinopathy
Diagnostic imaging
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El diagnóstico asistido por computador, es un método que brinda a los expertos médicos una asistencia en la interpretación de imágenes médicas, para obtener un diagnóstico óptimo. Entre estos métodos, el deep learning ha sido utilizado para crear sistemas de detección automáticos, que permiten tener diagnósticos más acertados, y en algunos casos, realizar evaluaciones en lugares donde la asistencia médica es limitada. En el presente proyecto, se desarrolló un sistema de deep learning aplicado a imágenes de retina humana, como herramienta de tamizaje en un proceso de diagnóstico médico. Se utilizó una base de datos de imágenes provistas por EyePACS, una plataforma para el intercambio de información clínica relacionada con los ojos. Estas imágenes, fueron usadas en un concurso de Kaggle, cuyo propósito era identificar signos de retinopatía diabética en imágenes de retinas a través de un sistema de detección automático. Usando como inspiración una de las soluciones al problema del concurso, fue posible implementar una modelo, capaz de detectar retinopatía diabética a partir de imágenes de retina de entrada. Inicialmente, se realizó un pre-procesamiento a las imágenes, debido a que estas fueron tomadas con cámara de diferentes resoluciones y condiciones de luminosidad variables. Por lo tanto, se normalizaron las imágenes a través de una serie de métodos, como centrar la retina en la imagen, estandarizar se resolución, y efectuar algunas transformaciones de color. Seguidamente, estas imágenes pre-procesadas se usaron como entrada a una red neuronal convolucional profunda, la cual realizaba un proceso de extracción de características para obtener los patrones relevantes, que diferenciaban un paciente enfermo de uno sano. La red fue entrenada para clasificar cinco categorías de retinopatía diabética, donde cero correspondía a un paciente sano y cuatro a un caso de retinopatía diabética proliferativa (nivel avanzado de la enfermedad). Durante la experimentación se implementaron técnicas como data augmentation, normalización por batch, regularizadores y dropout para facilitar el aprendizaje de la red, y evitar el sobre-entrenamiento. Finalmente, después de múltiples experimentos y configuraciones, se logró obtener un sistema capaz de identificar la enfermedad, con un nivel de acuerdo con respecto a las etiquetas asignada por un médico, para datos de prueba de 76,73%. Este resultado, indica que se obtuvo una red con un buen desempeño, que fue capaz de generalizar los patrones aprendidos, para clasificar imágenes diferentes a las cuales con las que fue entrenada |
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Este resultado, indica que se obtuvo una red con un buen desempeño, que fue capaz de generalizar los patrones aprendidos, para clasificar imágenes diferentes a las cuales con las que fue entrenadaProyecto de grado (Ingeniero Mecatrónico)-- Universidad Autónoma de Occidente, 2017PregradoIngeniero(a) Mecatrónico(a)application/pdfspaUniversidad Autónoma de OccidenteIngeniería MecatrónicaDepartamento de Automática y ElectrónicaFacultad de IngenieríaEL AUTOR autoriza a la Universidad Autónoma de Occidente, de forma indefinida, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, la Ley 44 de 1993, la Decisión andina 351 de 1993, el Decreto 460 de 1995 y demás leyes y jurisprudencia vigente al respecto, haga publicación de este con fines educativos. PARAGRAFO: Esta autorización además de ser válida para las facultades y derechos de uso sobre la obra en formato o soporte material, también para formato digital, electrónico, virtual, para usos en red, Internet, extranet, intranet, biblioteca digital y demás para cualquier formato conocido o por conocer. EL AUTOR, expresa que el documento (trabajo de grado, pasantía, casos o tesis) objeto de la presente autorización es original y la elaboró sin quebrantar ni suplantar los derechos de autor de terceros, y de tal forma, el documento (trabajo de grado, pasantía, casos o tesis) es de su exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre éste. PARAGRAFO: en caso de presentarse alguna reclamación o acción por parte de un tercero, referente a los derechos de autor sobre el documento (Trabajo de grado, Pasantía, casos o tesis) en cuestión, EL AUTOR, asumirá la responsabilidad total, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos, la Universidad Autónoma de Occidente actúa como un tercero de buena fe. Toda persona que consulte ya sea en la biblioteca o en medio electrónico podrá copiar apartes del texto citando siempre la fuente, es decir el título del trabajo y el autor. Esta autorización no implica renuncia a la facultad que tengo de publicar total o parcialmente la obra.https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2instname:Universidad Autónoma de Occidentereponame:Repositorio Institucional UAOIngeniería MecatrónicaRedes neurales (Computadores)Diagnóstico por imágenesRetinopatía diabéticaDeep learningDiabetic retinopathyDiagnostic imagingDeep learning aplicado a imágenes de retina como herramienta de tamizaje en un proceso de diagnóstico médicoTrabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Publicationhttps://scholar.google.com.au/citations?user=7PIjh_MAAAAJ&hl=envirtual::2942-10000-0002-9731-8458virtual::2942-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000249106virtual::2942-1fc227fb1-22ec-47f0-afe7-521c61fddd32virtual::2942-1fc227fb1-22ec-47f0-afe7-521c61fddd32virtual::2942-1TEXTT07237.pdf.txtT07237.pdf.txtExtracted texttext/plain127130https://red.uao.edu.co/bitstreams/278f020f-e5e0-4588-bcaa-d65b9e9d04ce/download1fa210a203f94aa2003d4f7d9f8c06f5MD54THUMBNAILT07237.pdf.jpgT07237.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5932https://red.uao.edu.co/bitstreams/0e1f8ddd-f7a8-41f0-a217-9bfc52af8592/downloadd816089b55b95c2ba2d8a21c8e972bd0MD55ORIGINALT07237.pdfT07237.pdfapplication/pdf1950180https://red.uao.edu.co/bitstreams/bfc0885e-4d46-4c72-ab7c-c61dc21b93cc/download14651a4349e7d56c9b9b955c55c0aa64MD51T7237A.zipT7237A.zipapplication/octet-stream184977374https://red.uao.edu.co/bitstreams/37a6b8d2-6994-40db-8d08-3741cc472f6d/download3761ca037e8546699cd3f4d340165016MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://red.uao.edu.co/bitstreams/aed43033-d0f7-4c15-bba2-693e18569f06/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD5310614/9568oai:red.uao.edu.co:10614/95682024-03-07 16:52:55.852https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/EL AUTOR autoriza a la Universidad Autónoma de Occidente, de forma indefinida, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, la Ley 44 de 1993, la Decisión andina 351 de 1993, el Decreto 460 de 1995 y demás leyes y jurisprudencia vigente al respecto, haga publicación de este con fines educativos. PARAGRAFO: Esta autorización además de ser válida para las facultades y derechos de uso sobre la obra en formato o soporte material, también para formato digital, electrónico, virtual, para usos en red, Internet, extranet, intranet, biblioteca digital y demás para cualquier formato conocido o por conocer. EL AUTOR, expresa que el documento (trabajo de grado, pasantía, casos o tesis) objeto de la presente autorización es original y la elaboró sin quebrantar ni suplantar los derechos de autor de terceros, y de tal forma, el documento (trabajo de grado, pasantía, casos o tesis) es de su exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre éste. 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Esta autorización no implica renuncia a la facultad que tengo de publicar total o parcialmente la obra.open.accesshttps://red.uao.edu.coRepositorio Digital Universidad Autonoma de Occidenterepositorio@uao.edu.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 |