Identificación de genes de resistencia a benznidazole en Trypanosoma cruzi mediante el análisis del transcriptoma.
El transcriptoma de epimastigotes de T. cruzi sensibles y resistentes al benznidazol (resistencia natural e inducida) se secuenció utilizando la metodología 454, disponible en el Centro Nacional de Secuenciación Genómica de la Universidad de Antioquia (CNSG). Como modelo de resistencia inducida se u...
- Autores:
-
Triana Chávez, Omar
- Tipo de recurso:
- Investigation report
- Fecha de publicación:
- 2015
- Institución:
- Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
- Repositorio:
- Repositorio Minciencias
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/38608
- Acceso en línea:
- https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38608
http://colciencias.metabiblioteca.com.co
- Palabra clave:
- Genética bioquímica
Genómica
Benznidazol
Knock-out génico
Benznidazole
Enfermedad de Chagas
Mecanismos de acción de Bz
Resistencia a medicamentos
Transcriptoma
Trypanosoma cruzi
- Rights
- openAccess
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El transcriptoma de epimastigotes de T. cruzi sensibles y resistentes al benznidazol (resistencia natural e inducida) se secuenció utilizando la metodología 454, disponible en el Centro Nacional de Secuenciación Genómica de la Universidad de Antioquia (CNSG). Como modelo de resistencia inducida se utilizaron los clones Gal61 cl11 (sensible, SI), Gal61 cl13 (resistente inducido 1, RI1) y Gal61 cl4 (resistencia inducido 2, RI2), obtenidos de la cepa Gal61 aislada de ratón silvestre, los cuales tienen una concentración inhíbidora 50 (CL50) de 11,7 uM y 47,3 uM, respectivamente. (Apartes del texto). |
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Triana Chávez, Omarb0a75eee970bf6e9e0bddac3661c639a-1Universidad de Antioquia (Colombia)COL0001324 - Grupo de Biología Celular y Molecular de Parásitos y HospederosCOL0007865 - Grupo de Biología y Control de enfermedades infecciosas000 - The molecular biology of parasitic protozoa2019-09-13T17:34:53Z2020-12-17T23:05:25Z2019-09-13T17:34:53Z2020-12-17T23:05:25Z2015-01https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38608ColcienciasRepositorio Colcienciashttp://colciencias.metabiblioteca.com.coEl transcriptoma de epimastigotes de T. cruzi sensibles y resistentes al benznidazol (resistencia natural e inducida) se secuenció utilizando la metodología 454, disponible en el Centro Nacional de Secuenciación Genómica de la Universidad de Antioquia (CNSG). Como modelo de resistencia inducida se utilizaron los clones Gal61 cl11 (sensible, SI), Gal61 cl13 (resistente inducido 1, RI1) y Gal61 cl4 (resistencia inducido 2, RI2), obtenidos de la cepa Gal61 aislada de ratón silvestre, los cuales tienen una concentración inhíbidora 50 (CL50) de 11,7 uM y 47,3 uM, respectivamente. (Apartes del texto).61 páginas.spaInforme;Identificación de genes de resistencia a benznidazole en Trypanosoma cruzi mediante el análisis del transcriptoma.Informe de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_18wshttp://purl.org/coar/resource_type/c_93fcTextinfo:eu-repo/semantics/reporthttps://purl.org/redcol/resource_type/PIDinfo:eu-repo/semantics/submittedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32info:eu-repo/semantics/submittedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/Genética bioquímicaGenómicaBenznidazolKnock-out génicoBenznidazoleEnfermedad de ChagasMecanismos de acción de BzResistencia a medicamentosTranscriptomaTrypanosoma cruziEstudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.111551929168205Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] ColcienciasPrograma Nacional de CTeI en SaludObjetivo General : Determinar las diferencias en expresión y secuencia, de genes de Trypanosoma cruzi involucrados en la resistencia al Bz, mediante la comparación del transcriptoma de un fenotipo sensible y su contraparte resistente al medicamento.Objetivos Específicos : 1. Identificar genes diferencialmente expresados o con variaciones en las secuencias codificantes en poblaciones de parásitos de T. cruzi sensibles y resistentes al benznidazol mediante análisis bioinformático del transcriptoma.Objetivos Específicos : 2. Confirmar la expresión diferencial de algunos genes candidatos asociados a la resistencia al benznidazol en T. cruzi, mediante la cuantificación de los niveles de transcripto de cada gen a través de PCR en tiempo real y northern blot.Objetivos Específicos : 3. Determinar la ubicación cromosómica de algunos genes candidatos asociados a la resistencia al benznidazol en T. cruzi, mediante electroforesis en campo pulsado.Objetivos Específicos : 4. Confirmar la función en el fenotipo resistente de algunos de los genes seleccionados, mediante sobreexpresión o knock-out génico.PublicationORIGINAL111551929168 20152430024452.pdf111551929168 20152430024452.pdfInforme finalapplication/pdf19819212https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/4bc3acc2-4042-4dcd-ac33-540e03c803da/download5288fb93f6393a058754c8b12429cd6aMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814798https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/3d48556a-e98e-464a-88ab-53183c620aef/download88794144ff048353b359a3174871b0d5MD52license.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-80https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/d04b07ea-c211-40e9-9715-db7b33a6ccf9/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD55TEXT111551929168 20152430024452.pdf.txt111551929168 20152430024452.pdf.txtExtracted texttext/plain61https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/9650571e-2086-4436-a311-7f1acf0d5090/download12e043953cadc5683745a10a5ed85d37MD53THUMBNAIL111551929168 20152430024452.pdf.jpg111551929168 20152430024452.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7958https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/8c5c5fb1-9846-4eea-92ad-ad8a0e0fa502/downloadb6e8b86f7800364578680a47fc0073b0MD5420.500.14143/38608oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/386082023-11-29 17:28:25.981restrictedhttps://repositorio.minciencias.gov.coRepositorio Institucional de Mincienciascendoc@minciencias.gov.co |