Diseño de estrategias útiles en la producción estructural de la proteína CagA de Helicobacter pylori partiendo de una caracterización bioinformática y de ensayos de docking molecular.

La proteína CagA de Helicobacter pylori fue la primera oncoproteína bacteriana en ser identificada como importante en el desarrollo de tumores malignos humanos tales como el cáncer gástrico. No está claro cómo es capaz de desregular mecanismos de control celular para inducir la carcinogénesis despué...

Full description

Autores:: Jaramillo Henao, Carlos Alberto

Tipo de recurso:: Investigation report

Fecha de publicación:: 2015

Institución:: Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación

Repositorio:: Repositorio Minciencias

Idioma:: spa

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description	La proteína CagA de Helicobacter pylori fue la primera oncoproteína bacteriana en ser identificada como importante en el desarrollo de tumores malignos humanos tales como el cáncer gástrico. No está claro cómo es capaz de desregular mecanismos de control celular para inducir la carcinogénesis después de su translocación a las células epiteliales gástricas humanas. (Apartes del texto).
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Desarrollar una estrategia que permita amplificar el gen completo que codifica para la prote¿na CagA de H. pylori.Objetivos Específicos : 2. Caracterizar el gen cagA completo, previamente amplificado.Objetivos Específicos : 3. Corroborar la presencia de diferentes motivos de fosforilación tras la caracterización, usando los programas bioinformáticos disponibles, entre ellos el AASA, desarrollado en la Universidad de los Andes, para éste fin.Objetivos Específicos : 4. Uso de herramientas de búsqueda de motivos en secuencias biológicas para la confirmación de los motivos de fosforilación presentes.Objetivos Específicos : 5. Determinar la estructura terciaria de la proteína CagA usando modelaje por medio de herramientas basadas en homología, ab initio, mecánica y dinámica molecular.Objetivos Específicos : 6. Realizar un análisis del efecto de las diferentes motivos EPIYA de CagA sobre la densidad de potencial electroestático, spin y carga para determinar los motivos más propensos a fosforilar o desfosforilar y analizar una posible relación con el grado de patogenicidad de la cepa.Objetivos Específicos : 7. Evaluar la afinidad de cada uno de los motivos EPIYA con las señales SHP-2 y CsK por medio de un cálculo de la energía de enlace usando Docking molecular y correlacionar esto con el grado de patogenicidad de la cepa.Objetivos Colaterales : El proyecto pretende contribuir a la formación de personal en investigación clínica y a la implementación y consolidación de líneas de investigación multidisciplinarias tanto en biología como en Ingeniería Química, que apoyen el desarrollo y fortalecimiento de proyectos centrados en el área de Diagnóstico y caracterización molecular y el área de Biología computacional y Biología de sistemas que viene liderando el LDMB y el GDPP de la Universidad de los Andes.PublicationORIGINAL120452128554 20152430031622.pdf120452128554 20152430031622.pdfInforme finalapplication/pdf21146626https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/3a853039-f2f8-4da9-b4b8-3968bd3d057a/download6ed88468f123902f9ffe54ef42c6ab60MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814798https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/7153ef7b-2cf1-405c-b79b-6530c3e330c1/download88794144ff048353b359a3174871b0d5MD52license.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-80https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/19b6f333-d9b1-4ac1-ba56-3388f381cb8a/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD55TEXT120452128554 20152430031622.pdf.txt120452128554 20152430031622.pdf.txtExtracted texttext/plain72https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/f8127339-78ce-46c6-93c7-9deb78ae51cf/downloadfb57b385995f93a661a2e7b1da17c558MD53THUMBNAIL120452128554 20152430031622.pdf.jpg120452128554 20152430031622.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9371https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/85eb372a-39a2-4c89-9048-0bc0398c0abb/download1c263c523689f9de0c0a41361ef061bdMD5420.500.14143/39509oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/395092023-11-29 17:35:09.91restrictedhttps://repositorio.minciencias.gov.coRepositorio Institucional de Mincienciascendoc@minciencias.gov.co

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