Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009

La neumonía por Pneumocystis jirovecii (PCP) es una infección común en individuos con Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida (SIDA) e inmunocomprometidos por cáncer, transplantes, desnutrición y colagenopatías, entre otras causas. Se estima que su frecuencia aumenta a medida que mejora la sobrevida...

Full description

Autores:
Vélez Giraldo, Lázaro Agustín
Tipo de recurso:
Investigation report
Fecha de publicación:
2012
Institución:
Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
Repositorio:
Repositorio Minciencias
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/40205
Acceso en línea:
https://repositorio.minciencias.gov.co/handle/20.500.14143/40205
Palabra clave:
Neumonía en inmunocomprometidos
PCR
PCR en tiempo real
PCR-DHPLC
PCR-RFLP
PCR-SSCP
Pneumocystis jirovecii
Factores de riesgo
Mortalidad
Resistencia
Rights
openAccess
License
Derechos Reservados - Universidad de Antioquia, 2021
id RCENDOC_623f150fd818da8d2feeb584f12afe82
oai_identifier_str oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/40205
network_acronym_str RCENDOC
network_name_str Repositorio Minciencias
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
title Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
spellingShingle Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
Neumonía en inmunocomprometidos
PCR
PCR en tiempo real
PCR-DHPLC
PCR-RFLP
PCR-SSCP
Pneumocystis jirovecii
Factores de riesgo
Mortalidad
Resistencia
title_short Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
title_full Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
title_fullStr Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
title_full_unstemmed Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
title_sort Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
dc.creator.fl_str_mv Vélez Giraldo, Lázaro Agustín
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Vélez Giraldo, Lázaro Agustín
dc.contributor.corporatename.spa.fl_str_mv Universidad de Antioquia (UDEA) (Medellín, Colombia)
dc.contributor.researchgroup.spa.fl_str_mv COL 0005744 - Grupo Investigador de Problemas en Enfermedades Infecciosas
COL 0013709 - Grupo de Micología Médica y Experimental
COL 0013746 - Grupo de Microbiología Molecular
COL 0015099 - Programa de Estudio y Control de Enfermedades Tropicales
COL0004362 - Grupo de Epidemiología
dc.subject.proposal.none.fl_str_mv Neumonía en inmunocomprometidos
PCR
PCR en tiempo real
PCR-DHPLC
PCR-RFLP
PCR-SSCP
Pneumocystis jirovecii
Factores de riesgo
Mortalidad
Resistencia
topic Neumonía en inmunocomprometidos
PCR
PCR en tiempo real
PCR-DHPLC
PCR-RFLP
PCR-SSCP
Pneumocystis jirovecii
Factores de riesgo
Mortalidad
Resistencia
description La neumonía por Pneumocystis jirovecii (PCP) es una infección común en individuos con Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida (SIDA) e inmunocomprometidos por cáncer, transplantes, desnutrición y colagenopatías, entre otras causas. Se estima que su frecuencia aumenta a medida que mejora la sobrevida de las personas susceptibles y se desarrollan terapias inmunosupresoras más potentes. En Colombia la información es limitada, pero los pocos estudios existentes sugieren que hasta el 20% de nuestros pacientes en riesgo sufre PCP. Ésta se diagnostica al visualizar el microorganismo en muestras de lavado broncoalveolar (LBA), pero se requieren otros métodos pues el procedimiento es invasivo y dispendioso, especialmente en niños, y genera aerosoles capaces de transmitir otras enfermedades como tuberculosis. Debido a que P. jirovecii no se ha podido cultivar y es específico de la especie humana, se desconocen muchos aspectos de su biología y epidemiología, lo que ha obligado a desarrollar métodos moleculares para genotipificar el germen.
publishDate 2012
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2012-07-10
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-09-16T14:18:23Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-09-16T14:18:23Z
dc.type.spa.fl_str_mv Informe de investigación
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_8042
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/workingPaper
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/INF
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.minciencias.gov.co/handle/20.500.14143/40205
url https://repositorio.minciencias.gov.co/handle/20.500.14143/40205
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.issupplementto.none.fl_str_mv 111534319142
dc.rights.none.fl_str_mv Derechos Reservados - Universidad de Antioquia, 2021
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
rights_invalid_str_mv Derechos Reservados - Universidad de Antioquia, 2021
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 59 páginas.
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.spatial.none.fl_str_mv Medellín (Antioquia, Colombia)
dc.coverage.projectdates.spa.fl_str_mv 2006-2012
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad de Antioquia
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Medellín: Universidad de Antioquia, 2021
institution Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/ef4cdeff-5911-4dab-b616-043ca42c089a/download
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/c141d71c-87ca-4a0f-83f5-71ceebed5dae/download
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/c3d9d5c8-2867-4020-8a66-c14cc8427790/download
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/e6cbcb10-ff98-47dd-9ab6-6a3b1ec07c84/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 394703dfd790a42d77fb8b1b4071169a
2f9959eaf5b71fae44bbf9ec84150c7a
f8e02f37010c5a38b4b7747b169de886
8395c776e8f7e9b805c8b2f25c02d597
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional de Minciencias
repository.mail.fl_str_mv cendoc@minciencias.gov.co
_version_ 1811305860249419776
spelling Vélez Giraldo, Lázaro Agustín8d841b71-31dd-4e75-abe9-91a92c148110Universidad de Antioquia (UDEA) (Medellín, Colombia)COL 0005744 - Grupo Investigador de Problemas en Enfermedades InfecciosasCOL 0013709 - Grupo de Micología Médica y ExperimentalCOL 0013746 - Grupo de Microbiología MolecularCOL 0015099 - Programa de Estudio y Control de Enfermedades TropicalesCOL0004362 - Grupo de EpidemiologíaMedellín (Antioquia, Colombia)2006-20122021-09-16T14:18:23Z2021-09-16T14:18:23Z2012-07-10https://repositorio.minciencias.gov.co/handle/20.500.14143/40205La neumonía por Pneumocystis jirovecii (PCP) es una infección común en individuos con Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida (SIDA) e inmunocomprometidos por cáncer, transplantes, desnutrición y colagenopatías, entre otras causas. Se estima que su frecuencia aumenta a medida que mejora la sobrevida de las personas susceptibles y se desarrollan terapias inmunosupresoras más potentes. En Colombia la información es limitada, pero los pocos estudios existentes sugieren que hasta el 20% de nuestros pacientes en riesgo sufre PCP. Ésta se diagnostica al visualizar el microorganismo en muestras de lavado broncoalveolar (LBA), pero se requieren otros métodos pues el procedimiento es invasivo y dispendioso, especialmente en niños, y genera aerosoles capaces de transmitir otras enfermedades como tuberculosis. Debido a que P. jirovecii no se ha podido cultivar y es específico de la especie humana, se desconocen muchos aspectos de su biología y epidemiología, lo que ha obligado a desarrollar métodos moleculares para genotipificar el germen.Se estudiarán las muestras de LBA de aproximadamente 300 individuos inmunocomprometidos conservadas a -70ºC en nuestro laboratorio (dentro de las cuales hay cerca de 40 positivas para P. jirovecii), y el LBA y LO de 150 pacientes, también inmunocomprometidos, captados prospectivamente en 2 años. Se incluirán, además, el LBA y LO de 50 personas inmunocompetentes, sometidos a LBA por causas no infecciosas, para un total de 700 muestras. A todas se les harán las coloraciones tradicionales, inmunofluorescencia con anticuerpos monoclonales y PCR en tiempo real. Las positivas se estudiarán por PCR convencional para amplificar 4 genes (ITS1 y 2, mtLSU rRNA, mtSSU rRNA y DHPS) cuyo análisis por SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism), DHPLC (Denaturing High Performance Liquid Cromatography) y secuenciación permitirá detectar polimorfismos. La PCR cuantitativa y los distintos genotipos se relacionarán con la presencia de PCP, las características clínico-demográficas de los pacientes afectados, y su evolución con la terapia.59 páginas.application/pdfspaUniversidad de AntioquiaMedellín: Universidad de Antioquia, 2021Derechos Reservados - Universidad de Antioquia, 2021https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009Informe de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_18wshttp://purl.org/coar/resource_type/c_8042Textinfo:eu-repo/semantics/workingPaperhttps://purl.org/redcol/resource_type/INFinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85111534319142Neumonía en inmunocomprometidosPCRPCR en tiempo realPCR-DHPLCPCR-RFLPPCR-SSCPPneumocystis jiroveciiFactores de riesgoMortalidadResistenciaEstudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.111534319142400-2006Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] ColcienciasPrograma Nacional de CTeI en SaludPublicationORIGINALDiagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar.pdfDiagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar.pdfInforme finalapplication/pdf4880229https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/ef4cdeff-5911-4dab-b616-043ca42c089a/download394703dfd790a42d77fb8b1b4071169aMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814828https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/c141d71c-87ca-4a0f-83f5-71ceebed5dae/download2f9959eaf5b71fae44bbf9ec84150c7aMD52TEXTDiagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar.pdf.txtDiagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar.pdf.txtExtracted texttext/plain59https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/c3d9d5c8-2867-4020-8a66-c14cc8427790/downloadf8e02f37010c5a38b4b7747b169de886MD53THUMBNAILDiagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar.pdf.jpgDiagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg18706https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/e6cbcb10-ff98-47dd-9ab6-6a3b1ec07c84/download8395c776e8f7e9b805c8b2f25c02d597MD5420.500.14143/40205oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/402052023-11-29 17:26:08.456https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Derechos Reservados - Universidad de Antioquia, 2021restrictedhttps://repositorio.minciencias.gov.coRepositorio Institucional de Mincienciascendoc@minciencias.gov.co