Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum.
Este proyecto se enfocó en el aislamiento, secuenciación, ensamble, anotación y análisis del genoma de un aislado colombiano de Cryptosporidium. Inicialmente se intento en varias oportunidades aislar el parásito in vitro en las líneas celulares MDCK y VERO son obtener resultados positivos. Un poster...
- Autores:
-
Alzate Restrepo, Juan Fernando
- Tipo de recurso:
- Investigation report
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
- Repositorio:
- Repositorio Minciencias
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/38677
- Acceso en línea:
- https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38677
http://colciencias.metabiblioteca.com.co
- Palabra clave:
- Genomas
Genética
Genómica
Parásito protozoo
Anotación Genomica
Bioinformática
Criptosporidium parvum
Genomica comparativa
Pirosecuenciamiento de alto rendimiento
- Rights
- openAccess
- License
- http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
id |
RCENDOC_5b02d0f4cd19522a8ea7af4a9d4ca2a8 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/38677 |
network_acronym_str |
RCENDOC |
network_name_str |
Repositorio Minciencias |
repository_id_str |
|
spelling |
Alzate Restrepo, Juan Fernandoc7701ab9c0ea94f9f7f10471fe3c8f68-1Universidad de Antioquia (Colombia)COL0007506 - Grupo de ParasitologíaCOL0007865 - Biología y control de enfermedades infecciosasColombia2011-20142019-09-14T15:51:55Z2020-12-17T23:11:24Z2019-09-14T15:51:55Z2020-12-17T23:11:24Z2014-05https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38677ColcienciasRepositorio Colcienciashttp://colciencias.metabiblioteca.com.coEste proyecto se enfocó en el aislamiento, secuenciación, ensamble, anotación y análisis del genoma de un aislado colombiano de Cryptosporidium. Inicialmente se intento en varias oportunidades aislar el parásito in vitro en las líneas celulares MDCK y VERO son obtener resultados positivos. Un posterior intento en la línea celular humana HCT-8 permitió detectar la infección exitosa en estas, sin embargo se tuvieron un problemas masivos de contaminación que obligaron al descarte de dichos cultivos. Como alternativa se decidió aislar el parásito directamente de heces de una humano parasitado. Los ooquistes parcialmente purificados sirvieron de fuente de biomasa para extraer DNA genómico de parásito. (Apartes del texto).55 páginas.spaInforme;Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum.Informe de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_18wshttp://purl.org/coar/resource_type/c_93fcTextinfo:eu-repo/semantics/reporthttps://purl.org/redcol/resource_type/PIDinfo:eu-repo/semantics/submittedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32info:eu-repo/semantics/submittedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/GenomasGenéticaGenómicaParásito protozooAnotación GenomicaBioinformáticaCriptosporidium parvumGenomica comparativaPirosecuenciamiento de alto rendimientoEstudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.111551928843199-2010Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] ColcienciasPrograma Nacional de CTeI en SaludObjetivo General : Secuenciar el genoma de un aislado colombiano de Cryptosporidium parvumObjetivos especificos : 1. Aislar In vitro una cepa humana de Criptosporidium parvum de un paciente colombiano.Objetivos especificos : 2. Secuenciar el genoma del aislado colombiano de Criptosporidium parvumObjetivos especificos : 3. Anotar el genoma del aislado colombiano de Criptosporidium parvumObjetivos especificos : 4. Describir las características generales de los genes del aislado colombiano deCriptosporidium parvumObjetivos especificos : 5. Comparar el genoma del aislado colombiano de Cryptosporidium parvum con los genomas descritos de Cryptosporidium.PublicationORIGINAL111551928843 20142430096012-3.pdf111551928843 20142430096012-3.pdfInforme finalapplication/pdf14660952https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/59c08c6b-2eef-45c5-ba1b-5f3f56fa9851/download0b3c5450148dffb34e455570692c273aMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814798https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/4aa13057-4479-424d-851f-a3ee258f16c9/download88794144ff048353b359a3174871b0d5MD52license.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-80https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/deb8f584-855b-4c2f-9275-d3d249d3787f/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD55TEXT111551928843 20142430096012-3.pdf.txt111551928843 20142430096012-3.pdf.txtExtracted texttext/plain55https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/5090e181-5253-4e9a-bb36-a15d2ec3f6b4/download0ead97509bb43526a158e84c540d1c3eMD53THUMBNAIL111551928843 20142430096012-3.pdf.jpg111551928843 20142430096012-3.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg8822https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/147335e5-db20-40a0-a25b-29f4ce112365/download3b31e14be12e159d2732a6a9eb2322d5MD5420.500.14143/38677oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/386772023-11-29 17:37:50.982restrictedhttps://repositorio.minciencias.gov.coRepositorio Institucional de Mincienciascendoc@minciencias.gov.co |
dc.title.spa.fl_str_mv |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. |
title |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. |
spellingShingle |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. Genomas Genética Genómica Parásito protozoo Anotación Genomica Bioinformática Criptosporidium parvum Genomica comparativa Pirosecuenciamiento de alto rendimiento |
title_short |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. |
title_full |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. |
title_fullStr |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. |
title_full_unstemmed |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. |
title_sort |
Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum. |
dc.creator.fl_str_mv |
Alzate Restrepo, Juan Fernando |
dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Alzate Restrepo, Juan Fernando |
dc.contributor.corporatename.spa.fl_str_mv |
Universidad de Antioquia (Colombia) |
dc.contributor.researchgroup.none.fl_str_mv |
COL0007506 - Grupo de Parasitología COL0007865 - Biología y control de enfermedades infecciosas |
dc.subject.armarc.none.fl_str_mv |
Genomas Genética Genómica |
topic |
Genomas Genética Genómica Parásito protozoo Anotación Genomica Bioinformática Criptosporidium parvum Genomica comparativa Pirosecuenciamiento de alto rendimiento |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Parásito protozoo Anotación Genomica Bioinformática Criptosporidium parvum Genomica comparativa Pirosecuenciamiento de alto rendimiento |
description |
Este proyecto se enfocó en el aislamiento, secuenciación, ensamble, anotación y análisis del genoma de un aislado colombiano de Cryptosporidium. Inicialmente se intento en varias oportunidades aislar el parásito in vitro en las líneas celulares MDCK y VERO son obtener resultados positivos. Un posterior intento en la línea celular humana HCT-8 permitió detectar la infección exitosa en estas, sin embargo se tuvieron un problemas masivos de contaminación que obligaron al descarte de dichos cultivos. Como alternativa se decidió aislar el parásito directamente de heces de una humano parasitado. Los ooquistes parcialmente purificados sirvieron de fuente de biomasa para extraer DNA genómico de parásito. (Apartes del texto). |
publishDate |
2014 |
dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2014-05 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2019-09-14T15:51:55Z 2020-12-17T23:11:24Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2019-09-14T15:51:55Z 2020-12-17T23:11:24Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Informe de investigación |
dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_93fc |
dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/report |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
https://purl.org/redcol/resource_type/PID |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/submittedVersion http://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32 info:eu-repo/semantics/submittedVersion |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws |
status_str |
submittedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38677 |
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv |
Colciencias |
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv |
Repositorio Colciencias |
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv |
http://colciencias.metabiblioteca.com.co |
url |
https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38677 http://colciencias.metabiblioteca.com.co |
identifier_str_mv |
Colciencias Repositorio Colciencias |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.ispartofseries.none.fl_str_mv |
Informe; |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
dc.format.extent.spa.fl_str_mv |
55 páginas. |
dc.coverage.spatial.none.fl_str_mv |
Colombia |
dc.coverage.projectdates.spa.fl_str_mv |
2011-2014 |
institution |
Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/59c08c6b-2eef-45c5-ba1b-5f3f56fa9851/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/4aa13057-4479-424d-851f-a3ee258f16c9/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/deb8f584-855b-4c2f-9275-d3d249d3787f/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/5090e181-5253-4e9a-bb36-a15d2ec3f6b4/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/147335e5-db20-40a0-a25b-29f4ce112365/download |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
0b3c5450148dffb34e455570692c273a 88794144ff048353b359a3174871b0d5 d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e 0ead97509bb43526a158e84c540d1c3e 3b31e14be12e159d2732a6a9eb2322d5 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional de Minciencias |
repository.mail.fl_str_mv |
cendoc@minciencias.gov.co |
_version_ |
1811305885548412928 |