Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum.

Este proyecto se enfocó en el aislamiento, secuenciación, ensamble, anotación y análisis del genoma de un aislado colombiano de Cryptosporidium. Inicialmente se intento en varias oportunidades aislar el parásito in vitro en las líneas celulares MDCK y VERO son obtener resultados positivos. Un poster...

Full description

Autores:
Alzate Restrepo, Juan Fernando
Tipo de recurso:
Investigation report
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Minciencias
Repositorio:
Repositorio Minciencias
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/38677
Acceso en línea:
https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38677
http://colciencias.metabiblioteca.com.co
Palabra clave:
Genomas
Genética
Genómica
Parásito protozoo
Anotación Genomica
Bioinformática
Criptosporidium parvum
Genomica comparativa
Pirosecuenciamiento de alto rendimiento
Rights
openAccess
License
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
Description
Summary:Este proyecto se enfocó en el aislamiento, secuenciación, ensamble, anotación y análisis del genoma de un aislado colombiano de Cryptosporidium. Inicialmente se intento en varias oportunidades aislar el parásito in vitro en las líneas celulares MDCK y VERO son obtener resultados positivos. Un posterior intento en la línea celular humana HCT-8 permitió detectar la infección exitosa en estas, sin embargo se tuvieron un problemas masivos de contaminación que obligaron al descarte de dichos cultivos. Como alternativa se decidió aislar el parásito directamente de heces de una humano parasitado. Los ooquistes parcialmente purificados sirvieron de fuente de biomasa para extraer DNA genómico de parásito. (Apartes del texto).