Secuenciamiento y anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum.

Este proyecto se enfocó en el aislamiento, secuenciación, ensamble, anotación y análisis del genoma de un aislado colombiano de Cryptosporidium. Inicialmente se intento en varias oportunidades aislar el parásito in vitro en las líneas celulares MDCK y VERO son obtener resultados positivos. Un posterior intento en la línea celular humana HCT-8 permitió detectar la infección exitosa en estas, sin embargo se tuvieron un problemas masivos de contaminación que obligaron al descarte de dichos cultivos. Como alternativa se decidió aislar el parásito directamente de heces de una humano parasitado. Los ooquistes parcialmente purificados sirvieron de fuente de biomasa para extraer DNA genómico de parásito. (Apartes del texto).

• Autores: Alzate Restrepo, Juan Fernando
• Tipo de recurso: Investigation report
• Fecha de publicación: 2014
• Institución: Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
• Repositorio: Repositorio Minciencias
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/38677
• Acceso en línea: https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/38677; http://colciencias.metabiblioteca.com.co
• Palabra clave: Genomas; Genética; Genómica; Parásito protozoo; Anotación Genomica; Bioinformática; Criptosporidium parvum; Genomica comparativa; Pirosecuenciamiento de alto rendimiento
• Rights: openAccess
• License: http://purl.org/coar/access_right/c_abf2