Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection.
Las vacunas son el medio de prevención de enfermedades infecciosas más extraordinario descubierto por el hombre. Y aunque esta estrategia ha llevado a la erradicación o reducción sustancial en la incidencia de muchas enfermedades, todavía no hay vacunas efectivas contra la malaria, la tuberculosis,...
- Autores:
-
Ramírez Pineda, José Robinson
- Tipo de recurso:
- Investigation report
- Fecha de publicación:
- 2016
- Institución:
- Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
- Repositorio:
- Repositorio Minciencias
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/39898
- Acceso en línea:
- https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39898
http://colciencias.metabiblioteca.com.co
- Palabra clave:
- Bioinformática
Descubrimiento de vacunas
Infecciones intracelulares
Proteómica
- Rights
- openAccess
- License
- http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
id |
RCENDOC_38bf6c4ec6f569bef876c0bc185a7d87 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/39898 |
network_acronym_str |
RCENDOC |
network_name_str |
Repositorio Minciencias |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. |
title |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. |
spellingShingle |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. Bioinformática Descubrimiento de vacunas Infecciones intracelulares Proteómica |
title_short |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. |
title_full |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. |
title_fullStr |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. |
title_full_unstemmed |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. |
title_sort |
Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection. |
dc.creator.fl_str_mv |
Ramírez Pineda, José Robinson |
dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Ramírez Pineda, José Robinson |
dc.contributor.corporatename.spa.fl_str_mv |
Universidad de Antioquia (Colombia) |
dc.contributor.researchgroup.none.fl_str_mv |
COL0007462 - Grupo interdisciplinario de estudios moleculares, GIEM COL0007506 - Grupo interdisciplinario para la investigación de parasitosis intestinales COL0007865 - Grupo de biología y control de enfermedades infecciones, BCI COL0038389 - Grupo de Inmunomodulación, GIM |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Bioinformática Descubrimiento de vacunas Infecciones intracelulares Proteómica |
topic |
Bioinformática Descubrimiento de vacunas Infecciones intracelulares Proteómica |
description |
Las vacunas son el medio de prevención de enfermedades infecciosas más extraordinario descubierto por el hombre. Y aunque esta estrategia ha llevado a la erradicación o reducción sustancial en la incidencia de muchas enfermedades, todavía no hay vacunas efectivas contra la malaria, la tuberculosis, el SIDA o la leishmaniasis, enfermedades que matan o debilitan millones de personas anualmente en todo el mundo. La leishmaniasis, una enfermedad parasitaria fuertemente asociada a la pobreza y declarada como ignorada o desatendida (""neglected"") en general por la sociedad, representa actualmente una reto de gran magnitud para las entidades de salud pública internacional y para los gobiernos de los países en desarrollo y subdesarrollados. En Colombia la leishmaniasis es un gran problema de salud que afecta sectores marginados y asociados a los diversos conflictos sociales, como lo prueba su gran incidencia en por ejemplo poblaciones desplazadas, secuestradas o en las fuerzas militares. El desarrollo de una vacuna efectiva contra esta enfermedad sería sin duda un gran avance que evitaría o aliviaría el sufrimiento de muchas personas en Colombia y demás países endémicos. Basados en la experiencia clínico-epidemiológica y experimental, los expertos coinciden en que es posible desarrollar una vacuna efectiva contra la leishmaniasis. Los impresionantes avances científicos de los últimos años en áreas como la Inmunología, parecieran estar iluminando la esperanza de desarrollar estas vacunas tan necesitadas y hasta ahora, tan elusivas. En particular, el descubrimiento de los receptores del sistema inmune innato, y de su importante papel como puente que inicia e instruye la respuesta inmune específica, está abriendo la posibilidad de desarrollar vacunas sobre las bases de un ""diseño racional"". Se han logrado purificar ligandos de dichos receptores e inclusive sintetizarlos químicamente y demostrar que pueden ser explotados para inmunoterapias o como adyuvantes de vacunas. Por ejemplo, oligonucleótidos conteniendo secuencias CpGs están disponibles en la actualidad de manera sintética y funcionan como potentes agonistas del receptor tipo Toll (TLR) 9, el cual dispara vías de señalización que llevan a la estimulación de la respuesta inmune celular de tipo Th1 y de linfocitos citotóxicos, es decir, justo la que se requiere inducir para proteger contra patógenos intracelulares como Leishmania. Esto ha motivado a muchas compañías e instituciones a desarrollar terapias y vacunas basadas en CpGs. En un modelo murino de leishmaniasis cutánea por Leishmania panamensis recientemente desarrollado en nuestro laboratorio, encontramos que los CpG funcionan como potentes adyuvantes celulares, que en combinación con lisado total de parásitos son capaces de proteger contra un reto infectivo. Como no es posible en la actualidad considerar una vacuna formada por lisado total de parásitos para uso en humanos, nosotros nos proponemos con este proyecto iniciar la búsqueda de los antígenos que median el efecto protector de dicha preparación. Por medio de una estrategia informática con posterior confirmación empírica ex vivo, identificaremos los Ag reconocidos por los linfocitos T CD8+ presentes en los ratones inmunes. Por su parte, los Ag reconocidos por los linfocitos T CD4+ serán identificados a través de una estrategia inmunoproteómica-informática. Los Ag así identificados serán clonados del genoma de L. braziliensis (especie cercana a L. panamensis y de la cual se publico la secuencia de su genoma), producidos como proteínas recombinantes y formulados con CpG a manera de una vacuna molecularmente definida, que será finalmente evaluada en el modelo murino de L. panamensis. El desarrollo exitoso de este proyecto podría generar posibles candidatos a vacunas contra la leishmaniasis humana a partir de los Ag identificados. Utilizando una estrategia similar con muestras de humanos inmunes, en el futuro podrían descubrirse más candidatos promisorios. |
publishDate |
2016 |
dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2016-11 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2020-01-15T17:31:30Z 2020-12-18T01:07:52Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2020-01-15T17:31:30Z 2020-12-18T01:07:52Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Informe de investigación |
dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_93fc |
dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/report |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
https://purl.org/redcol/resource_type/PID |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/submittedVersion http://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32 info:eu-repo/semantics/submittedVersion |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws |
status_str |
submittedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39898 |
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv |
Colciencias |
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv |
Repositorio Colciencias |
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv |
http://colciencias.metabiblioteca.com.co |
url |
https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39898 http://colciencias.metabiblioteca.com.co |
identifier_str_mv |
Colciencias Repositorio Colciencias |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.ispartofseries.none.fl_str_mv |
Informe; |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
dc.format.extent.spa.fl_str_mv |
93 páginas. |
dc.coverage.projectdates.spa.fl_str_mv |
2011-2016 |
institution |
Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/f1a39c90-976d-483d-bce0-7e25df2d9b00/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/fdd355fc-5fcb-421c-9abc-ab05494c694b/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/d0c4cadd-299c-46dc-a42a-c01213c430ec/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/67670f96-45c1-4c4a-874c-daee9a168905/download https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/d68eb439-07f1-4b9c-ae3f-eb0b7a9ed3ee/download |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
d18ce57254408ec6cd3ed36e47394fc6 8ffe28672ea88fddc177fe365a489039 d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e 52ae4c5cad6994c4a2529a609bf642b9 c0f8aa6a32b7c15367ba6e9c4777bbfe |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional de Minciencias |
repository.mail.fl_str_mv |
cendoc@minciencias.gov.co |
_version_ |
1811305897108963328 |
spelling |
Ramírez Pineda, José Robinson0b8c4d0c14fbd9b2b3b51e4ea86dc8b3-1Universidad de Antioquia (Colombia)COL0007462 - Grupo interdisciplinario de estudios moleculares, GIEMCOL0007506 - Grupo interdisciplinario para la investigación de parasitosis intestinalesCOL0007865 - Grupo de biología y control de enfermedades infecciones, BCICOL0038389 - Grupo de Inmunomodulación, GIM2020-01-15T17:31:30Z2020-12-18T01:07:52Z2020-01-15T17:31:30Z2020-12-18T01:07:52Z2016-11https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39898ColcienciasRepositorio Colcienciashttp://colciencias.metabiblioteca.com.coLas vacunas son el medio de prevención de enfermedades infecciosas más extraordinario descubierto por el hombre. Y aunque esta estrategia ha llevado a la erradicación o reducción sustancial en la incidencia de muchas enfermedades, todavía no hay vacunas efectivas contra la malaria, la tuberculosis, el SIDA o la leishmaniasis, enfermedades que matan o debilitan millones de personas anualmente en todo el mundo. La leishmaniasis, una enfermedad parasitaria fuertemente asociada a la pobreza y declarada como ignorada o desatendida (""neglected"") en general por la sociedad, representa actualmente una reto de gran magnitud para las entidades de salud pública internacional y para los gobiernos de los países en desarrollo y subdesarrollados. En Colombia la leishmaniasis es un gran problema de salud que afecta sectores marginados y asociados a los diversos conflictos sociales, como lo prueba su gran incidencia en por ejemplo poblaciones desplazadas, secuestradas o en las fuerzas militares. El desarrollo de una vacuna efectiva contra esta enfermedad sería sin duda un gran avance que evitaría o aliviaría el sufrimiento de muchas personas en Colombia y demás países endémicos. Basados en la experiencia clínico-epidemiológica y experimental, los expertos coinciden en que es posible desarrollar una vacuna efectiva contra la leishmaniasis. Los impresionantes avances científicos de los últimos años en áreas como la Inmunología, parecieran estar iluminando la esperanza de desarrollar estas vacunas tan necesitadas y hasta ahora, tan elusivas. En particular, el descubrimiento de los receptores del sistema inmune innato, y de su importante papel como puente que inicia e instruye la respuesta inmune específica, está abriendo la posibilidad de desarrollar vacunas sobre las bases de un ""diseño racional"". Se han logrado purificar ligandos de dichos receptores e inclusive sintetizarlos químicamente y demostrar que pueden ser explotados para inmunoterapias o como adyuvantes de vacunas. Por ejemplo, oligonucleótidos conteniendo secuencias CpGs están disponibles en la actualidad de manera sintética y funcionan como potentes agonistas del receptor tipo Toll (TLR) 9, el cual dispara vías de señalización que llevan a la estimulación de la respuesta inmune celular de tipo Th1 y de linfocitos citotóxicos, es decir, justo la que se requiere inducir para proteger contra patógenos intracelulares como Leishmania. Esto ha motivado a muchas compañías e instituciones a desarrollar terapias y vacunas basadas en CpGs. En un modelo murino de leishmaniasis cutánea por Leishmania panamensis recientemente desarrollado en nuestro laboratorio, encontramos que los CpG funcionan como potentes adyuvantes celulares, que en combinación con lisado total de parásitos son capaces de proteger contra un reto infectivo. Como no es posible en la actualidad considerar una vacuna formada por lisado total de parásitos para uso en humanos, nosotros nos proponemos con este proyecto iniciar la búsqueda de los antígenos que median el efecto protector de dicha preparación. Por medio de una estrategia informática con posterior confirmación empírica ex vivo, identificaremos los Ag reconocidos por los linfocitos T CD8+ presentes en los ratones inmunes. Por su parte, los Ag reconocidos por los linfocitos T CD4+ serán identificados a través de una estrategia inmunoproteómica-informática. Los Ag así identificados serán clonados del genoma de L. braziliensis (especie cercana a L. panamensis y de la cual se publico la secuencia de su genoma), producidos como proteínas recombinantes y formulados con CpG a manera de una vacuna molecularmente definida, que será finalmente evaluada en el modelo murino de L. panamensis. El desarrollo exitoso de este proyecto podría generar posibles candidatos a vacunas contra la leishmaniasis humana a partir de los Ag identificados. Utilizando una estrategia similar con muestras de humanos inmunes, en el futuro podrían descubrirse más candidatos promisorios.93 páginas.spaInforme;Combinig bioinformatics and proteomics to discover novel molecularly-defined vaccine candidates for intracellular infection.Informe de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_18wshttp://purl.org/coar/resource_type/c_93fcTextinfo:eu-repo/semantics/reporthttps://purl.org/redcol/resource_type/PIDinfo:eu-repo/semantics/submittedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32info:eu-repo/semantics/submittedVersion2011-2016info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/BioinformáticaDescubrimiento de vacunasInfecciones intracelularesProteómicaEstudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.1115-519-29213193-2010Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] ColcienciasPrograma Nacional de CTeI en SaludCombinar herramientas bioinformáticas y proteómicas como una plataforma que permita descubrir nuevos candidatos a vacuna para la leishmaniasis cutánea por Leishmania (Viannia) panamensis. Objetivos específicos : Aplicar herramientas bioinformáticas que permitan identificar, del genoma completo de Leishmania braziliensis, epítopes que unan moléculas MHC clase I. Establecer un ensayo de reestimulación ex vivo que permita validar los epítopes previamente identificados vía bioinformática. Caracterizar el inmunoproteoma de L. panamensis con el fin de identificar proteínas inmunogénicas reconocidas por anticuerpos tipo IgG2a de ratones inmunes. Clonar y producir como proteínas recombinantes los antígenos más inmunogénicos identificados (que contienen epítopes T CD8 y epítopes B tipo IgG2a). Formular una vacuna modelo molecularmente definida que contiene antígenos(s) recombinantes (s) y un adyuvante celular. Evaluar la inmunogenicidad de la vacuna. Probar in vivo la eficacia protectora de la vacuna en un modelo animal de leishmaniasis por L. panamensis.PublicationORIGINALCopia de 111551929213.pdfCopia de 111551929213.pdfInforme finalapplication/pdf55748315https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/f1a39c90-976d-483d-bce0-7e25df2d9b00/downloadd18ce57254408ec6cd3ed36e47394fc6MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814800https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/fdd355fc-5fcb-421c-9abc-ab05494c694b/download8ffe28672ea88fddc177fe365a489039MD52license.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-80https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/d0c4cadd-299c-46dc-a42a-c01213c430ec/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD55TEXTCopia de 111551929213.pdf.txtCopia de 111551929213.pdf.txtExtracted texttext/plain93https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/67670f96-45c1-4c4a-874c-daee9a168905/download52ae4c5cad6994c4a2529a609bf642b9MD53THUMBNAILCopia de 111551929213.pdf.jpgCopia de 111551929213.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg8309https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/d68eb439-07f1-4b9c-ae3f-eb0b7a9ed3ee/downloadc0f8aa6a32b7c15367ba6e9c4777bbfeMD5420.500.14143/39898oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/398982023-11-29 17:44:07.921restrictedhttps://repositorio.minciencias.gov.coRepositorio Institucional de Mincienciascendoc@minciencias.gov.co |