Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.

Las enfermedades conocidas como leishmaniasis afectan millones de personas en el mundo. En Colombia se reportaron más de 12000 casos en el 2009 y hasta la semana epidemiológica 19 del 2010, se han reportado más de 4400 casos . De estos casos alrededor del 99% corresponden a leishmaniasis cutánea y l...

Full description

Autores:
Ovalle Bracho, Clemencia Elena
Tipo de recurso:
Investigation report
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
Repositorio:
Repositorio Minciencias
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/40043
Acceso en línea:
https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/40043
http://colciencias.metabiblioteca.com.co
Palabra clave:
Leishmania braziliensis
Modelo celular
Plataforma de alto rendimiento
Silenciamiento genético
Tamizaje genético
Rights
openAccess
License
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
id RCENDOC_37756a07d4c634f85d9aa71810552dad
oai_identifier_str oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/40043
network_acronym_str RCENDOC
network_name_str Repositorio Minciencias
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
title Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
spellingShingle Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
Leishmania braziliensis
Modelo celular
Plataforma de alto rendimiento
Silenciamiento genético
Tamizaje genético
title_short Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
title_full Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
title_fullStr Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
title_full_unstemmed Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
title_sort Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.
dc.creator.fl_str_mv Ovalle Bracho, Clemencia Elena
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Ovalle Bracho, Clemencia Elena
dc.contributor.corporatename.spa.fl_str_mv Centro Dermatológico Federico Lleras Acosta (Bogotá, Colombia)
dc.contributor.researchgroup.none.fl_str_mv COL0048269 - Dermatología Tropical
COL0049533 - Modelamiento y control de sistemas biológicos
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Leishmania braziliensis
Modelo celular
Plataforma de alto rendimiento
Silenciamiento genético
Tamizaje genético
topic Leishmania braziliensis
Modelo celular
Plataforma de alto rendimiento
Silenciamiento genético
Tamizaje genético
description Las enfermedades conocidas como leishmaniasis afectan millones de personas en el mundo. En Colombia se reportaron más de 12000 casos en el 2009 y hasta la semana epidemiológica 19 del 2010, se han reportado más de 4400 casos . De estos casos alrededor del 99% corresponden a leishmaniasis cutánea y la fracción restante a leishmaniasis mucocutánea y visceral. Por esta razón se considera a la leishmaniasis como un problema de salud púbica en el país. Pese a esto, existe un repertorio escaso de medicamentos y tratamientos terapéuticos para la enfermedad y hay evidencia de resistencia del parásito al tratamiento más utilizado (Antimonios pentavalentes). En un contexto general de enfermedad, las estrategias utilizadas actualmente para la búsqueda de dianas terapéuticas involucran aproximaciones genómicas, proteómicas, bioinformáticas y de tamizaje fenotípico causado por compuestos químicos y moléculas pequeñas. Muchas de estas aproximaciones requieren de modelos experimentales adaptados a plataformas de tamizaje fenotípico de alto rendimiento, en los que se evalúa un gran número de compuestos de manera simultánea y eficiente para la identificación de posibles dianas terapéuticas para patologías particulares. En el caso de leishmaniasis se han utilizado algunas de estas aproximaciones, pero aún no se ha explorado de manera sistemática el efecto de la modulación genética a nivel de la célula hospedera como un mecanismo de entendimiento de su interacción con el parásito. Una comprensión extensa de la maquinaria celular hospedera necesaria para el proceso de infección por parte del parásito, brindará nuevas luces con respecto a las alternativas para el control del parásito. En este proyecto se plantea la generación y validación de un modelo celular explícitamente diseñado para facilitar la identificación sistemática de los genes del macrófago necesarios para el proceso de infección por parte de Leishmania braziliensis, en plataformas de alto rendimiento. Este modelo permitirá utilizar silenciamiento genético mediado por RNA de interferencia. El funcionamiento de los eventos de silenciamiento, podrá verificarse gracias a un gen reportero (EmGFP) expresado de manera constitutiva en el macrófago. En el marco del proyecto, el modelo será validado mediante la confirmación experimental de su habilidad para: 1. Permitir infección in vitro por parte de Leishmania braziliensis en proporciones similares a las registradas en macrófagos normales. 2. Permitir la verificación fenotípica del silenciamiento del gen reportero (EmGFP) de manera simultánea con el silenciamiento de un gen de interés (gen modelo). 3. Permitir la verificación fenotípica del efecto del silenciamiento genético, en el contexto del macrófago infectado in vitro, con Leishmania braziliensis. Esta verificación fenotípica debe ser compatible con experimentos realizados en plataformas de alto rendimiento y por lo tanto debe requerir un mínimo de manipulación experimental. El objetivo general del proyecto es: Generar un modelo celular de macrófagos para la identificación de fenotipos inducidos por silenciamiento genético con RNA de interferencia, en el contexto del macrófago infectado por L. braziliensis y validar este modelo mediante la evaluación del efecto del silenciamiento de un gen con expresión diferencial en macrófagos infectados por este parásito. Este objetivo se cumplirá mediante el desarrollo de los siguientes objetivos específicos: 1. Generar una línea celular de macrófagos con expresión constitutiva de al menos una proteína fluorescente a manera de gen reportero. Metodología: Se implementará un método de transducción lentiviral para la modificación genética de la línea celular humana U937, con el fin de generar los precursores de macrófagos con expresión constitutiva de EmGFP. Como alternativa de marcación fluorescente constitutiva, se generará una línea celular derivada de U937, con expresión de la proteína marcadora de membrana: DsRed-Monomer-Mem (DRMM). Las línea.
publishDate 2014
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2014
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2020-02-13T17:03:07Z
2020-12-18T01:22:53Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2020-02-13T17:03:07Z
2020-12-18T01:22:53Z
dc.type.spa.fl_str_mv Informe de investigación
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_93fc
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/report
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/PID
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/submittedVersion
http://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32
info:eu-repo/semantics/submittedVersion
format http://purl.org/coar/resource_type/c_18ws
status_str submittedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/40043
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv Colciencias
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv Repositorio Colciencias
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv http://colciencias.metabiblioteca.com.co
url https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/40043
http://colciencias.metabiblioteca.com.co
identifier_str_mv Colciencias
Repositorio Colciencias
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartofseries.none.fl_str_mv Informe;
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 20 páginas.
dc.coverage.spatial.none.fl_str_mv Colombia
institution Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/a232db95-e2bf-42aa-ab6c-4ecf389fb020/download
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/9b3bafce-6315-4f44-8da5-333fcc751a15/download
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/a21d2548-3075-4645-8390-d819e2b7d0d3/download
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/075369df-7beb-49e5-a130-be1d79393bb4/download
https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/8d2a5e24-5a47-4851-a2a0-aaa3f09f27eb/download
bitstream.checksum.fl_str_mv a95e55ddf22e9adbc64e583c63ccbbb3
8ffe28672ea88fddc177fe365a489039
d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e
4d2e38c48c39eebf43fd2162ffceedf7
3cff653fc188baabd1ed3c5fd236a46d
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional de Minciencias
repository.mail.fl_str_mv cendoc@minciencias.gov.co
_version_ 1811305894000984064
spelling Ovalle Bracho, Clemencia Elena31235827b787496ce5d586dd23df7317-1Centro Dermatológico Federico Lleras Acosta (Bogotá, Colombia)COL0048269 - Dermatología TropicalCOL0049533 - Modelamiento y control de sistemas biológicosColombia2020-02-13T17:03:07Z2020-12-18T01:22:53Z2020-02-13T17:03:07Z2020-12-18T01:22:53Z2014https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/40043ColcienciasRepositorio Colcienciashttp://colciencias.metabiblioteca.com.coLas enfermedades conocidas como leishmaniasis afectan millones de personas en el mundo. En Colombia se reportaron más de 12000 casos en el 2009 y hasta la semana epidemiológica 19 del 2010, se han reportado más de 4400 casos . De estos casos alrededor del 99% corresponden a leishmaniasis cutánea y la fracción restante a leishmaniasis mucocutánea y visceral. Por esta razón se considera a la leishmaniasis como un problema de salud púbica en el país. Pese a esto, existe un repertorio escaso de medicamentos y tratamientos terapéuticos para la enfermedad y hay evidencia de resistencia del parásito al tratamiento más utilizado (Antimonios pentavalentes). En un contexto general de enfermedad, las estrategias utilizadas actualmente para la búsqueda de dianas terapéuticas involucran aproximaciones genómicas, proteómicas, bioinformáticas y de tamizaje fenotípico causado por compuestos químicos y moléculas pequeñas. Muchas de estas aproximaciones requieren de modelos experimentales adaptados a plataformas de tamizaje fenotípico de alto rendimiento, en los que se evalúa un gran número de compuestos de manera simultánea y eficiente para la identificación de posibles dianas terapéuticas para patologías particulares. En el caso de leishmaniasis se han utilizado algunas de estas aproximaciones, pero aún no se ha explorado de manera sistemática el efecto de la modulación genética a nivel de la célula hospedera como un mecanismo de entendimiento de su interacción con el parásito. Una comprensión extensa de la maquinaria celular hospedera necesaria para el proceso de infección por parte del parásito, brindará nuevas luces con respecto a las alternativas para el control del parásito. En este proyecto se plantea la generación y validación de un modelo celular explícitamente diseñado para facilitar la identificación sistemática de los genes del macrófago necesarios para el proceso de infección por parte de Leishmania braziliensis, en plataformas de alto rendimiento. Este modelo permitirá utilizar silenciamiento genético mediado por RNA de interferencia. El funcionamiento de los eventos de silenciamiento, podrá verificarse gracias a un gen reportero (EmGFP) expresado de manera constitutiva en el macrófago. En el marco del proyecto, el modelo será validado mediante la confirmación experimental de su habilidad para: 1. Permitir infección in vitro por parte de Leishmania braziliensis en proporciones similares a las registradas en macrófagos normales. 2. Permitir la verificación fenotípica del silenciamiento del gen reportero (EmGFP) de manera simultánea con el silenciamiento de un gen de interés (gen modelo). 3. Permitir la verificación fenotípica del efecto del silenciamiento genético, en el contexto del macrófago infectado in vitro, con Leishmania braziliensis. Esta verificación fenotípica debe ser compatible con experimentos realizados en plataformas de alto rendimiento y por lo tanto debe requerir un mínimo de manipulación experimental. El objetivo general del proyecto es: Generar un modelo celular de macrófagos para la identificación de fenotipos inducidos por silenciamiento genético con RNA de interferencia, en el contexto del macrófago infectado por L. braziliensis y validar este modelo mediante la evaluación del efecto del silenciamiento de un gen con expresión diferencial en macrófagos infectados por este parásito. Este objetivo se cumplirá mediante el desarrollo de los siguientes objetivos específicos: 1. Generar una línea celular de macrófagos con expresión constitutiva de al menos una proteína fluorescente a manera de gen reportero. Metodología: Se implementará un método de transducción lentiviral para la modificación genética de la línea celular humana U937, con el fin de generar los precursores de macrófagos con expresión constitutiva de EmGFP. Como alternativa de marcación fluorescente constitutiva, se generará una línea celular derivada de U937, con expresión de la proteína marcadora de membrana: DsRed-Monomer-Mem (DRMM). Las línea.20 páginas.spaInforme;Generación y validación de un modelo celular diseñado para el tamizaje genético mediante RNA de interferencia en el complejo macrófago infectado por L. braziliensis.Informe de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_18wshttp://purl.org/coar/resource_type/c_93fcTextinfo:eu-repo/semantics/reporthttps://purl.org/redcol/resource_type/PIDinfo:eu-repo/semantics/submittedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32info:eu-repo/semantics/submittedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/Leishmania braziliensisModelo celularPlataforma de alto rendimientoSilenciamiento genéticoTamizaje genético212051928534314-2010Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] ColcienciasPrograma Nacional de CTeI en SaludGenerar un modelo celular de macrófagos para la identificación de fenotipos inducidos por silenciamiento genético con RNA de interferencia, en el contexto del macrófago infectado por L. braziliensis y validar este modelo mediante la evaluación del efecto del silenciamiento de un gen con expresión diferencial en macrófagos infectados por este parásito.PublicationORIGINAL212051928534.pdf212051928534.pdfInforme finalapplication/pdf6908491https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/a232db95-e2bf-42aa-ab6c-4ecf389fb020/downloada95e55ddf22e9adbc64e583c63ccbbb3MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814800https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/9b3bafce-6315-4f44-8da5-333fcc751a15/download8ffe28672ea88fddc177fe365a489039MD52license.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-80https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/a21d2548-3075-4645-8390-d819e2b7d0d3/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD55TEXT212051928534.pdf.txt212051928534.pdf.txtExtracted texttext/plain20https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/075369df-7beb-49e5-a130-be1d79393bb4/download4d2e38c48c39eebf43fd2162ffceedf7MD53THUMBNAIL212051928534.pdf.jpg212051928534.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg12275https://repositorio.minciencias.gov.co/bitstreams/8d2a5e24-5a47-4851-a2a0-aaa3f09f27eb/download3cff653fc188baabd1ed3c5fd236a46dMD5420.500.14143/40043oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/400432023-11-29 17:42:16.645restrictedhttps://repositorio.minciencias.gov.coRepositorio Institucional de Mincienciascendoc@minciencias.gov.co