Evaluación de genes candidatos en familias Antioqueñas con Diabetes Mellitus tipo 1.
La diabetes mellitus tipo 1 (T1D) es un desorden clínicamente severo y genéticamente heterogéneo. El modo de herencia en T1D es desconocido y se ha confirmado que un patrón multifactorial (poligénico y ambiental) es el modelo que más se ajusta a este desorden. La identificación de loci de susceptibi...
- Autores:
-
Alfaro Velásquez, Juan Manuel
- Tipo de recurso:
- Investigation report
- Fecha de publicación:
- 2012
- Institución:
- Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación
- Repositorio:
- Repositorio Minciencias
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.minciencias.gov.co:20.500.14143/40227
- Acceso en línea:
- https://repositorio.minciencias.gov.co/handle/20.500.14143/40227
- Palabra clave:
- Diabetes Mellitus tipo 1
Genes
Mapeo genético
Variantes genéticas
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- Derechos Reservados - Universidad de Antioquia, 2021
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La diabetes mellitus tipo 1 (T1D) es un desorden clínicamente severo y genéticamente heterogéneo. El modo de herencia en T1D es desconocido y se ha confirmado que un patrón multifactorial (poligénico y ambiental) es el modelo que más se ajusta a este desorden. La identificación de loci de susceptibilidad/resistencia a T1D ha sido especialmente complicada por la alta heterogeneidad genética y los bajos niveles de susceptibilidad aportados por la mayoría de los loci involucrados. Se ha propuesto que poblaciones genéticamente especiales pueden ser de gran utilidad en la tarea de identificar los loci de susceptibilidad para este desorden, aún aquellos que aportan un bajo riesgo relativo. A pesar de que se han identificado aproximadamente 20 loci genéticos asociados con la susceptibilidad de T1D, sólo ocho de ellos han sido consistentemente asociados con la enfermedad. Se trata de HLA (IDDM1), INS (IDDM2), CTLA4 (IDDM12), PTPN22, CD25 (IDDM10), IFIH1/MDA5, KIAA0350 y SUMO4 (IDDM5). Aunque en varios estudios en diferentes poblaciones los resultados han sido consistentes en cuanto a la participación de estos genes/loci, muy poco se sabe sobre la caracterización genética de este desorden en nuestro país. En el presente estudio nos proponemos caracterizar genéticamente un grupo de doscientos Trios familiares (padres-hijo afectado) con la enfermedad. Todas estas familias son de ascendencia "paisa". En Antioquia se han documentado evidencias que sugieren que su población corresponde a un aislado genético presentando fuentes de desequilibrio de ligamiento [1, 2], y efectos fundadores [3-5] que la hacen óptima para mapear características de herencia compleja, tales como T1D. La evaluación genética consistirá en tipificar varios SNPs, mediante la técnica PCR-RFLP, en cada uno de los genes/loci asociados consistentemente con la enfermedad y en examinar si existen alelos o haplotipos preferencialmente transmitidos a los hijos afectados. Si se encuentra asociación a alguno de estos genes/loci pero sin involucrar la variante asociada en previos estudios, entonces se re-secuenciará el gen/locus involucrado en busca de nuevas variantes de susceptibilidad. También se evaluará si las madres o los padres transmiten con mayor frecuencia los alelos de susceptibilidad (imprinting). Más aún, como una forma de aglutinar la información genética reunida, se evaluará el consolidado en la susceptibilidad conferida por estos loci/genes en conjunto, en nuestra muestra. Este estudio es importante por al menos tres razones. La primera es que involucra un tamaño de muestra suficientemente grande y homogénea (por origen geográfico) para detectar riesgos relativos considerablemente bajos, lo cual permitirá juzgar si los loci propuestos presentan un aporte a la enfermedad en la población Antioqueña o no. Este estudio también reviste importancia porque representará el inicio de una aproximación de epidemiología genética que pretende evaluar la frecuencia en la población general de las variantes de riesgo, con posibles implicaciones en otras regiones colombianas. Y tercero, porque permitirá la evaluación del grado de heterogeneidad genética de este desorden en Antioquia, una población con características genéticas especiales. |
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Se ha propuesto que poblaciones genéticamente especiales pueden ser de gran utilidad en la tarea de identificar los loci de susceptibilidad para este desorden, aún aquellos que aportan un bajo riesgo relativo. A pesar de que se han identificado aproximadamente 20 loci genéticos asociados con la susceptibilidad de T1D, sólo ocho de ellos han sido consistentemente asociados con la enfermedad. Se trata de HLA (IDDM1), INS (IDDM2), CTLA4 (IDDM12), PTPN22, CD25 (IDDM10), IFIH1/MDA5, KIAA0350 y SUMO4 (IDDM5). Aunque en varios estudios en diferentes poblaciones los resultados han sido consistentes en cuanto a la participación de estos genes/loci, muy poco se sabe sobre la caracterización genética de este desorden en nuestro país. En el presente estudio nos proponemos caracterizar genéticamente un grupo de doscientos Trios familiares (padres-hijo afectado) con la enfermedad. Todas estas familias son de ascendencia "paisa". En Antioquia se han documentado evidencias que sugieren que su población corresponde a un aislado genético presentando fuentes de desequilibrio de ligamiento [1, 2], y efectos fundadores [3-5] que la hacen óptima para mapear características de herencia compleja, tales como T1D. La evaluación genética consistirá en tipificar varios SNPs, mediante la técnica PCR-RFLP, en cada uno de los genes/loci asociados consistentemente con la enfermedad y en examinar si existen alelos o haplotipos preferencialmente transmitidos a los hijos afectados. Si se encuentra asociación a alguno de estos genes/loci pero sin involucrar la variante asociada en previos estudios, entonces se re-secuenciará el gen/locus involucrado en busca de nuevas variantes de susceptibilidad. También se evaluará si las madres o los padres transmiten con mayor frecuencia los alelos de susceptibilidad (imprinting). Más aún, como una forma de aglutinar la información genética reunida, se evaluará el consolidado en la susceptibilidad conferida por estos loci/genes en conjunto, en nuestra muestra. Este estudio es importante por al menos tres razones. La primera es que involucra un tamaño de muestra suficientemente grande y homogénea (por origen geográfico) para detectar riesgos relativos considerablemente bajos, lo cual permitirá juzgar si los loci propuestos presentan un aporte a la enfermedad en la población Antioqueña o no. Este estudio también reviste importancia porque representará el inicio de una aproximación de epidemiología genética que pretende evaluar la frecuencia en la población general de las variantes de riesgo, con posibles implicaciones en otras regiones colombianas. 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