Estudio de las propensiones conformacionales del amino acido l-glutamato en regiones altamente estructuradas de proteínas resueltas por cristalografía de rayos x

Aunque el estudio de la conformación en biomoléculas es fundamental para el entendimiento de sus funciones biológicas, la información concerniente a estudios estructurales y conformacionales de las estructuras de macromoléculas a partir de los datos reportados experimentalmente resonancia magnética...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
masterThesis
Fecha de publicación:
2011
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/1567
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/1567
https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.1567
Palabra clave:
Aminoácidos
Biomoléculas
Maestría en biología - Tesis y disertaciones académicas
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openAccess
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description Aunque el estudio de la conformación en biomoléculas es fundamental para el entendimiento de sus funciones biológicas, la información concerniente a estudios estructurales y conformacionales de las estructuras de macromoléculas a partir de los datos reportados experimentalmente resonancia magnética nuclear (RMN) y cristalografía de rayos X (DRX) y de los estados estructurales preferenciales particularmente para proteínas y los residuos de aminoácidos que las constituyen son limitados y en muchos casos inexistentes. El estudio de aminoácidos como el L-glutamato o como el de otros compuestos requiere del conocimiento de parámetros básicos como las propiedades específicas de la molécula, las cuales constituyen la fuente de información primaria. Sin embargo, la información reportada sobre los parámetros moleculares y estructurales básicos que permitan derivar información biológica para proponer modelos de correlación estadística es escasa o en muchos casos inexistente| por lo cual se hace necesario desarrollar estudios que permitan establecer relaciones entre las variaciones de las variables internas (distancias de enlace, ángulos de enlace y ángulos diedros) de las estructuras macromoleculares y las regiones altamente estructuradasque juegan un papel importante en la función de esta. De acuerdo con lo anterior el presente trabajo consistió en el análisis estructural de los glutamatos pertenecientes a las proteínas resueltas por cristalografía de rayos X y reportadas en el banco de datos de proteínas PDB hasta Septiembre de 2009 PDB. Este estudio aplicó algoritmos matemáticos para inferir estadísticamente la relación entre las variables internas derivadas de las coordenadas atómicas reportadas experimentalmente para los glutamatos y su respectiva posición en regiones altamente estructuradas de las proteínas.
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El estudio de aminoácidos como el L-glutamato o como el de otros compuestos requiere del conocimiento de parámetros básicos como las propiedades específicas de la molécula, las cuales constituyen la fuente de información primaria. Sin embargo, la información reportada sobre los parámetros moleculares y estructurales básicos que permitan derivar información biológica para proponer modelos de correlación estadística es escasa o en muchos casos inexistente| por lo cual se hace necesario desarrollar estudios que permitan establecer relaciones entre las variaciones de las variables internas (distancias de enlace, ángulos de enlace y ángulos diedros) de las estructuras macromoleculares y las regiones altamente estructuradasque juegan un papel importante en la función de esta. De acuerdo con lo anterior el presente trabajo consistió en el análisis estructural de los glutamatos pertenecientes a las proteínas resueltas por cristalografía de rayos X y reportadas en el banco de datos de proteínas PDB hasta Septiembre de 2009 PDB. Este estudio aplicó algoritmos matemáticos para inferir estadísticamente la relación entre las variables internas derivadas de las coordenadas atómicas reportadas experimentalmente para los glutamatos y su respectiva posición en regiones altamente estructuradas de las proteínas.Magíster en Ciencias BiológicasMaestríaPontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasGonzález Santos, Janneth2012-05-22T21:02:42Z2014-10-09T02:54:03Z2016-01-13T19:38:43Z2020-04-16T19:40:23Z2012-05-22T21:02:42Z2014-10-09T02:54:03Z2016-01-13T19:38:43Z2020-04-16T19:40:23Z2011http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/1567https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.1567instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2022-04-29T19:25:54Z