Comparison of weighted low-rank approximation methods for biplot imputation in genotype-by-environment data

En este trabajo de grado se busca comparar cuatro métodos de aproximación ponderada de bajo rango y evaluar su uso como técnicas de imputación en matrices genotipo-por-ambiente. Las matrices a considerar tienen la particularidad de provenir del análisis de la interacción multiplicativa entre genotip...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
masterThesis
Fecha de publicación:
2023
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/64246
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/64246
Palabra clave:
Biplot
AMMI
Genotipo-por-ambiente
Imputación
Simulación
Low-rank
Biplot
AMMI
Genotype-by-environment
Imputation
Maestría en matemáticas - Tesis y disertaciones académicas
Simulación por computadores
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description En este trabajo de grado se busca comparar cuatro métodos de aproximación ponderada de bajo rango y evaluar su uso como técnicas de imputación en matrices genotipo-por-ambiente. Las matrices a considerar tienen la particularidad de provenir del análisis de la interacción multiplicativa entre genotipo y ambiente bajo un modelo AMMI, la cual es visualizada mediante un biplot. Para la comparación y evaluación de los métodos se hace uso de métricas de bondad de ajuste y error de predicción en un estudio de simulación con datos artificiales y reales.
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Para la comparación y evaluación de los métodos se hace uso de métricas de bondad de ajuste y error de predicción en un estudio de simulación con datos artificiales y reales.On this thesis we compare four weighted low-rank approximation methods and assess its use as imputation schemes for genotype-by-environment matrices. The matrices to be considered are obtained from the analysis of the multiplicative interaction between genotype and environment provided by an AMMI model, which is visualized by means of a biplot. For the comparison and assessment of the methods we use goodness-of-fit metrics and a prediction error in a simulation study with artificial and real datasets.Magíster en MatemáticasMaestríahttps://orcid.org/0000-0003-0374-4921https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000153112Pontificia Universidad JaverianaMaestría en MatemáticasFacultad de CienciasGarcía Peña, MarisolBorges de Araújo, LúcioAcosta Avena, Lina María2023-06-02T14:17:13Z2023-06-02T14:17:13Z2023-05-15http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/64246instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2023-06-03T08:05:26Z

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