Filogeografía comparativa de cinco taxones de felinos neotropicales (Jaguar, Panthera onca; Jaguarundi, Puma yagouaroundi; Ocelote, Leopardus pardalis; Margay, Leopardus wiedii y el complejo de especies de tigrillos; Felidae, Carnivora, Mammalia) mediante análisis del ADN mitocondrial

Los estudios con ADN para las especies de felinos silvestres del Neotrópico se han basado en números reducidos de muestras y de marcadores moleculares, en áreas geográficas específicas y en la mayoría de los casos, con muestras de animales con orígenes geográficos inciertos. En este trabajo, se anal...

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Autores:
Tipo de recurso:
doctoralThesis
Fecha de publicación:
2017
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/47109
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/47109
https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.47109
Palabra clave:
Felidae
Filogeografía
Neotrópico
Diversidad genética
ADN mitocondrial
Felidae
Mitochondrial DNA
Phylogeography
Neotropical zone
Genetic diversity
Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Diversidad biológica
Variación genética
ADN mitocondrial
Pumas
Rights
openAccess
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Comparative phylogeography of five neotropical feline taxa (Jaguar, Panthera onca; Jaguarundi, Puma yagouaroundi; Ocelote, Leopardus pardalis; Margay, Leopardus wiedii and the complex of little spotted cat species; Felidae, Carnivora, Mammalia) by mitochondrial DNA analysis
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Pinedo Castro, Myreya Omayra Zoraida
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dc.contributor.none.fl_str_mv Ruiz García, Manuel
Rueda Zozaya, Maria del Pilar
Flanagan, Nicola Sian
Castillo Amézquita, Maria Ignacia
Pinto Báez, Miguel
Pérez Torres, Jairo
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Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
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description Los estudios con ADN para las especies de felinos silvestres del Neotrópico se han basado en números reducidos de muestras y de marcadores moleculares, en áreas geográficas específicas y en la mayoría de los casos, con muestras de animales con orígenes geográficos inciertos. En este trabajo, se analizaron la filogeografía, sistemática molecular y algunas características de la evolución genética de cinco especies de felinos neotropicales (Panthera onca, Puma yagouaroundi, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii y Leopardus tigrinus), mediante las secuencias de tres genes mitocondriales: ATP8, 16S rRNA y NADH5 y mitogenomas para un número significativo de muestras obtenidas directamente de la naturaleza. Mediante el análisis de diversidad genética, se encontró que, para las cinco especies, los niveles son elevados. En cuatro especies, el número de acervos genéticos es menor que el de las subespecies morfológicas consideradas por los zoólogos excepto para el tigrillo. Se confirmó a L. guttulus como especie y se revela la existencia de dos posibles especies de tigrillos para Colombia y Ecuador. Los análisis bayesiano y distribución mismatch mostraron evidencias de que las cuatro especies de mayor porte y el complejo de especies de tigrillos, pasaron por expansiones poblacionales durante el pleistoceno lo cual significa que los mismos procesos afectaron la evolución genética de estos organismos. Además, se demuestra que el análisis de un gran número de ejemplares con la mayor diversificación geográfica posible, es necesario para detectar agrupaciones regionales de trascendencia sistemática (por ejemplo, por debajo del nivel de especie), aunque el número de marcadores sea bajo.
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En este trabajo, se analizaron la filogeografía, sistemática molecular y algunas características de la evolución genética de cinco especies de felinos neotropicales (Panthera onca, Puma yagouaroundi, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii y Leopardus tigrinus), mediante las secuencias de tres genes mitocondriales: ATP8, 16S rRNA y NADH5 y mitogenomas para un número significativo de muestras obtenidas directamente de la naturaleza. Mediante el análisis de diversidad genética, se encontró que, para las cinco especies, los niveles son elevados. En cuatro especies, el número de acervos genéticos es menor que el de las subespecies morfológicas consideradas por los zoólogos excepto para el tigrillo. Se confirmó a L. guttulus como especie y se revela la existencia de dos posibles especies de tigrillos para Colombia y Ecuador. Los análisis bayesiano y distribución mismatch mostraron evidencias de que las cuatro especies de mayor porte y el complejo de especies de tigrillos, pasaron por expansiones poblacionales durante el pleistoceno lo cual significa que los mismos procesos afectaron la evolución genética de estos organismos. Además, se demuestra que el análisis de un gran número de ejemplares con la mayor diversificación geográfica posible, es necesario para detectar agrupaciones regionales de trascendencia sistemática (por ejemplo, por debajo del nivel de especie), aunque el número de marcadores sea bajo.Vicerrectoría de investigaciones de la Pontificia Universidad JaverianaThe DNA’s studies for Neotropical wild cat species have been traditionally based on a reduced number of samples and molecular markers as well as in restricted geographical areas and, in many cases, with animals whose geographical origins are uncertain. This work analyzed the phylogeography, the molecular systematics and some traits of the evolutionary genetics of five Neotropical cat species (Panthera onca, Puma yagouaroundi, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii and Leopardus tigrinus), by means of three mitochondrial genes (ATP8, 16S rRNA and NADH5) and by mitogenomes for large simple sizes directly coming from wild. The genetic diversity analyses yielded high levels for all the species studied. In four of these species, the significant number of gene pools were lower than the putative morphological subspecies traditionally recognized, with the exception of the tigrina. In this case, our study detected the posible existence of different species within the traditional tigrina. L. guttulus was confirmed in southern-eastern Brazil and several different species were detected in Colombia and Ecuador. The Bayesian and mismatch procedures showed evidences that all the species analyzed crossed by population expansions during the Pleistocene, which agrees quite well with the possibility that the same Pleistocene events affected in a similar way all these species. Furthermore, it was shown that large simple sizes with very diversified geographical origins are needed to detect some regional clusters of relevant systematic meaning, although the number of molecular markers should be limited.Doctor en Ciencias BiológicasDoctoradoPontificia Universidad JaverianaDoctorado en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasRuiz García, ManuelRueda Zozaya, Maria del PilarFlanagan, Nicola SianCastillo Amézquita, Maria IgnaciaPinto Báez, MiguelPérez Torres, Jairo2020-02-10T21:36:17Z2020-04-16T14:53:45Z2020-02-10T21:36:17Z2020-04-16T14:53:45Z2017-06-02http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/47109https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.47109instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAmérica CentralAmérica del NorteAmérica del Sur1998-2015Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2022-04-29T17:34:53Z