Efecto del uso del suelo sobre comunidades microbianas de sistemas de pastoreo y cultivos de caña de azúcar del Valle del Cauca
Los diferentes usos que se le dan a los suelos afectan las propiedades físico-químicas de estos, lo que puede tener un efecto sobre las comunidades microbianas nativas de dichos ambientes. Para determinar estos efectos se debe conocer cómo los diferentes métodos utilizados en los estudios de ecologí...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- masterThesis
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
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- Palabra clave:
- Caña de azúcar
Cultivos
Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
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Los diferentes usos que se le dan a los suelos afectan las propiedades físico-químicas de estos, lo que puede tener un efecto sobre las comunidades microbianas nativas de dichos ambientes. Para determinar estos efectos se debe conocer cómo los diferentes métodos utilizados en los estudios de ecología microbiana pueden afectar la estimación de la diversidad. En el presente estudio se analizó: 1) el efecto que tienen el método de extracción (Kit PowerSoil vs método Griffiths), la purificación de ADN (eliminación de contaminantes) y la reproducibilidad de la PCR y 2) el efecto que tiene el uso del suelo (sistemas de pastoreo y cultivos de caña de azúcar) en dos regiones del Valle del Cauca sobre la estructura y composición de las comunidades microbianas. Las comunidades microbianas fueron estudiadas utilizando la región V4 del gen 16S ARNr y secuenciándola mediante Secuenciación de Siguiente Generación (Miseq, Illumina). |
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Efecto del uso del suelo sobre comunidades microbianas de sistemas de pastoreo y cultivos de caña de azúcar del Valle del CaucaSáenz Medina, Johan SebastiánCaña de azúcarCultivosMaestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasLos diferentes usos que se le dan a los suelos afectan las propiedades físico-químicas de estos, lo que puede tener un efecto sobre las comunidades microbianas nativas de dichos ambientes. Para determinar estos efectos se debe conocer cómo los diferentes métodos utilizados en los estudios de ecología microbiana pueden afectar la estimación de la diversidad. En el presente estudio se analizó: 1) el efecto que tienen el método de extracción (Kit PowerSoil vs método Griffiths), la purificación de ADN (eliminación de contaminantes) y la reproducibilidad de la PCR y 2) el efecto que tiene el uso del suelo (sistemas de pastoreo y cultivos de caña de azúcar) en dos regiones del Valle del Cauca sobre la estructura y composición de las comunidades microbianas. Las comunidades microbianas fueron estudiadas utilizando la región V4 del gen 16S ARNr y secuenciándola mediante Secuenciación de Siguiente Generación (Miseq, Illumina).The different uses that are given to soils affect their physicochemical properties, which may have an effect on microbial communities. To determine these effects it must be understood how the different methods used in microbial ecology studies may affect the estimation of diversity. In the present study it was analyzed: 1) The effect of the ADN extraction (PowerSoil Kit vs Griffiths method) and the purification method (removing contaminants) and 2) the effect of land use in a conventional or agro-ecological way, in grazing systems and sugar cane crops in two regions of Valle del Cauca. The microbial communities were studied by the sequencing of the V4 region of the 16S rRNA gene by Next Generation Sequencing (MiSeq, Illumina).Magíster en Ciencias BiológicasMaestríaPontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasArbeli, Ziv2015-03-26T03:11:20Z2016-01-13T19:39:06Z2020-04-16T19:45:55Z2015-03-26T03:11:20Z2016-01-13T19:39:06Z2020-04-16T19:45:55Z2014http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/15466https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.15466instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2022-04-29T16:45:21Z |