Identificación de ARN largos no codificantes en tejido y biopsia líquida de pacientes con diagnóstico de cáncer de pulmón NSCLC

El cáncer de pulmón es la principal causa de muerte por cáncer en el mundo, esta alta tasa de mortalidad se asocia con las dificultades de detección diagnóstica y los altos índices de detección en etapas avanzadas cuando las opciones de tratamiento son limitadas. La búsqueda de biomarcadores derivad...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
masterThesis
Fecha de publicación:
2022
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/59415
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/59415
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Palabra clave:
Biomarcador
lncRNA
Biopsia líquida
Epigenética
Cáncer de pulmón
Biomarker
lncRNA
Liquid biopsy
Epigenetics
Lung cancer
Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Epigenética
Marcadores bioquímicos
Neoplasias pulmonares
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Long non-coding RNAs identification in tissue and liquid biopsy of non-small cell lung cancer patients
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Bermudez Liscano, Litzy Gisella
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Ayala Ramírez, Paola Andrea
Barreto Prieto, Alfonso
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Russi Noguera, July Andrea
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description El cáncer de pulmón es la principal causa de muerte por cáncer en el mundo, esta alta tasa de mortalidad se asocia con las dificultades de detección diagnóstica y los altos índices de detección en etapas avanzadas cuando las opciones de tratamiento son limitadas. La búsqueda de biomarcadores derivados del tumor identificables en muestras mínimamente invasivas que acompañan y favorecen la detección oportuna de esta patología ha aumentado en los últimos años. Específicamente, en biopsia líquida se han identificado componentes como células tumorales circulantes, proteínas, ADN y ARNs no codificantes tanto libres como contenido en vesículas extracelulares. El objetivo de este estudio fue evaluar los perfiles de expresión de los ARN largos no codificantes (lncRNA, por sus siglas en inglés) MALAT1, NEAT1, HOTAIR, GAPLINC y H19, en tejido y biopsia líquida de pacientes con diagnóstico de cáncer de pulmón de célula no pequeña (NSCLC, por sus siglas en inglés). Para esto, se analizó la expresión mediante PCR en tiempo real de tres grupos de muestras biológicas: cultivo de líneas celulares de adenocarcinoma de pulmón, cultivo primario de biopsia pulmonar y biopsia líquida de pacientes con cáncer de pulmón NSCLC. Este análisis de expresión se realizó a nivel intracelular (líneas celulares y cultivo primario), extracelular (sobrenadante de cultivo y suero de pacientes) y en vesículas extracelulares (derivadas de cultivo celular y derivadas de suero de pacientes). Los resultados del presente estudio identificaron a GAPLINC como un posible biomarcador diagnóstico detectable en biopsia líquida y cultivo primario de biopsia pulmonar derivado de pacientes con cáncer de pulmón pertenecientes a la población colombiana. Adicionalmente, los lncRNA MALAT1, H19 y NEAT1 aumentaron en cultivo primario de biopsia pulmonar derivada de pacientes con cáncer de pulmón. Sin embargo, en biopsia líquida, aún es necesario la realización de más estudios para su posible validación como biomarcador diagnóstico y pronóstico. Estos hallazgos permitirán ampliar el conocimiento e identificación de potenciales biomarcadores en cáncer de pulmón, contribuyendo al diagnóstico y tratamiento oportuno de esta patología a largo plazo.
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Específicamente, en biopsia líquida se han identificado componentes como células tumorales circulantes, proteínas, ADN y ARNs no codificantes tanto libres como contenido en vesículas extracelulares. El objetivo de este estudio fue evaluar los perfiles de expresión de los ARN largos no codificantes (lncRNA, por sus siglas en inglés) MALAT1, NEAT1, HOTAIR, GAPLINC y H19, en tejido y biopsia líquida de pacientes con diagnóstico de cáncer de pulmón de célula no pequeña (NSCLC, por sus siglas en inglés). Para esto, se analizó la expresión mediante PCR en tiempo real de tres grupos de muestras biológicas: cultivo de líneas celulares de adenocarcinoma de pulmón, cultivo primario de biopsia pulmonar y biopsia líquida de pacientes con cáncer de pulmón NSCLC. Este análisis de expresión se realizó a nivel intracelular (líneas celulares y cultivo primario), extracelular (sobrenadante de cultivo y suero de pacientes) y en vesículas extracelulares (derivadas de cultivo celular y derivadas de suero de pacientes). Los resultados del presente estudio identificaron a GAPLINC como un posible biomarcador diagnóstico detectable en biopsia líquida y cultivo primario de biopsia pulmonar derivado de pacientes con cáncer de pulmón pertenecientes a la población colombiana. Adicionalmente, los lncRNA MALAT1, H19 y NEAT1 aumentaron en cultivo primario de biopsia pulmonar derivada de pacientes con cáncer de pulmón. Sin embargo, en biopsia líquida, aún es necesario la realización de más estudios para su posible validación como biomarcador diagnóstico y pronóstico. Estos hallazgos permitirán ampliar el conocimiento e identificación de potenciales biomarcadores en cáncer de pulmón, contribuyendo al diagnóstico y tratamiento oportuno de esta patología a largo plazo.Pontificia Universidad Javeriana - Hospital Universitario San IgnacioDiagnostic detection difficulties and high detection rates in advanced stages when treatment options are limited. The search for identifiable tumor-derived biomarkers in minimally invasive samples that accompany and favor the timely detection of this pathology has increased in recent years. Specifically, components such as circulating tumor cells, proteins, DNA, and non-coding RNAs, both free and contained in extracellular vesicles, have been identified in liquid biopsy. The objective of this study was to evaluate the expression profiles of the long non-coding RNAs (lncRNAs) MALAT1, NEAT1, HOTAIR, GAPLINC, and H19, in tissue and liquid biopsy of patients diagnosed with lung cancer. non-small cell (NSCLC). Thus, the expression was analyzed by real-time PCR of three groups of biological samples: culture of lung adenocarcinoma cell lines, primary culture of lung biopsy, and liquid biopsy of patients with NSCLC lung cancer. This expression analysis was performed at the intracellular (cell lines and primary culture), extracellular (culture supernatant and patient serum), and extracellular vesicles (cell culture-derived and patient serum-derived) levels. The results of the present study identified GAPLINC as a possible diagnostic biomarker detectable in liquid biopsy and primary culture of lung biopsy derived from lung cancer patients belonging to the Colombian population. Additionally, the lncRNAs MALAT1, H19, and NEAT1 were increased in primary culture of lung biopsy derived from patients with lung cancer. However, in liquid biopsy, more studies are still needed for its possible validation as a diagnostic and prognostic biomarker. These findings will allow expanding the knowledge and identification of potential biomarkers in lung cancer, contributing to the timely diagnosis and treatment of this pathology in the long term.Magíster en Ciencias BiológicasMaestría0000-0002-6563-7067https://scholar.google.com/citations?user=9DGkicIAAAAJ&hl=eshttps://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000128487Pontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasRojas Moreno, Adriana PatriciaAyala Ramírez, Paola AndreaBarreto Prieto, AlfonsoAristizabal Pachon, Andres FelipeRussi Noguera, July Andrea2022-04-01T13:56:18Z2022-04-01T13:56:18Z2022-03-09http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/59415https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.59415instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaColombia2021-2022Cundinamarca (Colombia)Bogotá, D.C. (Bogotá, Colombia)Bogotá (Colombia)Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/embargoedAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2023-04-01T05:00:00Z