Computación de alto desempeño aplicada en técnicas de simulación de proteínas

Se busca estudiar alternativas de computación de alto desempeño (HPC) viables en la PUJ para generar opciones que permitan potenciar la e-Science y el trabajo interdisciplinario. Para ello se revisó el estado del arte y la necesidad de HPC, observando posibles problemas que demuestren las ventajas d...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
masterThesis
Fecha de publicación:
2009
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/643
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/643
https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.643
Palabra clave:
Computación de alto desempeño
Simulación de proteínas
Computación de alto rendimiento
Simulación por computadores digitales
Maestría en biología - Tesis y disertaciones académicas
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openAccess
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description Se busca estudiar alternativas de computación de alto desempeño (HPC) viables en la PUJ para generar opciones que permitan potenciar la e-Science y el trabajo interdisciplinario. Para ello se revisó el estado del arte y la necesidad de HPC, observando posibles problemas que demuestren las ventajas de tener un sistema con estas características, se diseñó un experimento de simulación utilizando clusters computacionales diferenciados según capacidad y cantidad de procesadores| se seleccionaron las moléculas según resultados experimentales, se seleccionaron variables independientes, dependientes e intervinientes para preparar y configurar las simulaciones. Se desarrollaron scripts y programas para replicar configuraciones en las máquinas.
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