Búsqueda de las arqueas methanobrevibacter AbM4 y candidatus methanomethylophilus alvus en pacientes con cáncer oral y controles a partir de análisis metagenómicos

La cavidad oral alberga diversos microorganismos (bacterias, hongos, arqueas y virus) que constituyen la microbiota oral. En algunos estudios se ha establecido que su disbiosis está relacionada con enfermedades como el carcinoma escamocelular oral (CECO). Gracias a las técnicas de secuenciación de última generación (NGS), se ha identificado la microbiota que caracteriza diferentes zonas anatómicas y patologías, lo que ha permitido encontrar una asociación entre el CECO y la microbiota oral que involucra principalmente bacterias. De hecho, la evidencia ha permitido identificar algunas bacterias como Streptococcus anginosus y Prevotella melaninogenica (1). Sin embargo, es necesario ampliar la descripción de las comunidades microbianas e incluir en estas a las arqueas. Las arqueas, han sido descritas principalmente en el tracto gastrointestinal, en donde se ha observado una posible relación entre la variación cuantitativa de arqueas con enfermedad inflamatoria de colon, y carcinoma colorectal, entre otros (2). En cavidad oral, se ha determinado su presencia en pacientes con enfermedad periodontal o periimplantitis con una relación proporcional a la severidad de la patología (3). Sin embargo, no se han realizado descripciones en CECO o en lesiones potencialmente malignas en cavidad oral. Gracias a resultados obtenidos de bases de datos de arqueas derivadas de análisis bioinformáticos y de un estudio metagenómico previo realizado en el Centro de Investigaciones Odontológicas de la Pontificia Universidad Javeriana, donde se compararon los microbiomas orales de 10 pacientes con cáncer oral y 10 pacientes sin cáncer oral a través de comparaciones múltiples mediante diagramas de Venn y búsqueda exhaustiva de la literatura, propusimos posibles arqueas asociadas a enfermedad y a salud, logrando describir a Methanobrevibacter sp AbM4 asociada a enfermedad y Candidatus Methanomethylophilus alvus asociada a salud. El objetivo de este estudio fue validar la presencia de estas dos arqueas en una nueva muestra de pacientes con y sin cáncer oral. Con este fin, se realizó una PCR convencional, para detectar estas dos arqueas en tejido tumoral de 36 pacientes con diagnóstico de CECO y 36 controles (personas sin lesiones en boca y con edad y género similares a los reportados por los pacientes índice). Se realizaron análisis cualitativos y cuantitativos. El análisis estadístico fue realizado con la prueba X2 para la variable cualitativa y la prueba t-student para el análisis del número de copias de cada arquea en pacientes controles y con CECO. La arquea Methanobrevibacter sp AbM4 candidata de enfermedad estuvo presente en 3 (8%) de los pacientes con CECO y en 16 muestras (40%) de los controles, p=0.001, indicando una mayor frecuencia de esta arquea en el grupo de controles. Al realizar el análisis de número de copias en estos dos grupos se observó que la mediana en muestras de pacientes con CECO fue de 43736 copias y en controles de 339 copias, p=0.0001, lo que indica que este microorganismo se incrementó en cantidad en pacientes con carcinoma oral, corroborando su posible asociación a estados patológicos. Por su parte, Candidatus Methanomethylophilus alvus (arquea candidata a salud) se detectó en 9 (25%), de las muestras de pacientes con CECO y en 57% (23 muestras) del grupo control con una p=0.042, indicando mayor frecuencia en controles al compararlo con los casos. Al realizar el análisis cuantitativo de esta arquea se observó que la mediana del número de copias fue 324 en los pacientes con CECO y de 31 copias en pacientes sin CECO p=0.0001, indicando que esta arquea puede relacionarse con estados saludables por su mayor frecuencia en el grupo control, sin embargo, su cantidad es mayor en pacientes con CECO. En conclusión, este estudio permitió describir las arqueas Methanobrevibacter sp AbM4 (Mbb) y Candidatus Methanomethylophilus alvus (Ca alvus) en grupos de pacientes con CECO y sus controles.

• Tipo de recurso: masterThesis
• Fecha de publicación: 2021
• Institución: Pontificia Universidad Javeriana
• Repositorio: Repositorio Universidad Javeriana
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repository.javeriana.edu.co:10554/57605
• Acceso en línea: http://hdl.handle.net/10554/57605; https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.57605
• Palabra clave: Arqueas; Cáncer oral; Archaea; Oral cancer; Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas; Arqueobacterias; Neoplasias de la boca
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