Genotipificación, niveles de expresión y estado de integración del virus de papiloma humano en el carcinoma orofaríngeo de células escamosas
El cáncer escamocelular es uno de los tumores más frecuentes de cabeza y cuello, ocupa el quinto lugar entre todos los tipos de cáncer en el mundo, entre los factores de riesgo se encuentran el consumo de tabaco y alcohol y las infecciones virales como el Virus del Papiloma Humano (VPH), éste último...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- masterThesis
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/17010
- Palabra clave:
- VPH
Carcinoma orofaríngeo
Transcripción E7
Genoma viral
HPV
Oropharyngeal carcinoma
E7 transcription
Viral genome
Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Genotipos
Papilomavirus
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- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Genotipificación, niveles de expresión y estado de integración del virus de papiloma humano en el carcinoma orofaríngeo de células escamosas Motta Vargas, Leidy Angélica VPH Carcinoma orofaríngeo Transcripción E7 Genoma viral HPV Oropharyngeal carcinoma E7 transcription Viral genome Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas Genotipos Papilomavirus |
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El cáncer escamocelular es uno de los tumores más frecuentes de cabeza y cuello, ocupa el quinto lugar entre todos los tipos de cáncer en el mundo, entre los factores de riesgo se encuentran el consumo de tabaco y alcohol y las infecciones virales como el Virus del Papiloma Humano (VPH), éste último principalmente para el carcinoma orofaríngeo de células escamosas, donde se considera como el principal factor de riesgo, ya que según datos epidemiológicos existen frecuencias de prevalencias que varían desde un 20% hasta en un 80% dependiendo de la región geográfica. En Colombia solo existe un estudio de cabeza y cuello asociado a VPH, realizado por Quintero y colaboradores en el 2013, donde se reportó una prevalencia de 18.9%. Por esta razón el presente estudio busco identificar los tipos virales de alto riesgo más frecuentes en una muestra de pacientes con cáncer orofaríngeo así como determinar los niveles de expresión y estado físico del genoma viral (integrado/ episomal) para el tipo de virus más prevalente. El presente estudio fue de tipo multicéntrico descriptivo donde se incluyeron 46 adultos que asistieron a los servicios de cirugía de cabeza y cuello en las ciudades de Bogotá, Manizales y Bucaramanga, previo consentimiento informado. Todas las muestras diagnosticadas histopatológicamente con carcinoma escamocelular de orofaringe fueron incluidas en este estudio. A las muestras se les realizo extracción de ADN y ARN, con el ADN se realizó genotipificación de VPH y se estableció el estado físico del genoma viral. Con el ARN se determinó el número de copias por PCR en tiempo real. La prevalencia de VPH fue de 21.74% de los tumores, El tipo viral más frecuente fue el VPH 16 (9 casos) y el VPH58 (1 caso). La expresión viral fue baja para VPH 16 (1-11 copias) y el estado físico predominante de este virus fue el mixto (8 casos), prevaleciendo la disrupción en el sitio de unión de E1 y E2 (nt 2525 a 3720). |
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En Colombia solo existe un estudio de cabeza y cuello asociado a VPH, realizado por Quintero y colaboradores en el 2013, donde se reportó una prevalencia de 18.9%. Por esta razón el presente estudio busco identificar los tipos virales de alto riesgo más frecuentes en una muestra de pacientes con cáncer orofaríngeo así como determinar los niveles de expresión y estado físico del genoma viral (integrado/ episomal) para el tipo de virus más prevalente. El presente estudio fue de tipo multicéntrico descriptivo donde se incluyeron 46 adultos que asistieron a los servicios de cirugía de cabeza y cuello en las ciudades de Bogotá, Manizales y Bucaramanga, previo consentimiento informado. Todas las muestras diagnosticadas histopatológicamente con carcinoma escamocelular de orofaringe fueron incluidas en este estudio. A las muestras se les realizo extracción de ADN y ARN, con el ADN se realizó genotipificación de VPH y se estableció el estado físico del genoma viral. Con el ARN se determinó el número de copias por PCR en tiempo real. La prevalencia de VPH fue de 21.74% de los tumores, El tipo viral más frecuente fue el VPH 16 (9 casos) y el VPH58 (1 caso). La expresión viral fue baja para VPH 16 (1-11 copias) y el estado físico predominante de este virus fue el mixto (8 casos), prevaleciendo la disrupción en el sitio de unión de E1 y E2 (nt 2525 a 3720).Squamous cell cancer is one of the most common tumors of the head and neck it ranks fifth among all cancers in the world. Among the risk factors are the consumption of tobacco and alcohol, and viral infections with Human Papillomavirus (HPV), and viral infections with Human Papillomavirus (HPV), the latter mainly for oropharyngeal squamous cell carcinoma (OSCC), for wich HPV is considered as the main risk factor, the latter mainly for oropharyngeal squamous cell carcinoma, which is considered as the main risk factor, because according to epidemiological data exist frequencies prevalences ranging from 20% to 80% depending on geographic region. In Colombia there is only one report of head and neck cancer associated with HPV, made by Quintero and collaborators in 2013. Therefore, this study was aimed at identifying the most prevalent high-risk HPV types in our OSCC patients as well as determining the expression levels and physical condition of the viral genome (episomal/integrated) for the most prevalent HPV type of virus. This was descriptive multicentric study which included,prior informed consent, 46 adults attending the of head and neck surgery services in the cities of Bogota, Manizales and Bucaramanga. All samples histopathologically diagnosed with oropharyngeal squamous cell carcinoma were included in this study. A sample was performed extraction of DNA and RNA. Genotyping of the HPV DNA and determination of its physical state was performed. The RNA samples were used to measure viral transcript copy number by real-time PCR. HPV prevalence was 21.74% (10 cases), the viral types found were HPV16 (9 cases) and VPH58 (1 case). Viral expression was low for HPV 16 (1- 11 copies) and the predominant physical state of this virus was mixed episomal and integrated (8 cases) with disruption of the site between the E1 and E2 genes (nt 2525 to 3720).Magíster en Ciencias BiológicasMaestríaPontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasGarcía Robayo, Dabeiba AdrianaTupaz Erira, Alveiro2015-12-15T03:54:22Z2016-01-13T19:38:29Z2020-04-16T19:40:19Z2015-12-15T03:54:22Z2016-01-13T19:38:29Z2020-04-16T19:40:19Z2014http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/17010https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.17010instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2022-04-29T19:17:18Z |