Variantes genéticas asociadas a genes de autoinmunidad e hipercolesterolemia familiar en mujeres colombianas con artritis reumatoide o lupus eritematoso sistémico

El Lupus Eritematoso Sistémico (LES) y la Artritis Reumatoide (AR) son enfermedades autoinmunes crónicas, de alto costo, afectan con mayor frecuencia a las mujeres y generan una discapacidad progresiva en los pacientes. En Colombia, se presentan con una prevalencia de 0,088% y 0,52% respectivamente....

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
masterThesis
Fecha de publicación:
2023
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/65557
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/65557
Palabra clave:
Lupus Eritematoso sistémico
Artritis Reumatoide
Autoinmunidad
Hipercolesterolemia familiar
Variante genética
Systemic Lupus Erythematosus
Rheumatoid arthritis
Autoimmunity
Familial hypercholesterolemia
Genetic variant
Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Lupus eritematoso sistémico - Análisis - Bogotá (Colombia)
Artritis reumatoide - Análisis - Bogotá (Colombia)
Genética - Bogotá (Colombia)
Hipercolesterolemia familiar
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Genetic variants associated with autoimmmunity genes and familiar hypercholesterolemia in colombian women with rheumatoid arthritis or systemic lupus erythematosus
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Gómez Navarro, Luisa Fernanda
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description El Lupus Eritematoso Sistémico (LES) y la Artritis Reumatoide (AR) son enfermedades autoinmunes crónicas, de alto costo, afectan con mayor frecuencia a las mujeres y generan una discapacidad progresiva en los pacientes. En Colombia, se presentan con una prevalencia de 0,088% y 0,52% respectivamente. Estas enfermedades son multifactoriales ya que pueden generarse tanto por factores genéticos como ambientales por lo cual actualmente el tratamiento está dirigido a evitar el progreso de la enfermedad. En los últimos años se han descrito varios genes relacionados con el fenotipo de estas dos enfermedades, asociados a susceptibilidad para desarrollarlas. Adicionalmente, también se ha descrito que algunos de estos pacientes desarrollan dislipidemias y presentan un riesgo incrementado de aterosclerosis. Aunque estos procesos podrían estar relacionados con el tratamiento con corticoides o al proceso inflamatorio propio de la enfermedad, aún existe la posibilidad de que pueda estar asociados a factores genéticos. El propósito de este estudio fue identificar variantes en genes asociados a autoinmunidad y a Hipercolesterolemia Familiar (HF) en mujeres con diagnóstico de Lupus Eritematoso Sistémico o Artritis Reumatoide. Se incluyeron en el estudio 45 mujeres con diagnóstico clínico de alguna de estas dos enfermedades y 31 controles sanos. En los individuos afectados se realizó análisis de exoma clínico mediante secuenciación masiva paralela y se seleccionaron variantes de interés en genes asociados a procesos autoinmunes y genes asociados a Hipercolesterolemia Familiar. Las variantes de interés fueron confirmadas mediante secuenciación Sanger y validadas en la población de controles sanos. En algunos casos relevantes, se realizó análisis de segregación familiar. En 7 individuos de la población de estudio se identificaron variantes asociadas a los genes TNFRSF13B, IL6, DNASE1, SAMHD1, SLC22A4 y TLR5 los cuales están asociados con autoinmunidad y podrían estar relacionados con la patología. Así mismo, se identificaron 5 variantes probablemente patogénicas en los genes APOB y APOE en estado heterocigoto. Variantes en estos genes han sido asociadas al fenotipo de HF. No se identificaron variantes patogénicas o probablemente patogénicas en los genes LDLR, PSCK9, ni LDLRAP1/ARH.
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En Colombia, se presentan con una prevalencia de 0,088% y 0,52% respectivamente. Estas enfermedades son multifactoriales ya que pueden generarse tanto por factores genéticos como ambientales por lo cual actualmente el tratamiento está dirigido a evitar el progreso de la enfermedad. En los últimos años se han descrito varios genes relacionados con el fenotipo de estas dos enfermedades, asociados a susceptibilidad para desarrollarlas. Adicionalmente, también se ha descrito que algunos de estos pacientes desarrollan dislipidemias y presentan un riesgo incrementado de aterosclerosis. Aunque estos procesos podrían estar relacionados con el tratamiento con corticoides o al proceso inflamatorio propio de la enfermedad, aún existe la posibilidad de que pueda estar asociados a factores genéticos. El propósito de este estudio fue identificar variantes en genes asociados a autoinmunidad y a Hipercolesterolemia Familiar (HF) en mujeres con diagnóstico de Lupus Eritematoso Sistémico o Artritis Reumatoide. Se incluyeron en el estudio 45 mujeres con diagnóstico clínico de alguna de estas dos enfermedades y 31 controles sanos. En los individuos afectados se realizó análisis de exoma clínico mediante secuenciación masiva paralela y se seleccionaron variantes de interés en genes asociados a procesos autoinmunes y genes asociados a Hipercolesterolemia Familiar. Las variantes de interés fueron confirmadas mediante secuenciación Sanger y validadas en la población de controles sanos. En algunos casos relevantes, se realizó análisis de segregación familiar. En 7 individuos de la población de estudio se identificaron variantes asociadas a los genes TNFRSF13B, IL6, DNASE1, SAMHD1, SLC22A4 y TLR5 los cuales están asociados con autoinmunidad y podrían estar relacionados con la patología. Así mismo, se identificaron 5 variantes probablemente patogénicas en los genes APOB y APOE en estado heterocigoto. Variantes en estos genes han sido asociadas al fenotipo de HF. No se identificaron variantes patogénicas o probablemente patogénicas en los genes LDLR, PSCK9, ni LDLRAP1/ARH.Systemic Lupus Erythematosus (SLE) and Rheumatoid Arthritis (RA) are chronic, high-cost autoimmune diseases that evolve more frequently in women and generate progressive disability in patients. In Colombia, it occurs with a prevalence of 0.088% and 0.52% respectively. These diseases are multifactorial since they can be generated by both genetic and environmental factors, which is why treatment is currently aimed at preventing the progression of the disease. In recent years, genes associated with the phenotype of these two diseases have been described, some of them as a direct cause and others associated with susceptibility to develop them. In addition, it has also been described that some of these patients develop dyslipidemia and have an increased risk of atherosclerosis. Although these processes could be related to treatment with corticosteroids or to the inflammatory process of the disease, there is still the possibility that it could be associated with genetic factors. The purpose of this study was to identify variants in genes associated with autoimmunity and Familial Hypercholesterolemia (FH) in women diagnosed with Systemic Lupus Erythematosus or Rheumatoid Arthritis. Forty-five women with a clinical diagnosis of one of these two diseases and 31 healthy controls were included in the study. In affected individuals, a clinical exome analysis was performed using massive parallel sequencing and variants of interest in genes associated with autoimmune processes and genes associated with Familial Hypercholesterolemia were selected. Variants of interest were confirmed by Sanger sequencing and validated in the healthy control population. In some relevant cases, a family segregation analysis was performed. In 7 individuals from the study population, variants associated with the genes TNFRSF13B, IL6, DNASE1, SAMHD1, SLC22A4 and TLR5 were identified, which are associated with autoimmunity and could be related to the pathology. Likewise, 5 probably pathogenic variants were identified in the APOB and APOE genes in a heterozygous state. Variants in these genes have been associated with the FH phenotype. No pathogenic or probably pathogenic variants were identified in the LDLR, PSCK9, or LDLRAP1/ARH genes.Magíster en Ciencias BiológicasMaestríaPontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasLópez Leal, GreizyGelvez, NancyTamayo, Marta LuciaBeltrán, Angela BeltránGarcía Acero, Mary AlexandraGarcía Restrepo, Natalia2023-10-17T13:51:36Z2023-10-17T13:51:36Z2023-09-07http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/65557instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaColombiaCundinamarca (Colombia)Bogotá, D.C. (Bogotá, Colombia)Bogotá (Colombia)Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2023-10-20T08:12:36Z