Caracterización molecular de una serie de análogos de nicotina y su interacción con receptores nicotínicos α7

Diversos trabajos que caracterizan la nicotina se han llevado a cabo desde aproximaciones experimentales y teóricas; contrariamente para análogos solo se ha desarrollado un estudio conformacional para selenoanálogos. Esto motivó realizar la caracterización molecular de una serie de ocho análogos de...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
masterThesis
Fecha de publicación:
2018
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/34028
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/34028
https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.34028
Palabra clave:
Interacciones débiles
Orbitales de orden natural
Orbitales mas altos ocupados
3-(1-metilpirrolidin-2-yl) piridina
Weak interactions
Natural bond orbital
Highest occupied molecular orbital
3-(1-methylpyrrolidin-2-yl)pyridine
Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Becerra Cruz, Gina Paola
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González Santos, Janneth
Loaiza, Alix
Tobar, Fabian
Gómez, Badhin
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description Diversos trabajos que caracterizan la nicotina se han llevado a cabo desde aproximaciones experimentales y teóricas; contrariamente para análogos solo se ha desarrollado un estudio conformacional para selenoanálogos. Esto motivó realizar la caracterización molecular de una serie de ocho análogos de nicotina. Nótese que, aunque para algunos de estos análogos ya hay reportes de su afinidad por receptores nicotínicos, los mecanismos no se conocen aún muy bien por tanto este tipo de estudios proveen datos geométricos, energéticos, poblacionales, entre otros, que permiten explicar dichos mecanismos. Para el desarrollo de este trabajo fueron empleados los siguientes programas: Avogadro para el diseño 3D y la obtención de confórmeros; Gaussian09 en la optimización geométrica de los confórmeros usando cálculos DFT (B3LYP y la base aug-cc-pVDZ), NBO para los cálculos de población electrónica y AIMAllProfessional para el análisis topológico de la densidad electrónica. Se obtuvieron 24 geometrías estables a partir de los cálculos de optimización y frecuencias de 114 confórmeros: A1(2), A2(2), A3(2), A4(2), A5(6), A6(6), A7(2) y A8(2), AX(Y)=A: análogo, X=1 a 8, y: número de estructuras estables. La caracterización molecular se ha centrado en datos geométricos como distancias de las interacciones intramoleculares, cargas atómicas de los átomos involucrados en dichas interacciones, así como la densidad electrónica en los puntos críticos de enlace hallando en algunos casos correlaciones interesantes entre dichos parámetros.
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Nótese que, aunque para algunos de estos análogos ya hay reportes de su afinidad por receptores nicotínicos, los mecanismos no se conocen aún muy bien por tanto este tipo de estudios proveen datos geométricos, energéticos, poblacionales, entre otros, que permiten explicar dichos mecanismos. Para el desarrollo de este trabajo fueron empleados los siguientes programas: Avogadro para el diseño 3D y la obtención de confórmeros; Gaussian09 en la optimización geométrica de los confórmeros usando cálculos DFT (B3LYP y la base aug-cc-pVDZ), NBO para los cálculos de población electrónica y AIMAllProfessional para el análisis topológico de la densidad electrónica. Se obtuvieron 24 geometrías estables a partir de los cálculos de optimización y frecuencias de 114 confórmeros: A1(2), A2(2), A3(2), A4(2), A5(6), A6(6), A7(2) y A8(2), AX(Y)=A: análogo, X=1 a 8, y: número de estructuras estables. La caracterización molecular se ha centrado en datos geométricos como distancias de las interacciones intramoleculares, cargas atómicas de los átomos involucrados en dichas interacciones, así como la densidad electrónica en los puntos críticos de enlace hallando en algunos casos correlaciones interesantes entre dichos parámetros.Several works that characterize nicotine have been developed from experimental (1) and/or theoretical (2) point of view; contrary, according to our best knowledge, for nicotine analogs, these is few reports such a conformational study for selenoanalogs (3). This motivates us to perform computationally molecular characterization of a serie of eight nicotine analogs whit pyrrolidine ring modifications. Note that although for some these analogs there are reports about their nicotine receptors affinity (4); the mechanisms are unknown yet. Therefore, this study provides geometry, energy, population data, among others, which could help to explain these mechanisms. For development of this work the following programs were employed: Avogadro for 3D design and conformer search; DFT (B3LYP/aug-cc-pVDZ) calculations with Gaussian 09 for conformers geometry optimization; NBO for electronic population calculations and AIMAllProfessional topological analysis of the electronic density. We report 24 stable geometries from optimization calculations and frequencies of 144 conformational structures: A1(2), A2(2), A3(2), A4(2), A5(6), A6(6), A7(2) y A8(2); AX(Y)= A: analog, X=1 to 8, Y: number of stable structures. The molecular characterization has focused in geometries data as intermolecular interactions distances, atomic charges of atoms involved in such interactions, as well as electronic density in bond critical points, in some cases interesting correlations among such parameters have been found.Magíster en Ciencias BiológicasMaestríaPontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasMejía, Sol MilenaGonzález Santos, JannethLoaiza, AlixTobar, FabianGómez, Badhin2018-04-11T19:27:40Z2020-04-16T19:44:02Z2018-04-11T19:27:40Z2020-04-16T19:44:02Z2018-01-22http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/34028https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.34028instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2022-04-29T18:16:12Z