Diversidad genética, formación de biopelícula y genes de virulencia de Enterococcus faecalis aislados de muestras de cavidad oral relacionadas con el tratamiento de endodoncia

El fracaso de la terapia endodóntica está relacionado a la persistencia de Enterococcus faecalis, y su patogenicidad se asocia a la capacidad de formar biopelículas, expresar genes de virulencia, resistencia a los antibióticos, y sobrevivir tanto a condiciones ambientales adversas como a los proceso...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
masterThesis
Fecha de publicación:
2022
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/62141
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/62141
https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.62141
Palabra clave:
Enterococcus faecalis
Gen 16s ribosomal
Filogenia
Enterococcus faecalis
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Phylogeny
Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
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Ribosomas
Endodoncia
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Genetic diversity, biofilm formation, and virulence genes of Enterococcus faecalis isolated from oral cavity samples related to endodontic treatment
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Hurtado Narváez, Verónica Daniela
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description El fracaso de la terapia endodóntica está relacionado a la persistencia de Enterococcus faecalis, y su patogenicidad se asocia a la capacidad de formar biopelículas, expresar genes de virulencia, resistencia a los antibióticos, y sobrevivir tanto a condiciones ambientales adversas como a los procesos de irrigación, preparación biomecánica y materiales de obturación empleados en endodoncia. Sin embargo, se desconoce si existe un genotipo característico de los aislamientos de Enterococcus faecalis aislados de cavidad oral, y cuál es la relación de estos con los factores de virulencia. Este estudio analiza la diversidad genética en aislamientos provenientes de muestras de cavidad oral y de origen endodóntico, a los cuales se les detectó la presencia de los genes Asa, Esp, Efa A, Ace, Asa373, gelE, CylA, formación de biopelícula, y se analizó la diversidad genética mediante arboles filogenéticos elaborados a partir del alineamiento de secuencias del producto amplificado de una PCR 16S RNAr. El análisis bioinformático permitió observar que existen varias agrupaciones genéticas, siendo estas, diferentes entre todos los pacientes, pero con un alto grado de similitud entre muestras de un mismo paciente. La presencia de genes de virulencia y formación de biopelícula es independiente a la agrupación genética, pero está relacionada al tipo de muestra.
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Sin embargo, se desconoce si existe un genotipo característico de los aislamientos de Enterococcus faecalis aislados de cavidad oral, y cuál es la relación de estos con los factores de virulencia. Este estudio analiza la diversidad genética en aislamientos provenientes de muestras de cavidad oral y de origen endodóntico, a los cuales se les detectó la presencia de los genes Asa, Esp, Efa A, Ace, Asa373, gelE, CylA, formación de biopelícula, y se analizó la diversidad genética mediante arboles filogenéticos elaborados a partir del alineamiento de secuencias del producto amplificado de una PCR 16S RNAr. El análisis bioinformático permitió observar que existen varias agrupaciones genéticas, siendo estas, diferentes entre todos los pacientes, pero con un alto grado de similitud entre muestras de un mismo paciente. La presencia de genes de virulencia y formación de biopelícula es independiente a la agrupación genética, pero está relacionada al tipo de muestra.The failure of endodontic therapy is related to the persistence of Enterococcus faecalis and its pathogenicity is associated with the ability to form biopelículas, express virulence genes, resistance to antibiotics, and survive both adverse environmental conditions and irrigation processes. preparation and filling materials used in endodontics. However, it is unknown whether there is a characteristic genotype of Enterococcus faecalis strains isolated from the oral cavity, and what is the relationship between these and virulence factors. This study analyzes the genetic diversity in isolates from oral cavity samples and endodontic origin, in which the presence of genes Asa, Esp, EFA, Ace, Asa373, gelE, CylA, biopelícula formation was detected, and the presence of the genes was analyzed. Genetic diversity through phylogenetic trees made from the sequence alignment of the amplified product of a 16S rRNA PCR. The bioinformatic analysis allowed us to observe that there are several gene groups, these being different among all patients, but with a high degree of similarity between samples from the same patient. The presence of virulence genes and formation of biopelícula is independent of gene cluster but is related to the type of sample.Magíster en Ciencias BiológicasMaestríaPontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasDíez Ortega, HugoRodríguez Ciodaro, AdrianaMéndez de la Espriella, CatalinaGómez Cárdenas, OscarMartínez, María CeciliaAriza Ayala, Beatriz ElenaOtero Mendoza, Liliana Margarita2022-10-21T14:36:33Z2022-10-21T14:36:33Z2022-09-24http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/62141https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.62141instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. 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En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2023-05-30T21:21:47Z