Selección de los marcadores cultivables y moleculares útiles para diferenciar el origen de la contaminación fecal en el Río Bogotá
La detección de microorganismos patógenos intestinales en el agua se dificulta debido al alto costo de las pruebas y al tiempo de análisis. Como alternativa, se utilizan microorganismos indicadores, los cuales no diferencian si la contaminación es de origen fecal humano o animal, ya que hacen parte...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- masterThesis
- Fecha de publicación:
- 2017
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/38611
- Palabra clave:
- Agua residual animal
Agua residual municipal
Bacteroides spp.
Discriminación de la contaminación fecal
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Marcadores moleculares
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Municipal wastewater
Slaughterhouse wastewater
Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
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Selección de los marcadores cultivables y moleculares útiles para diferenciar el origen de la contaminación fecal en el Río Bogotá Sánchez Alfonso, Andrea Catherine Agua residual animal Agua residual municipal Bacteroides spp. Discriminación de la contaminación fecal Marcadores cultivables Marcadores moleculares Río Bogotá Bacteroides spp. Bogotá river Culture-dependent markers Microbial Source Tracking Molecular markers Municipal wastewater Slaughterhouse wastewater Maestría en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas Aguas residuales Marcadores genéticos Marcadores biológicos |
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La detección de microorganismos patógenos intestinales en el agua se dificulta debido al alto costo de las pruebas y al tiempo de análisis. Como alternativa, se utilizan microorganismos indicadores, los cuales no diferencian si la contaminación es de origen fecal humano o animal, ya que hacen parte del tracto digestivo de ambos. Para discriminar el origen de la contaminación fecal, se ha propuesto el uso de marcadores dependientes de cultivo y moleculares que pueden presentar especificidad geográfica, por lo que es necesario identificar aquellos aplicables en nuestro medio. El objetivo de este trabajo fue seleccionar los marcadores cultivables y moleculares para diferenciar el origen de la contaminación fecal en el río Bogotá. Para diferenciar la contaminación de origen porcino, se aisló una cepa a partir de contenido intestinal de porcino identificada como Bacteroides fragilis PZ8. Se evaluaron indicadores no discriminantes: coliformes totales, E. coli, colifagos somáticos y fagos que infectan la cepa de Bacteroides fragilis RYC2056, indicadores discriminantes: fagos que infectan las cepas de Bacteroides thetaiotaomicron GA17 y Bacteroides fragilis PZ8 y marcadores moleculares discriminantes: Bacteroidetes HF183F y CF128F, Bifidobacterium adolescentis (ADO) y Bifidobacterium dentium (DEN), mediante PCR, en agua residual proveniente de plantas de beneficio de ganado bovino y porcino, de Plantas de Tratamiento de Agua Residual Doméstica (PTARD) y del río Bogotá. Se evidenció que las cepas de Bacteroides GA17 y PZ8 tienen potencial para discriminar la contaminación fecal humana y de porcino respectivamente, en las aguas evaluadas. Con la relación entre colifagos somáticos y fagos que infectan la cepa GA17, de dos unidades, se evidenció que la contaminación del río Bogotá es principalmente de origen humano. Los marcadores moleculares HF183F, ADO y DEN indicaron la presencia de contaminación humana y el marcador CF128F, la presencia de contaminación bovina en las aguas evaluadas. Los resultados obtenidos permiten concluir que los marcadores seleccionados son potencialmente útiles para discriminar el origen de la contaminación fecal en el río Bogotá. |
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Para discriminar el origen de la contaminación fecal, se ha propuesto el uso de marcadores dependientes de cultivo y moleculares que pueden presentar especificidad geográfica, por lo que es necesario identificar aquellos aplicables en nuestro medio. El objetivo de este trabajo fue seleccionar los marcadores cultivables y moleculares para diferenciar el origen de la contaminación fecal en el río Bogotá. Para diferenciar la contaminación de origen porcino, se aisló una cepa a partir de contenido intestinal de porcino identificada como Bacteroides fragilis PZ8. Se evaluaron indicadores no discriminantes: coliformes totales, E. coli, colifagos somáticos y fagos que infectan la cepa de Bacteroides fragilis RYC2056, indicadores discriminantes: fagos que infectan las cepas de Bacteroides thetaiotaomicron GA17 y Bacteroides fragilis PZ8 y marcadores moleculares discriminantes: Bacteroidetes HF183F y CF128F, Bifidobacterium adolescentis (ADO) y Bifidobacterium dentium (DEN), mediante PCR, en agua residual proveniente de plantas de beneficio de ganado bovino y porcino, de Plantas de Tratamiento de Agua Residual Doméstica (PTARD) y del río Bogotá. Se evidenció que las cepas de Bacteroides GA17 y PZ8 tienen potencial para discriminar la contaminación fecal humana y de porcino respectivamente, en las aguas evaluadas. Con la relación entre colifagos somáticos y fagos que infectan la cepa GA17, de dos unidades, se evidenció que la contaminación del río Bogotá es principalmente de origen humano. Los marcadores moleculares HF183F, ADO y DEN indicaron la presencia de contaminación humana y el marcador CF128F, la presencia de contaminación bovina en las aguas evaluadas. Los resultados obtenidos permiten concluir que los marcadores seleccionados son potencialmente útiles para discriminar el origen de la contaminación fecal en el río Bogotá.The detection of intestinal pathogenic microorganisms in water is difficult due to the high cost of testing and the time of analysis. As an alternative, indicator microorganisms are used, which do not differentiate if the contamination is of human or animal fecal origin. To discriminate the origin of fecal contamination, it has been proposed the use of culture-dependent and molecular markers that may present geographic specificity, so it is necessary to identify those applicable in our environment. The objective of this work was to select the cultivable and molecular markers to differentiate the origin of the fecal contamination in the Bogotá river. For this a strain was isolated from porcine intestinal contents identified as Bacteroides fragilis PZ8. Non-discriminatory indicators as: total coliforms, E. coli, somatic coliphages and Bacteroides fragilis phages strain RYC2056, discriminant indicators: Bacteroides thetaiotaomicron strain GA17 and Bacteroides fragilis PZ8 phages, and molecular markers: HF183F, CF128F and Bifidobacterium adolescentis (ADO) and Bifidobacterium dentium (DEN), by PCR, in wastewater from bovine and porcine abattoir, wastewater treatment plants (WWTP) and Bogotá river. It was evidenced that strains GA17 and PZ8 have the potential to discriminate human and porcine fecal contamination, respectively, in the evaluated waters. The relationship between somatic coliphages and phage strain GA17 of two units, showed that the contamination of the Bogotá river is mainly of human origin. The molecular markers HF183F, ADO and DEN indicated the presence of human contamination and the marker CF128F, the presence of bovine contamination in the evaluated waters. The selected markers are potentially useful to discriminate the origin of fecal contamination in the Bogotá river.Magíster en Ciencias BiológicasMaestríaPontificia Universidad JaverianaMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasCampos Pinilla, María ClaudiaDiez Ortega, Hugo2018-11-09T14:08:48Z2020-04-16T19:42:23Z2018-11-09T14:08:48Z2020-04-16T19:42:23Z2017http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríahttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/38611https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.38611instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2reponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2022-04-29T17:32:48Z |