Evaluación de la actividad anti batrachochytrium dendrobatidis por parte de la microbiota presente en la piel de dos especies de ranas andinas

La quitridiomicosis es una de las causas de la extinción masiva de los anfibios a nivel mundial. Pese a la letalidad que ha mostrado esta enfermedad, existen poblaciones de anuros que cohabitan con el hongo que la causa (Batrachochytrium dendrobatidis), sin presentar disminuciones poblacionales. Se...

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Autores:
Escobar Ibarra, Laura Alejandra
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2016
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/17909
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/17909
Palabra clave:
Batrachochytrium dendrobatidis
Quitridiomicosis
Inhibición
Antagonismo
Microbiota
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Biología - Tesis y disertaciones académicas
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description La quitridiomicosis es una de las causas de la extinción masiva de los anfibios a nivel mundial. Pese a la letalidad que ha mostrado esta enfermedad, existen poblaciones de anuros que cohabitan con el hongo que la causa (Batrachochytrium dendrobatidis), sin presentar disminuciones poblacionales. Se cree que la microbiota presente en la piel de estas poblaciones puede presentar un efecto inhibitorio sobre Batrachochytrium dendrobatidis, lo cual explicaría por qué algunos grupos persisten a pesar de la presencia del patógeno. El objetivo de esta investigación fue determinar la actividad anti-Batrachochytrium dendrobatidis de la microbiota cultivable presente en la epidermis de Dendrosophus labialis y Rheobates palmatus, especies que co-ocurren con el hongo en una charca en el municipio de Ubaque, Cundinamarca (Colombia). Para recuperar una mayor diversidad de microorganismos se usaron dos medios de cultivo. Posteriormente, se evaluó la actividad antagónica de las especies aisladas a través de microensayos en placas de Elisa. En total se obtuvieron 615 morfotipos que fueron clasificados mediante MALDITOF y el gen ARNr 16S en 93 especies pertenecientes a 35 géneros, dentro de las que predominan especies pertenecientes a los géneros Pseudomonas, Bacillus, Chryseobacterium, y Arthrobacter. Se calcularon los índices de Shannon y Simpson que indicaron una alta diversidad de especies bacterianas y diferencias entre la composición de la microbiota entre las especies de anuros. En cuanto a las pruebas de antagonismo, el 52% de las especies identificadas presentaron actividad anti-Bd, siendo diferentes entre los estadios de desarrollo y las especies de anuros evaluadas. Esto indicaría que la microbiota epidérmica cultivable tiene una capacidad antifúngica que confiere la resistencia y permite que estas dos especies de anfibios coexistan con el hongo, sin embargo, las especies que cumplen un efecto en la inhibición de Bd varían dependiendo del estadio.
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spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Flechas Hernández, Sandra VictoriaEscobar Ibarra, Laura Alejandra2016-08-10T21:27:04Z2020-04-15T16:11:16Z2016-08-10T21:27:04Z2020-04-15T16:11:16Z2016http://hdl.handle.net/10554/17909instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLa quitridiomicosis es una de las causas de la extinción masiva de los anfibios a nivel mundial. Pese a la letalidad que ha mostrado esta enfermedad, existen poblaciones de anuros que cohabitan con el hongo que la causa (Batrachochytrium dendrobatidis), sin presentar disminuciones poblacionales. Se cree que la microbiota presente en la piel de estas poblaciones puede presentar un efecto inhibitorio sobre Batrachochytrium dendrobatidis, lo cual explicaría por qué algunos grupos persisten a pesar de la presencia del patógeno. El objetivo de esta investigación fue determinar la actividad anti-Batrachochytrium dendrobatidis de la microbiota cultivable presente en la epidermis de Dendrosophus labialis y Rheobates palmatus, especies que co-ocurren con el hongo en una charca en el municipio de Ubaque, Cundinamarca (Colombia). Para recuperar una mayor diversidad de microorganismos se usaron dos medios de cultivo. Posteriormente, se evaluó la actividad antagónica de las especies aisladas a través de microensayos en placas de Elisa. En total se obtuvieron 615 morfotipos que fueron clasificados mediante MALDITOF y el gen ARNr 16S en 93 especies pertenecientes a 35 géneros, dentro de las que predominan especies pertenecientes a los géneros Pseudomonas, Bacillus, Chryseobacterium, y Arthrobacter. Se calcularon los índices de Shannon y Simpson que indicaron una alta diversidad de especies bacterianas y diferencias entre la composición de la microbiota entre las especies de anuros. En cuanto a las pruebas de antagonismo, el 52% de las especies identificadas presentaron actividad anti-Bd, siendo diferentes entre los estadios de desarrollo y las especies de anuros evaluadas. Esto indicaría que la microbiota epidérmica cultivable tiene una capacidad antifúngica que confiere la resistencia y permite que estas dos especies de anfibios coexistan con el hongo, sin embargo, las especies que cumplen un efecto en la inhibición de Bd varían dependiendo del estadio.Chytridiomycosis is one of the causes of the massive extinction of amphibians worldwide. Despite the lethality that this disease has shown, there are some frog species that coexist with the fungus that causes it (Batrachochytrium dendrobatidis}, without showing population declines. It is believed that the microbiota present in the skin of these frogs may have an inhibitory effect on Batrachochytrium, which would explain why some populations persist despite the presence of the pathogen. The objective of this research was to determine the anti-Batrachochytrium dendrobatidis activity from the cultivable microbiota present in the epidermis of Dendropsophus labialis and Rheobates palmatus, species that co-occur with the fungus in a pond in Ubaque city, Cundinamarca (Colombia). To recover a greater diversity of microorganisms, two culture medium were used. Subsequently, the antagonistic activity of the species isolated through microarray ELISA plates was evaluated. In total 615 morphotypes were obtained and then classified by MALDI TOF and 16S rRNA gene in 93 species belonging to 35 genera. Species belonging to the genera Pseudomonas, Bacillus, Chryseobacterium, and Arthrobacter were dominant. The Shannon and Simpson indices that indicated high diversity of bacterial species and differences between the compositions of the microbiota between species of frogs. For antagonism test, 52% of the identified species had anti-Bd activity, being different between the stages of development and species of frogs. This would indicate that epidermal cultivable microbiota has an antifungal capacity that conferred resistance to the disease and allows these two amphibian species coexist with the fungus, however, the bacterian species that play an inhibiting effect varies depending on the stage.Biólogo (a)PregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaBiologíaFacultad de CienciasBatrachochytrium dendrobatidisQuitridiomicosisInhibiciónAntagonismoMicrobiotaBatrachochytrium dendrobatidisQuitridiomicosisInhibiciónAntagonismoMicrobiotaBiología - Tesis y disertaciones académicasEvaluación de la actividad anti batrachochytrium dendrobatidis por parte de la microbiota presente en la piel de dos especies de ranas andinasTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALEscobarIbarraLauraAlejandra2016.pdfEscobarIbarraLauraAlejandra2016.pdfDocumentoapplication/pdf2409562http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/17909/3/EscobarIbarraLauraAlejandra2016.pdf2ce4c601a9372858e227749c00e16fe9MD53open accessEscobarIbarraLauraAlejandra2016 2.pdfEscobarIbarraLauraAlejandra2016 2.pdfLicencia de usoapplication/pdf775590http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/17909/4/EscobarIbarraLauraAlejandra2016%202.pdfdfecba65c99685074a26083005441fcfMD54metadata only accessTHUMBNAILEscobarIbarraLauraAlejandra2016.pdf.jpgEscobarIbarraLauraAlejandra2016.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5770http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/17909/5/EscobarIbarraLauraAlejandra2016.pdf.jpgc877c87141865a68cdeb48219ed4c093MD55open accessEscobarIbarraLauraAlejandra2016 2.pdf.jpgEscobarIbarraLauraAlejandra2016 2.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8900http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/17909/6/EscobarIbarraLauraAlejandra2016%202.pdf.jpg5af4d0593fdf4c62a6157ad8876c05e7MD56open access10554/17909oai:repository.javeriana.edu.co:10554/179092022-05-03 14:43:54.466Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.co