Clonación, secuenciación y caracterización bioinformática de candidatos A microRNAs de yuca (Manihot esculenta Crantz Var. Tai 16)
Los microRNAs (miRNAs) son smallRNAs endógenos que regulan la expresión de genes en plantas y animales. Estos RNAs de ~21 nucleótidos son sintetizados a partir de secuencias intrónicas o a partir de genes de microRNAs por la RNA pol II, cuyo precursor forma una estructura tallo y asa, el cual es a s...
- Autores:
-
Ballén Taborda, Ana Carolina
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2009
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/14565
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/14565
- Palabra clave:
- MicroRNAs
RNA silencing
ARN
Biología - Tesis y disertaciones académicas
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Los microRNAs (miRNAs) son smallRNAs endógenos que regulan la expresión de genes en plantas y animales. Estos RNAs de ~21 nucleótidos son sintetizados a partir de secuencias intrónicas o a partir de genes de microRNAs por la RNA pol II, cuyo precursor forma una estructura tallo y asa, el cual es a su vez procesado por la enzima Dicer 1 hasta secuencias más cortas que son reclutadas por el complejo RISC, el cual dirige la degradación de mRNAs blanco. Estos pequeños transcritos han sido descubiertos mediante predicciones bioinformáticas o mediante su clonación y secuenciación, y se ha visto que los miRNAs en plantas están involucrados en múltiples procesos biológicos, incluyendo diferenciación celular, desarrollo de órganos, cambios de fases, señalización, respuesta a estrés biótico y abiótico, entre otros. Por otro lado, la yuca (Manihot esculenta Crantz) es considerada como uno de los cultivos más importantes en las regiones tropicales del mundo. En este sentido, este estudio representa el primer esfuerzo por identificar miRNAs en yuca a través de una aproximación experimental (clonación y secuenciación) y posterior análisis bioinformático, en el cual se obtuvieron secuencias en 6 familias diferentes, una de las cuales, fue validada como candidato a microRNA basada en el genoma de Ricinus communis. Esta secuencia puede ser un transcrito cuyo origen es a partir de transposones, por lo que se explicaría el porqué está presente en la mayoría de los clones secuenciados y podría estar involucrada con procesos asociados a la fotosíntesis. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Tohme, JoeTerán Pérez, WilsonBallén Taborda, Ana Carolina2015-02-02T17:21:56Z2016-03-29T14:27:46Z2020-04-15T16:12:48Z2015-02-02T17:21:56Z2016-03-29T14:27:46Z2020-04-15T16:12:48Z2009http://hdl.handle.net/10554/14565instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLos microRNAs (miRNAs) son smallRNAs endógenos que regulan la expresión de genes en plantas y animales. Estos RNAs de ~21 nucleótidos son sintetizados a partir de secuencias intrónicas o a partir de genes de microRNAs por la RNA pol II, cuyo precursor forma una estructura tallo y asa, el cual es a su vez procesado por la enzima Dicer 1 hasta secuencias más cortas que son reclutadas por el complejo RISC, el cual dirige la degradación de mRNAs blanco. Estos pequeños transcritos han sido descubiertos mediante predicciones bioinformáticas o mediante su clonación y secuenciación, y se ha visto que los miRNAs en plantas están involucrados en múltiples procesos biológicos, incluyendo diferenciación celular, desarrollo de órganos, cambios de fases, señalización, respuesta a estrés biótico y abiótico, entre otros. Por otro lado, la yuca (Manihot esculenta Crantz) es considerada como uno de los cultivos más importantes en las regiones tropicales del mundo. En este sentido, este estudio representa el primer esfuerzo por identificar miRNAs en yuca a través de una aproximación experimental (clonación y secuenciación) y posterior análisis bioinformático, en el cual se obtuvieron secuencias en 6 familias diferentes, una de las cuales, fue validada como candidato a microRNA basada en el genoma de Ricinus communis. Esta secuencia puede ser un transcrito cuyo origen es a partir de transposones, por lo que se explicaría el porqué está presente en la mayoría de los clones secuenciados y podría estar involucrada con procesos asociados a la fotosíntesis.MicroRNAs (miRNAs) are endogenous smallRNAs that regulate gene expression in plants and animals. These RNAs of ~21 nucleotides are synthesized from intron sequences or microRNA s genes for the RNA pol II, which form a precursor stemloop structure, which is in turn processed by the enzyme Dicer 1 to shorter sequences who are loaded into silencing complex RISC, where directs the degradation of target mRNAs. MiRNAs have been discovered using two basic approaches: bioinformatic prediction and direct cloning and sequencing, and lots of investigations indicate that are involved in multiple biological processes, including stem cell differentiation, organ development, phase change, signalling and response to biotic and abiotic environmental stresses. In other hand, cassava (Manihot esculenta Crantz) is considered one of the most important crops in tropical regions of the world. Thus, this study represents the first effort to identify miRNAs in cassava through an experimental approach (cloning and sequencing) and bioinformatic analysis, in which were obtained sequences in 6 different families, but only one, was validated as a candidate microRNA based on Ricinus communis genome. This sequence could be transcribed from transposons, which explain why it is present in the majority of clones sequenced and this sequence might be involved in processes associated with photosynthesis.Biólogo (a)PregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaBiologíaFacultad de CienciasMicroRNAsRNA silencingARNBiología - Tesis y disertaciones académicasClonación, secuenciación y caracterización bioinformática de candidatos A microRNAs de yuca (Manihot esculenta Crantz Var. Tai 16)Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALBallenTabordaAnaCarolina2009.pdfapplication/pdf1085532http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/14565/1/BallenTabordaAnaCarolina2009.pdfe35d3510b918f4362dcf894f7987fc41MD51open accessTHUMBNAILBallenTabordaAnaCarolina2009.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2416http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/14565/2/BallenTabordaAnaCarolina2009.pdf.jpg314be53dcf7422961ba96adcc9b86586MD52open access10554/14565oai:repository.javeriana.edu.co:10554/145652022-05-03 09:01:49.634Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.co |