Automatic quantitative susceptibility mapping for iron accumulation assessment in motor neuron disease
La enfermedad de la motoneurona (EMN) es un trastorno neurodegenerativo caracterizado por la degeneración de la motoneurona superior y/o inferior, asociado con el aumento de la concentración de hierro en el cerebro. Esta patología fatal está distribuida uniformemente en la población mundial con alto...
- Autores:
-
Sanmiguel Serpa, Luis Carlos
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/56782
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/56782
- Palabra clave:
- Resonancia magnética
Neuroradiología
Esclerosis lateral amiotrófica
Segmentación cerebral
Enfermedad de la motoneurona
Magnetic resonance
Neuroradiology
Amyotrophic lateral sclerosis
Brain segmentation
Motor neuron disease
Ingeniería electrónica - Tesis y disertaciones académicas
Resonancia magnética
Neurorradiografía
Mejoramiento de procesos
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- openAccess
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- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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La enfermedad de la motoneurona (EMN) es un trastorno neurodegenerativo caracterizado por la degeneración de la motoneurona superior y/o inferior, asociado con el aumento de la concentración de hierro en el cerebro. Esta patología fatal está distribuida uniformemente en la población mundial con altos índices de mortalidad. Hemos implementado una serie de pasos automáticos en grado de analizar imágenes por resonancia magnética para cuantificar la susceptibilidad magnética de la corteza motora. El procesamiento incluyó el uso de FreeSurfer para segmentar automáticamente el cerebro, además el algoritmo Quantitative Susceptibiltiy Mapping y el algoritmo de reducción de artefactos de rayas. La oblicuidad de la distribución de la susceptibilidad en la sustancia gris y la media de la susceptibilidad en la sustancia blanca adyacente mostraron anomalías en pacientes con EMN. Además, la susceptibilidad media en la sustancia blanca presentó una correlación con la duración de la enfermedad y con el puntaje clínico funcional. La serie de pasos acá presentados puede ser fácilmente adaptada para cuantificar la susceptibilidad magnética en cualquier región del cerebro para cualquier enfermedad neurodegenerativa. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Bianchi, Anna MaríaContarino, Valeria ElisaSanmiguel Serpa, Luis Carlos2021-08-31T17:56:40Z2021-08-31T17:56:40Z2018http://hdl.handle.net/10554/56782instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLa enfermedad de la motoneurona (EMN) es un trastorno neurodegenerativo caracterizado por la degeneración de la motoneurona superior y/o inferior, asociado con el aumento de la concentración de hierro en el cerebro. Esta patología fatal está distribuida uniformemente en la población mundial con altos índices de mortalidad. Hemos implementado una serie de pasos automáticos en grado de analizar imágenes por resonancia magnética para cuantificar la susceptibilidad magnética de la corteza motora. El procesamiento incluyó el uso de FreeSurfer para segmentar automáticamente el cerebro, además el algoritmo Quantitative Susceptibiltiy Mapping y el algoritmo de reducción de artefactos de rayas. La oblicuidad de la distribución de la susceptibilidad en la sustancia gris y la media de la susceptibilidad en la sustancia blanca adyacente mostraron anomalías en pacientes con EMN. Además, la susceptibilidad media en la sustancia blanca presentó una correlación con la duración de la enfermedad y con el puntaje clínico funcional. La serie de pasos acá presentados puede ser fácilmente adaptada para cuantificar la susceptibilidad magnética en cualquier región del cerebro para cualquier enfermedad neurodegenerativa.Motor Neuron Disease (MND) is a rapidly progressive neurodegenerative disorder characterized by degeneration of upper and/or lower motor neurons associated to iron overload in the brain. This fatal pathology is evenly distributed over the world with high mortality rates. We implemented a fully automatic pipeline able to analyze Magnetic Resonance images to quantify magnetic susceptibility in the motor cortex. Processing included FreeSurfer automatic segmentation of the brain and quantitative susceptibility mapping with Streaking artifact reduction algorithm. Both susceptibility skewness in gray matter and mean susceptibility measurements in adjacent white matter showed sensibility to anomalies in MND patients. Furthermore, mean susceptibility white matter correlated with disease duration and clinical functional score. The here presented pipeline might be easily adapted to automatically quantify magnetic susceptibility in every brain region in MND or any other neurodegenerative disease.Ingeniero (a) ElectrónicoPregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaIngeniería ElectrónicaFacultad de IngenieríaResonancia magnéticaNeuroradiologíaEsclerosis lateral amiotróficaSegmentación cerebralEnfermedad de la motoneuronaMagnetic resonanceNeuroradiologyAmyotrophic lateral sclerosisBrain segmentationMotor neuron diseaseIngeniería electrónica - Tesis y disertaciones académicasResonancia magnéticaNeurorradiografíaMejoramiento de procesosAutomatic quantitative susceptibility mapping for iron accumulation assessment in motor neuron diseaseTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALMSC_THESIS.pdfMSC_THESIS.pdfDocumentoapplication/pdf2203469http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/56782/1/MSC_THESIS.pdfdfd48ebda95171e65cdfd1dbdcfb37b1MD51open accessBinder1.pdfBinder1.pdfLicencia de usoapplication/pdf158333http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/56782/2/Binder1.pdf63c16f44e81d5e610449ee56a3541b63MD52open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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