Límites de especies en el complejo Leucostethus fraterdanieli (Silverstone 1971) (Anura : dendrobatidae) a partir del análisis filogenético molecular, morfológico y cantos

Los “complejos de especies” son asunciones taxonomicas a partir del estudio de diversas especies que no presentan claras diferencias ya sean, por características, elementos o caracteres morfológicos, distribución, comportamiento, ecología, diferencias a nivel molecular entre otras, que permitan reco...

Full description

Autores:
Rodriguez Suárez, Geven Erasmo
Tipo de recurso:
Doctoral thesis
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/51325
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/51325
https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.51325
Palabra clave:
Taxonomía y Sistemática
Filogenia
Leucostethus
Complejo de especies
Anura
Taxonomy and Systematic
Phylogeny
Leucostethus
Species complex
Anura
Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Filogenia - Colombia
Anuros - Colombia
Análisis cladístico - Colombia
Morfología (Biología)
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openAccess
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Sánchez Pacheco, Santiago
Daza, Juan M.
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Rivera Correa, Mauricio
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description Los “complejos de especies” son asunciones taxonomicas a partir del estudio de diversas especies que no presentan claras diferencias ya sean, por características, elementos o caracteres morfológicos, distribución, comportamiento, ecología, diferencias a nivel molecular entre otras, que permitan reconocer claramente grupos monofiléticos. El complejo Leucostethus fraterdanieli contiene a las especies de L. brachistriatus, L. yaguara, L. alacris y a la especie por la cual tomó su nombre. El presente trabajo se propuso explorar las relaciones filogenéticas de las especies del complejo L. fraterdanieli empleando herramientas moleculares y contrastando estos datos con análisis de cantos y morfometría, en las localidades tipo y en otras localidades adicionales donde habían sido reportadas las especies del complejo. Leucostethus alacris no se incluyó en este estudio porque no pudo ser colectada por razones de orden público en la localidad tipo. Se emplearon para los análisis moleculares cuatro regiones del ADN mitocondrial usadas previamente en estudios con dendrobátidos: H1 (compuesto por los fragmentos: 12S y 16S), COI y Cytb. Para los cantos de anuncio se analizaron las siguientes variables: duración del canto, duración del silencio (intervalo entre cantos), frecuencia fundamental o dominante, baja frecuencia, alta frecuencia, tasa de llamadas o número de llamados/minuto y armónicos. Se tomaron 13 medidas morfométricas a todos los individuos colectados para establecer diferencias entre poblaciones y entre machos y hembras. Adicionalmente, se visitaron diferentes colecciones zoológicas para realizar estas mismas mediciones. Los resultados moleculares demostraron la monofilia de L. brachistriatus y L. yaguara, así como la ocurrencia de dos nuevos clados L. sp. “Bitaco” y L. sp. “Chachagüí”, los cuales habían sido referidos en la última revisión de la familia Dendrobatidae y también en el trabajo que describió a L. jota, pero que no habían sido estudiados a profundidad con ejemplares de las localidades tipo, ni abarcando toda el área de la distribución del complejo de especies. Los datos moleculares también permitieron demostrar que los topotipos de Leucostethus fraterdanieli conformaron una especie válida monofilética que fue el grupo hermano de dos clados: el primero, compuesto por L. ramirezi y el otro, compuesto por una politomía compuesta por los topotipos de L. brachistriatus, L. yaguara y demás individuos colectados en diferentes localidades de siete departamentos de Colombia en los que había sido reportados individuos correspondientes a la especie L. fraterdanieli. Leucostethus sp. “Gorgona”, especie aún sin publicar pero que se sabe es una especie presente en la Isla Gorgona, fue el grupo hermano de los clados L. fraterdanieli, L. ramirezi y L. brachistriatus. Los datos morfológicos no arrojaron diferencias que permitieran corroborar o refutar los resultados moleculares referentes a las agrupaciones de la politomía y de la monofilia de Leucostethus fraterdanieli. Los cantos de los topotipos de L. brachistriatus y L. yaguara no fueron diferentes con relación al canto de los topotipos de L. fraterdanieli.
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spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Bolivar-García, WilmarRodriguez Suárez, Geven ErasmoRada-García, Marco AntonioSánchez Pacheco, SantiagoDaza, Juan M.Amézquita Torres, AdolfoRivera Correa, MauricioColcienciasColombia2018-2019Antioquia (Colombia)Cauca (Colombia)Nariño (Colombia)Quindío (Colombia)Risaralda (Colombia)Valle del Cauca (Colombia)2020-10-09T18:49:45Z2020-10-09T18:49:45Z2020-01-28http://hdl.handle.net/10554/51325https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.51325instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLos “complejos de especies” son asunciones taxonomicas a partir del estudio de diversas especies que no presentan claras diferencias ya sean, por características, elementos o caracteres morfológicos, distribución, comportamiento, ecología, diferencias a nivel molecular entre otras, que permitan reconocer claramente grupos monofiléticos. El complejo Leucostethus fraterdanieli contiene a las especies de L. brachistriatus, L. yaguara, L. alacris y a la especie por la cual tomó su nombre. El presente trabajo se propuso explorar las relaciones filogenéticas de las especies del complejo L. fraterdanieli empleando herramientas moleculares y contrastando estos datos con análisis de cantos y morfometría, en las localidades tipo y en otras localidades adicionales donde habían sido reportadas las especies del complejo. Leucostethus alacris no se incluyó en este estudio porque no pudo ser colectada por razones de orden público en la localidad tipo. Se emplearon para los análisis moleculares cuatro regiones del ADN mitocondrial usadas previamente en estudios con dendrobátidos: H1 (compuesto por los fragmentos: 12S y 16S), COI y Cytb. Para los cantos de anuncio se analizaron las siguientes variables: duración del canto, duración del silencio (intervalo entre cantos), frecuencia fundamental o dominante, baja frecuencia, alta frecuencia, tasa de llamadas o número de llamados/minuto y armónicos. Se tomaron 13 medidas morfométricas a todos los individuos colectados para establecer diferencias entre poblaciones y entre machos y hembras. Adicionalmente, se visitaron diferentes colecciones zoológicas para realizar estas mismas mediciones. Los resultados moleculares demostraron la monofilia de L. brachistriatus y L. yaguara, así como la ocurrencia de dos nuevos clados L. sp. “Bitaco” y L. sp. “Chachagüí”, los cuales habían sido referidos en la última revisión de la familia Dendrobatidae y también en el trabajo que describió a L. jota, pero que no habían sido estudiados a profundidad con ejemplares de las localidades tipo, ni abarcando toda el área de la distribución del complejo de especies. Los datos moleculares también permitieron demostrar que los topotipos de Leucostethus fraterdanieli conformaron una especie válida monofilética que fue el grupo hermano de dos clados: el primero, compuesto por L. ramirezi y el otro, compuesto por una politomía compuesta por los topotipos de L. brachistriatus, L. yaguara y demás individuos colectados en diferentes localidades de siete departamentos de Colombia en los que había sido reportados individuos correspondientes a la especie L. fraterdanieli. Leucostethus sp. “Gorgona”, especie aún sin publicar pero que se sabe es una especie presente en la Isla Gorgona, fue el grupo hermano de los clados L. fraterdanieli, L. ramirezi y L. brachistriatus. Los datos morfológicos no arrojaron diferencias que permitieran corroborar o refutar los resultados moleculares referentes a las agrupaciones de la politomía y de la monofilia de Leucostethus fraterdanieli. Los cantos de los topotipos de L. brachistriatus y L. yaguara no fueron diferentes con relación al canto de los topotipos de L. fraterdanieli.Colciencias"Species complex" are taxonomic assumptions from the study of various species that do not present clear differences, whether by characteristics, elements or morphological characters, distribution, behavior, ecology, differences at the molecular level, among others, that allow to clearly recognize groups monophyletic. The Leucostethus fraterdanieli complex contains the species of L. brachistriatus, Colostethus yaguara, L. alacris and the species for which took its name. The present work set out to explore the phylogenetic relationships of the species of the L. fraterdanieli complex using molecular tools and contrasting these data with edge analysis and morphometry, in the type localities and in other additional localities where the species of the complex had been reported. L. alacris was not included in this study because it could not be collected for reasons of public order in the type locality. Four regions of the mitochondrial DNA previously used in dendrobatide studies were used for molecular analyzes: H1 (made up of fragments: 12S and 16S), COI and Cytb. For the announcement songs, the following variables were analyzed: call duration, silence duration (interval between calls), fundamental or dominant frequency, low frequency, high frequency, call rate or number of calls/minute and harmonics. Thirteen morphometric measurements were taken to all the collected individuals to establish differences between populations and between males and females. Additionally, different zoological collections were visited to make these same measurements. The molecular results demonstrated the monophilia of L. brachistriatus and L. yaguara, as well as the occurrence of two new clades L. sp. "Bitaco" and L. sp. “Chachagüí”, which had been mentioned in the last revision of the Dendrobatidae family and also in the work that described L. jota, but which had not been studied in depth with specimens from the type localities, nor covering the entire area of the distribution of the species complex. The molecular evidence showed also that the topotypes of L. fraterdanieli formed a valid monophyletic species that was the sister group of two clades: the first, consisting of L. ramirezi, and the other, consisting of a polytomy composed of L. brachistriatus topotypes and conspecifics individuals, L. yaguara and other individuals collected in different localities of seven departments of Colombia in which individuals of L. fraterdanieli had been reported. L. sp. “Gorgona”, a species not yet published but known to be a species present on Gorgona Island, was the sister group of the clades L. fraterdanieli, L. ramirezi and L. brachistriatus. The morphological data did not show differences that allowed to corroborate or refute the molecular results referring to the polytomy and monophilia groups of L.s fraterdanieli. The calls of the L. brachistriatus and L. yaguara topotypes were not different respect to the calls of the L. fraterdanieli topotypes.Doctor en Ciencias BiológicasDoctoradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaDoctorado en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasTaxonomía y SistemáticaFilogeniaLeucostethusComplejo de especiesAnuraTaxonomy and SystematicPhylogenyLeucostethusSpecies complexAnuraDoctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasFilogenia - ColombiaAnuros - ColombiaAnálisis cladístico - ColombiaMorfología (Biología)Límites de especies en el complejo Leucostethus fraterdanieli (Silverstone 1971) (Anura : dendrobatidae) a partir del análisis filogenético molecular, morfológico y cantosSpecies limits in the Leucostethus fraterdanieli complex (Silverstone 1971) (Anura : dendrobatidae) based on molecular philogenetic, morphological and song analysisTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisORIGINALTG.pdfTG.pdfDocumentoapplication/pdf8441463http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/3/TG.pdf02b9d15af445025bdd0ac0de0cc6a619MD53open accessChapter_10.pdfChapter_10.pdfCapítulo 10application/pdf1379580http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/5/Chapter_10.pdf8f42685db094f12313f5ed2c869fff26MD55embargoed access|||9999-11-20Chapter_13.pdfChapter_13.pdfCapítulo 13application/pdf1321910http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/6/Chapter_13.pdf6a7d1d11af1793654d736c0dd98e32d1MD56embargoed access|||9999-11-20Licencia de uso.pdfLicencia de uso.pdfapplication/pdf980288http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/4/Licencia%20de%20uso.pdf620fbd3db81938a4a3547e3977000e0fMD54metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82603http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/2/license.txt2070d280cc89439d983d9eee1b17df53MD52open accessTHUMBNAILTG.pdf.jpgTG.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5710http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/7/TG.pdf.jpge2e30b197f17cdd7a5d4a4548a39517bMD57open accessChapter_10.pdf.jpgChapter_10.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6679http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/8/Chapter_10.pdf.jpgb5732e31f4cfb97e58682dd442728d05MD58open accessChapter_13.pdf.jpgChapter_13.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7399http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/9/Chapter_13.pdf.jpg0fb8e83496f5f70ead0e2651480ef1bdMD59open accessLicencia de uso.pdf.jpgLicencia de uso.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7414http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/51325/10/Licencia%20de%20uso.pdf.jpg9d23033605c6b75bca075d20b9cf80c7MD510open access10554/51325oai:repository.javeriana.edu.co:10554/513252022-04-29 14:20:19.422Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.coTElDRU5DSUEgWSBBVVRPUklaQUNJw5NOIERFIExPUyBBVVRPUkVTIFBBUkEgUFVCTElDQVIgWSBQRVJNSVRJUiBMQSBDT05TVUxUQSBZIFVTTy4KClBhcnRlIDEuIFTDqXJtaW5vcyBkZSBsYSBsaWNlbmNpYSBnZW5lcmFsIHBhcmEgcHVibGljYWNpw7NuIGRlIG9icmFzIGVuIGVsIHJlcG9zaXRvcmlvIGluc3RpdHVjaW9uYWwKQ29tbyB0aXR1bGFyIChlcykgZGVsIGRlcmVjaG8gZGUgYXV0b3IsIGNvbmZpZXJvIChlcmltb3MpIGEgbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgdW5hIGxpY2VuY2lhIG5vIGV4Y2x1c2l2YSwgbGltaXRhZGEgeSBncmF0dWl0YSBzb2JyZSBsYSBvYnJhIHF1ZSBzZSBpbnRlZ3JhcsOhIGVuIGVsIFJlcG9zaXRvcmlvIEluc3RpdHVjaW9uYWwsIHF1ZSBzZSBhanVzdGEgYSBsYXMgc2lndWllbnRlcyBjYXJhY3RlcsOtc3RpY2FzOgphKSAgICAgIEVzdGFyw6EgdmlnZW50ZSBhIHBhcnRpciBkZSBsYSBmZWNoYSBkZSBpbmNsdXNpw7NuIGVuIGVsIHJlcG9zaXRvcmlvLCBwb3IgdW4gcGxhem8gZGUgNSBhw7FvcywgcXVlIHNlcsOhbiBwcm9ycm9nYWJsZXMgaW5kZWZpbmlkYW1lbnRlIHBvciBlbCB0aWVtcG8gcXVlIGR1cmUgZWwgZGVyZWNobyBwYXRyaW1vbmlhbCBkZWwgYXV0b3IuIEVsIGF1dG9yIHBvZHLDoSBkYXIgcG9yIHRlcm1pbmFkYSBsYSBsaWNlbmNpYSBzb2xpY2l0w6FuZG9sbyBhIGxhIFVuaXZlcnNpZGFkIHBvciBlc2NyaXRvLgpiKSAgICAgIEF1dG9yaXphIGEgbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgYSBwdWJsaWNhciBsYSBvYnJhIGVuIGRpZ2l0YWwsIGNvbm9jaWVuZG8gcXVlLCBkYWRvIHF1ZSBzZSBwdWJsaWNhIGVuIEludGVybmV0LCBwb3IgZXN0ZSBoZWNobyBjaXJjdWxhIGNvbiB1biBhbGNhbmNlIG11bmRpYWwuCmMpICAgICAgTG9zIGF1dG9yZXMgYWNlcHRhbiBxdWUgbGEgYXV0b3JpemFjacOzbiBzZSBoYWNlIGEgdMOtdHVsbyBncmF0dWl0bywgcG9yIGxvIHRhbnRvIHJlbnVuY2lhbiBhIHJlY2liaXIgYmVuZWZpY2lvIGFsZ3VubyBwb3IgbGEgcHVibGljYWNpw7NuLCBkaXN0cmlidWNpw7NuLCBjb211bmljYWNpw7NuIHDDumJsaWNhIHkgY3VhbHF1aWVyIG90cm8gdXNvIHF1ZSBzZSBoYWdhIGVuIGxvcyB0w6lybWlub3MgZGUgbGEgcHJlc2VudGUgbGljZW5jaWEgeSBkZSBsYSBsaWNlbmNpYSBkZSB1c28gY29uIHF1ZSBzZSBwdWJsaWNhLgpkKSAgICAgIExvcyBhdXRvcmVzIG1hbmlmaWVzdGFuIHF1ZSBzZSB0cmF0YSBkZSB1bmEgb2JyYSBvcmlnaW5hbCBzb2JyZSBsYSBxdWUgdGllbmVuIGxvcyBkZXJlY2hvcyBxdWUgYXV0b3JpemFuIHkgcXVlIHNvbiBlbGxvcyBxdWllbmVzIGFzdW1lbiB0b3RhbCByZXNwb25zYWJpbGlkYWQgcG9yIGVsIGNvbnRlbmlkbyBkZSBzdSBvYnJhIGFudGUgbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgeSBhbnRlIHRlcmNlcm9zLiBFbiB0b2RvIGNhc28gbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgc2UgY29tcHJvbWV0ZSBhIGluZGljYXIgc2llbXByZSBsYSBhdXRvcsOtYSBpbmNsdXllbmRvIGVsIG5vbWJyZSBkZWwgYXV0b3IgeSBsYSBmZWNoYSBkZSBwdWJsaWNhY2nDs24uCmUpICAgICAgQXV0b3Jpem8gKGFtb3MpIGEgbGEgVW5pdmVyc2lkYWQgcGFyYSBpbmNsdWlyIGxhIG9icmEgZW4gbG9zIMOtbmRpY2VzIHkgYnVzY2Fkb3JlcyBxdWUgZXN0aW1lbiBuZWNlc2FyaW9zIHBhcmEgcHJvbW92ZXIgc3UgZGlmdXNpw7NuLgpmKSAgICAgIEFjZXB0byAoYW1vcykgcXVlIGxhIFBvbnRpZmljaWEgVW5pdmVyc2lkYWQgSmF2ZXJpYW5hIHB1ZWRhIGNvbnZlcnRpciBlbCBkb2N1bWVudG8gYSBjdWFscXVpZXIgbWVkaW8gbyBmb3JtYXRvIHBhcmEgcHJvcMOzc2l0b3MgZGUgcHJlc2VydmFjacOzbiBkaWdpdGFsLgpnKSAgICAgIEF1dG9yaXpvIChhbW9zKSBxdWUgbGEgb2JyYSBzZWEgcHVlc3RhIGEgZGlzcG9zaWNpw7NuIGRlbCBww7pibGljbyBlbiBsb3MgdMOpcm1pbm9zIGF1dG9yaXphZG9zIGVuIGxvcyBsaXRlcmFsZXMgYW50ZXJpb3JlcyBiYWpvIGxvcyBsw61taXRlcyBkZWZpbmlkb3MgcG9yIGxhIHVuaXZlcnNpZGFkIGVuIGxhcyDigJxDb25kaWNpb25lcyBkZSB1c28gZGUgZXN0cmljdG8gY3VtcGxpbWllbnRv4oCdIGRlIGxvcyByZWN1cnNvcyBwdWJsaWNhZG9zIGVuIFJlcG9zaXRvcmlvIEluc3RpdHVjaW9uYWwgUFVKICwgY3V5byB0ZXh0byBjb21wbGV0byBzZSBwdWVkZSBjb25zdWx0YXIgZW4gaHR0cDovL3JlcG9zaXRvcnkuamF2ZXJpYW5hLmVkdS5jby8KClNJIEVMIERPQ1VNRU5UTyBTRSBCQVNBIEVOIFVOIFRSQUJBSk8gUVVFIEhBIFNJRE8gUEFUUk9DSU5BRE8gTyBBUE9ZQURPIFBPUiBVTkEgQUdFTkNJQSBPIFVOQSBPUkdBTklaQUNJw5NOLCBDT04gRVhDRVBDScOTTiBERSBMQSBQT05USUZJQ0lBIFVOSVZFUlNJREFEIEpBVkVSSUFOQSwgRUwgKExPUykgQVVUT1IoRVMpIEdBUkFOVElaQShNT1MpIFFVRSBTRSBIQSBDVU1QTElETyBDT04gTE9TIERFUkVDSE9TIFkgT0JMSUdBQ0lPTkVTIFJFUVVFUklET1MgUE9SIEVMIFJFU1BFQ1RJVk8gQ09OVFJBVE8gTyBBQ1VFUkRPLgo=