Influencia de los iones Mg+2 sobre la interacción entre el ácido 3,5- dicafeoilquínico y la integrasa del HTLV-I.

Objetivo: Usando simulação molecular, estudamos a influência dos íons Mg2+ na interação do domínio catalítico da integrase HTLV-I (IN) (modelado por homologia) com o ácido 3,5-dicafeoilquínico (3,5-diCQA). Materiais e métodos: O modelo de homologia da HTLV-I IN foi construído utilizando como fôrma a estrutura cristalina da IN de vírus do sarcoma aviário (VSA, pdb: 1VSD). Para analisar o papel dos íons Mg2+ na interação com o 3,5-diCQA e a integrase, três modelos foram criados: i) na ausência de íons Mg2+, ii) com um íon Mg2+ coordenado com Asp15 e Asp72 e, iii) com dois íons Mg2+ coordenados com Asp15-Asp72 e Asp72-Glu108. As forças de interação e a energia livre de ligação entre o 3,5-diCQA e a HTLV-I IN foram calculadas nos três modelos. Resultados: A pontuação mais baixa no docking e a menor energia livre foram obtidas para o modelo com um único íon de Mg2+. O Mg2+ afeta fortemente o acoplamento do inibidor 3,5-diCQA com o domínio catalítico da HTLV-I IN, revelando uma forte interação entre o complexo ligando-proteína que é independente do sítio catalítico dos três modelos utilizados. Conclusão: Os resultados sugerem que a presença de um íon Mg2+ poderia aumentar a interação no complexo devido à diminuição da energia livre, aumentando assim a afinidade. Assim, propomos ao 3,5-diCQA como farmacóforo para a fabricação de medicamentos antirretrovirais.Palavras-chave: ácido 3,5-dicafeoilquínico (3,5-diCQA). Integrase linfotropica-T humana Tipo I (HTLV-1), integrase (IN), Modelo por homologia, Molecular Docking, Energia livre de ligação, íons Mg2+.

• Autores: Peña, Ángela; Laboratorio de biología molecular y patogénesis. Departamento de ciencias fisiológicas. Escuela de ciencias básicas. Departamento de Salud. Universidad del Valle. Sede San Fernando. Cali, Colombia.; Yosa, Juvenal; Universidad Distrital Francisco José de Caldas. Facultad de ciencias ambientales. Ingeniería ambiental. Av. Circunvalar Venado de Oro., Bogotá, Colombia.; Cuesta-Astroz, Yesid; Laboratorio de biología molecular y patogénesis. Departamento de ciencias fisiológicas. Escuela de ciencias básicas. Departamento de Salud. Universidad del Valle. Sede San Fernando. Cali, Colombia.; Acevedo, Orlando; Laboratorio de bioquímica computacional y estructural y bioinformática. Departamento de nutrición y Bioquímica. Facultad de ciencias. Pontificia Universidad Javeriana. Bogotá, D,C. Colombia; Lareo, Leonardo; En Paz Descanse, Rest in Peace; García-Vallejo, Felipe; Laboratorio de biología molecular y patogénesis. Departamento de ciencias fisiológicas. Escuela de ciencias básicas. Departamento de Salud. Universidad del Valle. Sede San Fernando. Cali, Colombia.
• Tipo de recurso: Article of journal
• Fecha de publicación: 2012
• Institución: Pontificia Universidad Javeriana
• Repositorio: Repositorio Universidad Javeriana
• Idioma: eng
• OAI Identifier: oai:repository.javeriana.edu.co:10554/31253
• Acceso en línea: http://revistas.javeriana.edu.co/index.php/scientarium/article/view/2477; http://hdl.handle.net/10554/31253
• Palabra clave: null; 3,5 -Dicaffeoylquinic Acid, Human T-Lymphotropic Type I (HTLV-1), Integrase (IN), Homology Model, Molecular Docking, Binding Free Energy, Mg2+ Ions; null
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional