Filogeografía comparada de peces de agua dulce en el noroccidente de Sur América y la baja América Central
Los estudios filogeográficos identifican cómo reconfiguraciones del paisaje y variaciones climáticas interactúan con las especies o comunidades de especies en regiones específicas y como esta interacción ha podido influenciar los procesos de diversificación. En los últimos años, la filogeografía se...
- Autores:
-
Rincón Sandoval, Cindy Melissa
- Tipo de recurso:
- Doctoral thesis
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
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- Palabra clave:
- Filogeografía comparada
Peces de agua dulce
Ostariophysi
Captura de exones
Región trans-Andina
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Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Peces de agua dulce
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Los estudios filogeográficos identifican cómo reconfiguraciones del paisaje y variaciones climáticas interactúan con las especies o comunidades de especies en regiones específicas y como esta interacción ha podido influenciar los procesos de diversificación. En los últimos años, la filogeografía se ha beneficiado con los avances en las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, lo cual ha permitido incluir en los análisis no sólo un único locus mitocondrial o un conjunto de loci nucleares, sino genomas completos o algunas formas de representación reducida de los mismos, con el fin de dilucidar esos patrones de variación en taxones modelo o sus parientes cercanos. La mayoría de los estudios que involucran especies co-distribuidas se han desarrollado en el Paleártico, el Neártico y Australasia. Sin embargo, ahora el Neotrópico está alcanzando el mismo nivel de investigación, dado que es uno de los lugares más biodiversos del planeta, siendo la región en la cual se concentra la mayor riqueza de peces de agua dulce. Dentro de este grupo de peces tenemos a los que pertenecen a los Ostariophysi (Characiformes, Gymnotiformes y Siluriformes), que constituyen un grupo modelo para realizar este tipo de estudios ya que su evolución y diversificación han estado íntimamente vinculados a la evolución de las cuencas en las cuales estos peces se distribuyen. Este estudio filogeográfico de cinco especies de peces primarios distribuidos en ocho cuencas principales en el noroeste de Sur América y la Baja América Central, examina los datos de exones en combinación con genomas mitocondriales. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Maldonado Ocampo, Javier AlejandroBetancur Rodríguez, RicardoRincón Sandoval, Cindy MelissaForero Fuentes, Igor DimitriRuiz Garcia, ManuelSalazar Clavijo, Camilo AndresDaza, Juan ManuelMárquez Fernández, Edna Judith2019-02-05T16:52:56Z2020-04-16T14:53:29Z2019-02-05T16:52:56Z2020-04-16T14:53:29Z2018-11-27http://hdl.handle.net/10554/40543https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.40543instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLos estudios filogeográficos identifican cómo reconfiguraciones del paisaje y variaciones climáticas interactúan con las especies o comunidades de especies en regiones específicas y como esta interacción ha podido influenciar los procesos de diversificación. En los últimos años, la filogeografía se ha beneficiado con los avances en las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, lo cual ha permitido incluir en los análisis no sólo un único locus mitocondrial o un conjunto de loci nucleares, sino genomas completos o algunas formas de representación reducida de los mismos, con el fin de dilucidar esos patrones de variación en taxones modelo o sus parientes cercanos. La mayoría de los estudios que involucran especies co-distribuidas se han desarrollado en el Paleártico, el Neártico y Australasia. Sin embargo, ahora el Neotrópico está alcanzando el mismo nivel de investigación, dado que es uno de los lugares más biodiversos del planeta, siendo la región en la cual se concentra la mayor riqueza de peces de agua dulce. Dentro de este grupo de peces tenemos a los que pertenecen a los Ostariophysi (Characiformes, Gymnotiformes y Siluriformes), que constituyen un grupo modelo para realizar este tipo de estudios ya que su evolución y diversificación han estado íntimamente vinculados a la evolución de las cuencas en las cuales estos peces se distribuyen. Este estudio filogeográfico de cinco especies de peces primarios distribuidos en ocho cuencas principales en el noroeste de Sur América y la Baja América Central, examina los datos de exones en combinación con genomas mitocondriales.Pontificia Universidad JaverianaNational Science FoundationRegional phylogeographical studies identify how landscape reconfigurations and regional climatic variations interacted with ecologies and natural histories of co-distributed species to shape current diversity establishing commonalities of spatial patterns. In the last years, phylogeography has benefited with advances in high-throughput sequencing technologies, improving from the previous single mitochondrial locus or a handful of nuclear loci for whole genomes or some forms of genome reduction, to elucidate those patterns of variation in model taxa or their close relatives. Most of the notable studies involving co-distributed species have been conducted for the Palearctic, the Nearctic, and the Australasia. However, the Neotropics is now catching up due to the fact that it is one of the greatest biodiversity hotspots on earth. The Neotropics counts with the world’s most dominant group of freshwater fish species, Ostariophysian, making it the best marker to conduct this kind of studies. The evolution and diversification of these lineages is thus linked to, and dependent on, the temporal connections in the course of watersheds and riverways as well as the displacements of the boundaries between merging rivers, reflecting the landscape evolution. In this study we examined exon data from 1,051 loci in combination with complete mitochondrial genomes to study the phylogeographic history of five primary fish species (155 individuals) representing three major fish orders (Characiformes, Gymnotiformes, and Siluriformes), collected from eight major river basins in Northwestern South America and Lower Central America.Doctor en Ciencias BiológicasDoctoradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaDoctorado en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasFilogeografía comparadaPeces de agua dulceOstariophysiCaptura de exonesRegión trans-AndinaComparative phylogeographyFreshwater fishesOstariophysiExon captureTrans-Andean regionDoctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasPeces de agua dulcePeces - IdentificaciónPoblación de pecesDiversidad biológicaFilogeografía comparada de peces de agua dulce en el noroccidente de Sur América y la baja América CentralTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisTHUMBNAILTESIS.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2314http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/1/TESIS.pdf.jpga844988d8c0c31c421780898c34cb16dMD51open accessMitochondrial genomes of the headstanders Megaleporinus muyscorum Steindachner 1900 and Megaleporinus obtusidens Valenciennes 1837 Characiformes.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4752http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/2/Mitochondrial%20genomes%20of%20the%20headstanders%20Megaleporinus%20muyscorum%20Steindachner%201900%20and%20Megaleporinus%20obtusidens%20Valenciennes%201837%20Characiformes.pdf.jpg0422729cc8f96f909e931380d3c8664eMD52open accessMitochondrial genomes of the South American electric knifefishes Eigenmannia humboldtii Steindachner 1878 Eigenmannia limbata Schreiner and Miranda.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5527http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/3/Mitochondrial%20genomes%20of%20the%20South%20American%20electric%20knifefishes%20Eigenmannia%20humboldtii%20Steindachner%201878%20Eigenmannia%20limbata%20Schreiner%20and%20Miranda.pdf.jpg40cc995b376b732628ab2158319f1d44MD53open accesscarta_autorizacion.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5934http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/4/carta_autorizacion.pdf.jpg98ee5955fb62ffbcb729a028bc50fc30MD54open accessORIGINALTESIS.pdfDocumentoapplication/pdf20487852http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/5/TESIS.pdf874652afbad401965e15628cf033f7d4MD55metadata only accessSupplementary_material.xlsxAnexo1application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet874582http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/6/Supplementary_material.xlsxe8d0d2d006b4b1a34215c1d3cad37874MD56metadata only accessMitochondrial genomes of the headstanders Megaleporinus muyscorum Steindachner 1900 and Megaleporinus obtusidens Valenciennes 1837 Characiformes.pdfAnexo2application/pdf970655http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/7/Mitochondrial%20genomes%20of%20the%20headstanders%20Megaleporinus%20muyscorum%20Steindachner%201900%20and%20Megaleporinus%20obtusidens%20Valenciennes%201837%20Characiformes.pdf8bc2667263f8ccb31cadd3c4818351d8MD57metadata only accessMitochondrial genomes of the South American electric knifefishes Eigenmannia humboldtii Steindachner 1878 Eigenmannia limbata Schreiner and Miranda.pdfAnexo3application/pdf1048939http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/8/Mitochondrial%20genomes%20of%20the%20South%20American%20electric%20knifefishes%20Eigenmannia%20humboldtii%20Steindachner%201878%20Eigenmannia%20limbata%20Schreiner%20and%20Miranda.pdfa5a7a1033c97a4029477e62565572184MD58metadata only accesscarta_autorizacion.pdfLicencia de usoapplication/pdf615861http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/9/carta_autorizacion.pdf8f32472ce51bb34060aecfb0d4516f95MD59metadata only accessLICENSElicense.txttext/plain2603http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/40543/10/license.txt2070d280cc89439d983d9eee1b17df53MD510open access10554/40543oai:repository.javeriana.edu.co:10554/405432022-04-29 12:37:49.903Repositorio Institucional - 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