Filogeografía comparativa de cinco taxones de felinos neotropicales (Jaguar, Panthera onca; Jaguarundi, Puma yagouaroundi; Ocelote, Leopardus pardalis; Margay, Leopardus wiedii y el complejo de especies de tigrillos; Felidae, Carnivora, Mammalia) mediante análisis del ADN mitocondrial

Los estudios con ADN para las especies de felinos silvestres del Neotrópico se han basado en números reducidos de muestras y de marcadores moleculares, en áreas geográficas específicas y en la mayoría de los casos, con muestras de animales con orígenes geográficos inciertos. En este trabajo, se anal...

Full description

Autores:
Pinedo Castro, Myreya Omayra Zoraida
Tipo de recurso:
Doctoral thesis
Fecha de publicación:
2017
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/47109
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/47109
https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.47109
Palabra clave:
Felidae
Filogeografía
Neotrópico
Diversidad genética
ADN mitocondrial
Felidae
Mitochondrial DNA
Phylogeography
Neotropical zone
Genetic diversity
Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Diversidad biológica
Variación genética
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Pumas
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openAccess
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Pinto Báez, Miguel
Pérez Torres, Jairo
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description Los estudios con ADN para las especies de felinos silvestres del Neotrópico se han basado en números reducidos de muestras y de marcadores moleculares, en áreas geográficas específicas y en la mayoría de los casos, con muestras de animales con orígenes geográficos inciertos. En este trabajo, se analizaron la filogeografía, sistemática molecular y algunas características de la evolución genética de cinco especies de felinos neotropicales (Panthera onca, Puma yagouaroundi, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii y Leopardus tigrinus), mediante las secuencias de tres genes mitocondriales: ATP8, 16S rRNA y NADH5 y mitogenomas para un número significativo de muestras obtenidas directamente de la naturaleza. Mediante el análisis de diversidad genética, se encontró que, para las cinco especies, los niveles son elevados. En cuatro especies, el número de acervos genéticos es menor que el de las subespecies morfológicas consideradas por los zoólogos excepto para el tigrillo. Se confirmó a L. guttulus como especie y se revela la existencia de dos posibles especies de tigrillos para Colombia y Ecuador. Los análisis bayesiano y distribución mismatch mostraron evidencias de que las cuatro especies de mayor porte y el complejo de especies de tigrillos, pasaron por expansiones poblacionales durante el pleistoceno lo cual significa que los mismos procesos afectaron la evolución genética de estos organismos. Además, se demuestra que el análisis de un gran número de ejemplares con la mayor diversificación geográfica posible, es necesario para detectar agrupaciones regionales de trascendencia sistemática (por ejemplo, por debajo del nivel de especie), aunque el número de marcadores sea bajo.
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spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Ruiz García, ManuelPinedo Castro, Myreya Omayra ZoraidaRueda Zozaya, Maria del PilarFlanagan, Nicola SianCastillo Amézquita, Maria IgnaciaPinto Báez, MiguelPérez Torres, JairoAmérica CentralAmérica del NorteAmérica del Sur1998-20152020-02-10T21:36:17Z2020-04-16T14:53:45Z2020-02-10T21:36:17Z2020-04-16T14:53:45Z2017-06-02http://hdl.handle.net/10554/47109https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.47109instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLos estudios con ADN para las especies de felinos silvestres del Neotrópico se han basado en números reducidos de muestras y de marcadores moleculares, en áreas geográficas específicas y en la mayoría de los casos, con muestras de animales con orígenes geográficos inciertos. En este trabajo, se analizaron la filogeografía, sistemática molecular y algunas características de la evolución genética de cinco especies de felinos neotropicales (Panthera onca, Puma yagouaroundi, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii y Leopardus tigrinus), mediante las secuencias de tres genes mitocondriales: ATP8, 16S rRNA y NADH5 y mitogenomas para un número significativo de muestras obtenidas directamente de la naturaleza. Mediante el análisis de diversidad genética, se encontró que, para las cinco especies, los niveles son elevados. En cuatro especies, el número de acervos genéticos es menor que el de las subespecies morfológicas consideradas por los zoólogos excepto para el tigrillo. Se confirmó a L. guttulus como especie y se revela la existencia de dos posibles especies de tigrillos para Colombia y Ecuador. Los análisis bayesiano y distribución mismatch mostraron evidencias de que las cuatro especies de mayor porte y el complejo de especies de tigrillos, pasaron por expansiones poblacionales durante el pleistoceno lo cual significa que los mismos procesos afectaron la evolución genética de estos organismos. Además, se demuestra que el análisis de un gran número de ejemplares con la mayor diversificación geográfica posible, es necesario para detectar agrupaciones regionales de trascendencia sistemática (por ejemplo, por debajo del nivel de especie), aunque el número de marcadores sea bajo.Vicerrectoría de investigaciones de la Pontificia Universidad JaverianaThe DNA’s studies for Neotropical wild cat species have been traditionally based on a reduced number of samples and molecular markers as well as in restricted geographical areas and, in many cases, with animals whose geographical origins are uncertain. This work analyzed the phylogeography, the molecular systematics and some traits of the evolutionary genetics of five Neotropical cat species (Panthera onca, Puma yagouaroundi, Leopardus pardalis, Leopardus wiedii and Leopardus tigrinus), by means of three mitochondrial genes (ATP8, 16S rRNA and NADH5) and by mitogenomes for large simple sizes directly coming from wild. The genetic diversity analyses yielded high levels for all the species studied. In four of these species, the significant number of gene pools were lower than the putative morphological subspecies traditionally recognized, with the exception of the tigrina. In this case, our study detected the posible existence of different species within the traditional tigrina. L. guttulus was confirmed in southern-eastern Brazil and several different species were detected in Colombia and Ecuador. The Bayesian and mismatch procedures showed evidences that all the species analyzed crossed by population expansions during the Pleistocene, which agrees quite well with the possibility that the same Pleistocene events affected in a similar way all these species. Furthermore, it was shown that large simple sizes with very diversified geographical origins are needed to detect some regional clusters of relevant systematic meaning, although the number of molecular markers should be limited.Doctor en Ciencias BiológicasDoctoradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaDoctorado en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasFelidaeFilogeografíaNeotrópicoDiversidad genéticaADN mitocondrialFelidaeMitochondrial DNAPhylogeographyNeotropical zoneGenetic diversityDoctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasDiversidad biológicaVariación genéticaADN mitocondrialPumasFilogeografía comparativa de cinco taxones de felinos neotropicales (Jaguar, Panthera onca; Jaguarundi, Puma yagouaroundi; Ocelote, Leopardus pardalis; Margay, Leopardus wiedii y el complejo de especies de tigrillos; Felidae, Carnivora, Mammalia) mediante análisis del ADN mitocondrialComparative phylogeography of five neotropical feline taxa (Jaguar, Panthera onca; Jaguarundi, Puma yagouaroundi; Ocelote, Leopardus pardalis; Margay, Leopardus wiedii and the complex of little spotted cat species; Felidae, Carnivora, Mammalia) by mitochondrial DNA analysisTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisORIGINALFILOGEOGRAFÍA COMPARATIVA DE CINCO TAXONES DE FELINOS.pdfDocumentoapplication/pdf4084924http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/1/FILOGEOGRAF%c3%8dA%20COMPARATIVA%20DE%20CINCO%20TAXONES%20DE%20FELINOS.pdf5406e6489cc94745f89688d6056953e2MD51open accessjaguarundi_MAMBIO_41048 prueba de imprenta.pdfArtículo 1 Coautorapplication/pdf1979717http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/2/jaguarundi_MAMBIO_41048%20prueba%20de%20imprenta.pdf7c526566184698c85bc8ff26f2dd61acMD52metadata only accessMN305 Filogeografía del Margay Mastozoología neotropical Primer autor en prensa.pdfArtículo 2 Primer autorapplication/pdf1590873http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/3/MN305%20Filogeograf%c3%ada%20del%20Margay%20Mastozoolog%c3%ada%20neotropical%20Primer%20autor%20en%20prensa.pdfe5ffd5952e9aaa251de1ddffcb2e389fMD53metadata only accessCarta autorización de los autores.pdfLicencia de usoapplication/pdf4855901http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/4/Carta%20autorizaci%c3%b3n%20de%20los%20autores.pdf181140a7a6b1203cb5556f7d7661ac63MD54metadata only accessFILOGEOGRAFÍA COMPARATIVA Autorizacion directores.pdfCarta de aprobación Director(es)application/pdf190265http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/5/FILOGEOGRAF%c3%8dA%20COMPARATIVA%20Autorizacion%20directores.pdf1987483ae44d01948b6f0e9cb1eb6e69MD55metadata only accessLICENSElicense.txttext/plain2603http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/6/license.txt2070d280cc89439d983d9eee1b17df53MD56open accessTHUMBNAILFILOGEOGRAFÍA COMPARATIVA DE CINCO TAXONES DE FELINOS.pdf.jpgFILOGEOGRAFÍA COMPARATIVA DE CINCO TAXONES DE FELINOS.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5059http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/7/FILOGEOGRAF%c3%8dA%20COMPARATIVA%20DE%20CINCO%20TAXONES%20DE%20FELINOS.pdf.jpg84e8c4e6237425d31df67a928675134fMD57open accessjaguarundi_MAMBIO_41048 prueba de imprenta.pdf.jpgjaguarundi_MAMBIO_41048 prueba de imprenta.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg9465http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/8/jaguarundi_MAMBIO_41048%20prueba%20de%20imprenta.pdf.jpg2f549c441a4f1f7abb2f244206305885MD58open accessMN305 Filogeografía del Margay Mastozoología neotropical Primer autor en prensa.pdf.jpgMN305 Filogeografía del Margay Mastozoología neotropical Primer autor en prensa.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg9672http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/9/MN305%20Filogeograf%c3%ada%20del%20Margay%20Mastozoolog%c3%ada%20neotropical%20Primer%20autor%20en%20prensa.pdf.jpg629104f4afdbf375e6052bc820c6ae76MD59open accessCarta autorización de los autores.pdf.jpgCarta autorización de los autores.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg11995http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/10/Carta%20autorizaci%c3%b3n%20de%20los%20autores.pdf.jpgfa891c49f0512aa9b2a1adb2be3c01e8MD510open accessFILOGEOGRAFÍA COMPARATIVA Autorizacion directores.pdf.jpgFILOGEOGRAFÍA COMPARATIVA Autorizacion directores.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7066http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/47109/11/FILOGEOGRAF%c3%8dA%20COMPARATIVA%20Autorizacion%20directores.pdf.jpgcb456a942deae966baf8f2449b9b50b1MD511open access10554/47109oai:repository.javeriana.edu.co:10554/471092022-04-29 12:34:53.873Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.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