Análisis de la secuencia de un clon lipolítico derivado de una biblioteca metagenómica de suelo de bosque alto andino del parque nacional natural los nevados
Con el objetivo de caracterizar el inserto metagenómico del clon BAA 3C3 proveniente de una biblioteca metagenómica de suelo de Bosque Alto Andino del Parque Nacional Natural Los Nevados, se confirmó la actividad lipolítica del clon sobre medio LB suplementado con 1% (v/v) de Tributirina y se cuanti...
- Autores:
-
Ruiz Gómez, Anderson
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2013
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/11815
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/11815
- Palabra clave:
- Termoestable
Thermostable
Bioinformática
Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
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- openAccess
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- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Con el objetivo de caracterizar el inserto metagenómico del clon BAA 3C3 proveniente de una biblioteca metagenómica de suelo de Bosque Alto Andino del Parque Nacional Natural Los Nevados, se confirmó la actividad lipolítica del clon sobre medio LB suplementado con 1% (v/v) de Tributirina y se cuantificó la actividad lipolítica empleando la técnica de pNP esteres. Adicionalmente se secuenció el inserto metagenómico con el fin de establecer que gen(es) podría(n) estar relacionados con la actividad lipolítica y determinar cuál era el posible contexto genómico. Luego de 15 días a 6°C se observaron halos de aclaramiento alrededor de las colonias generados por la hidrolisis de la tributirina. Los resultados de pNP-esteres mostraron que la enzima lipolítica del clon tiene preferencia por ácidos grasos de cadena corta y una actividad específica de 6,97U/mg(+/- 0,141, 60°C, pH 7) en pNP-Acetato y de 1,59U/mg(+/-0,375, 60°C, pH 7) en pNP-Butirato. El análisis de la secuencia permitió establecer 5 ORFs que se encuentran asociados a: carboxilesterasa, metiltransferasa, Acil-CoA deshidrogenasa, cutinasa y un regulador transcripcional respectivamente. La clasificación del ORF 1 (Carboxilesterasa) basada en las familias descritas por Arpigny y Jaeger (1999), agrupó a la enzima codificada por el ORF 1 dentro de la familia III. Con base en los resultados se sugiere que el clon expresa una nueva esterasa termoestable, activa a pH neutro y ligeramente alcalino. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Montaña Lara, José SalvadorRuiz Gómez, Anderson2015-01-17T21:22:18Z2016-03-29T14:24:23Z2020-04-15T20:12:03Z2015-01-17T21:22:18Z2016-03-29T14:24:23Z2020-04-15T20:12:03Z2013http://hdl.handle.net/10554/11815instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coCon el objetivo de caracterizar el inserto metagenómico del clon BAA 3C3 proveniente de una biblioteca metagenómica de suelo de Bosque Alto Andino del Parque Nacional Natural Los Nevados, se confirmó la actividad lipolítica del clon sobre medio LB suplementado con 1% (v/v) de Tributirina y se cuantificó la actividad lipolítica empleando la técnica de pNP esteres. Adicionalmente se secuenció el inserto metagenómico con el fin de establecer que gen(es) podría(n) estar relacionados con la actividad lipolítica y determinar cuál era el posible contexto genómico. Luego de 15 días a 6°C se observaron halos de aclaramiento alrededor de las colonias generados por la hidrolisis de la tributirina. Los resultados de pNP-esteres mostraron que la enzima lipolítica del clon tiene preferencia por ácidos grasos de cadena corta y una actividad específica de 6,97U/mg(+/- 0,141, 60°C, pH 7) en pNP-Acetato y de 1,59U/mg(+/-0,375, 60°C, pH 7) en pNP-Butirato. El análisis de la secuencia permitió establecer 5 ORFs que se encuentran asociados a: carboxilesterasa, metiltransferasa, Acil-CoA deshidrogenasa, cutinasa y un regulador transcripcional respectivamente. La clasificación del ORF 1 (Carboxilesterasa) basada en las familias descritas por Arpigny y Jaeger (1999), agrupó a la enzima codificada por el ORF 1 dentro de la familia III. Con base en los resultados se sugiere que el clon expresa una nueva esterasa termoestable, activa a pH neutro y ligeramente alcalino.The purpose of this study was to characterized the metagenomic insert of the clon BAA 3C3 derived from a metagenomic library of High Andean Forest soil from the Natural National Park Los Nevados, Colombia. Lipolytic activity of the clone was confirmed on LB medium supplemented with 1% (v/v) of tributyrin and quantified using pNP-esters assay. Additionally, the metagenomic insert was sequenced in order to establish which gene (s) could be associated to the lipolitic activity and to determine the genomic context. After 15 days at 6° C, hydrolysis halos were observed around the colonies grown on LB-tributyrin. The activity evaluated on pNP-esters showed that lipolytic enzyme has preferences for short-chain fatty acids with specific activity of 6.97 U / mg (+ / - 0.141, 60 ° C, pH 7) in pNP-Acetate and 1.59 U / mg (+ / -0.375, 60 ° C, pH 7) in pNP-butyrate. The analysis of the insert sequence showed 5 ORFs associated to: carboxylesterase, methyltransferase, acyl-CoA dehydrogenase, cutinase and a transcriptional regulator, respectively. Based on the lipolytic enzimes a family described by Arpigny and Jaeger (1999) was possible to include the codified enzyme by the ORF 1 into family III. This results suggest that the clone BAA3C3 expresses a new thermostable esterase, active at neutral pH and slightly alkaline pH.Microbiólogo (a) IndustrialPregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaMicrobiología IndustrialFacultad de CienciasTermoestableThermostableBioinformáticaMicrobiología industrial - Tesis y disertaciones académicasAnálisis de la secuencia de un clon lipolítico derivado de una biblioteca metagenómica de suelo de bosque alto andino del parque nacional natural los nevadosTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALRuizGomezAnderson2013.pdfapplication/pdf1344064http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11815/1/RuizGomezAnderson2013.pdfc229b6d682316df79fb734730c014d78MD51open accessTHUMBNAILRuizGomezAnderson2013.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3413http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11815/2/RuizGomezAnderson2013.pdf.jpg70530cc94b244ee7417f0a590833c844MD52open access10554/11815oai:repository.javeriana.edu.co:10554/118152022-05-03 09:01:56.002Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.co |