Expresión de Lignino peroxidasa en Pichia pastoris X-33 bajo el control del promotor constitutivo GAP

Las problemáticas actuales relacionadas con el vertimiento de sustancias tóxicas a diferentes cuerpos de agua generan gran preocupación, ya que representa un riesgo para los ecosistemas y las especies que los habitan, lo que conlleva a la necesidad de generar alternativas que permitan desarrollar un...

Full description

Autores:
Duarte Sabogal, Erika Juliana
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/50234
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/50234
Palabra clave:
Lignino peroxidasa
pGAPZαA
Proteínas heterólogas
Pichia pastoris
Lignin peroxidase
pGAPZαA
Heterologous proteins
Pichia pastoris
Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
Lignocelulosa
Proteínas recombinantes
Diseño experimental
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openAccess
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description Las problemáticas actuales relacionadas con el vertimiento de sustancias tóxicas a diferentes cuerpos de agua generan gran preocupación, ya que representa un riesgo para los ecosistemas y las especies que los habitan, lo que conlleva a la necesidad de generar alternativas que permitan desarrollar un proceso de biorremediación sin provocar efectos adversos, como el uso de tratamientos biológicos basados en el uso de microorganismos productores de enzimas capaces de degradar diferentes compuestos, con lo que sería posible reducir los niveles de contaminación. Es por esto que, en este estudio se realizó la expresión de lignino peroxidasa (E.C. 1.11.1.14) recombinante en Pichia pastoris, bajo el control del promotor constitutivo GAP (gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa). Para esto se optimizaron diferentes parámetros gen codificante determinantes para la expresión de esta enzima, integrándolo inicialmente en E. coli con el vector de replicación pUC57 con el fin de aumentar la concentración del material genético, para después realizar un constructo con el plásmido pGAGαA, nuevamente insertándolo en el genoma esta bacteria, una vez que se obtuviera la mayor cantidad posible de dicho material genético se esperaba realizar una electroporación con Pichia pastoris, con lo que finalmente se llevaría a cabo una cinética de crecimiento y una evaluación la actividad enzimática, así como la determinación otros parámetros fundamentales. Adicionalmente, se realizó una revisión de literatura con respecto a la producción de diferentes proteínas heterólogas en sistemas inducibles y constitutivos especialmente empleando pAOX1 y pGAP , a partir de lo cual, es posible concluir que el uso de este último implica mayores beneficios, así como más facilidades en su uso, puesto que al no necesitar de una sustancia inductora y realizar la trascripción de manera constante, es posible obtener mejores resultados con respecto a la producción y eficiencia de estas.
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spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Rivera Hoyos, Claudia MarcelaDuarte Sabogal, Erika Juliana2020-07-06T20:55:21Z2020-07-06T20:55:21Z2020-06-05http://hdl.handle.net/10554/50234Las problemáticas actuales relacionadas con el vertimiento de sustancias tóxicas a diferentes cuerpos de agua generan gran preocupación, ya que representa un riesgo para los ecosistemas y las especies que los habitan, lo que conlleva a la necesidad de generar alternativas que permitan desarrollar un proceso de biorremediación sin provocar efectos adversos, como el uso de tratamientos biológicos basados en el uso de microorganismos productores de enzimas capaces de degradar diferentes compuestos, con lo que sería posible reducir los niveles de contaminación. Es por esto que, en este estudio se realizó la expresión de lignino peroxidasa (E.C. 1.11.1.14) recombinante en Pichia pastoris, bajo el control del promotor constitutivo GAP (gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa). Para esto se optimizaron diferentes parámetros gen codificante determinantes para la expresión de esta enzima, integrándolo inicialmente en E. coli con el vector de replicación pUC57 con el fin de aumentar la concentración del material genético, para después realizar un constructo con el plásmido pGAGαA, nuevamente insertándolo en el genoma esta bacteria, una vez que se obtuviera la mayor cantidad posible de dicho material genético se esperaba realizar una electroporación con Pichia pastoris, con lo que finalmente se llevaría a cabo una cinética de crecimiento y una evaluación la actividad enzimática, así como la determinación otros parámetros fundamentales. Adicionalmente, se realizó una revisión de literatura con respecto a la producción de diferentes proteínas heterólogas en sistemas inducibles y constitutivos especialmente empleando pAOX1 y pGAP , a partir de lo cual, es posible concluir que el uso de este último implica mayores beneficios, así como más facilidades en su uso, puesto que al no necesitar de una sustancia inductora y realizar la trascripción de manera constante, es posible obtener mejores resultados con respecto a la producción y eficiencia de estas.The current problems related to the discard of toxic substances into different water sources are of great concern, since they represent a risk to the ecosystems and species they inhabit, which leads to the need to generate alternatives that can develop a bioremediation process without cause adverse effects, such as the use of biological treatments based in the use of enzyme-producing microorganisms capable of degrading different compounds, which could reduce contamination levels. That is why, in this study, we sought to carry out the production of lignin peroxidase recombinantly in the Pichia pastoris expression system, using the constitutive promoter GAP (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase). For this, optimization of the gene coding for this enzyme was performed, inserted optimally in E. coli with the replication vector pUC57 in order to increase the concentration of the genetic material, to then carry out a construct with the plasmid PGAGαA, again inserted into this bacteria, once the greatest possible amount of said genetic material is obtained, it was expected to perform an electroporation with Pichia pastoris, which would finally carry out growth kinetics and an evaluation of the enzymatic activity, as well as the determination of other parameters fundamental. In addition, a literature review was carried out regarding the production of different heterologous proteins in inducible and constitutive systems, especially using pAOXI and pGAP, from which it is possible to conclude that the use of the latter against the greatest benefits, as well as more ease in its use, since by not needing an inducing substance and performing the transcription constantly, it is possible to obtain better results regarding the production and efficiency of these.Microbiólogo (a) IndustrialPregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaMicrobiología IndustrialFacultad de CienciasLignino peroxidasapGAPZαAProteínas heterólogasPichia pastorisLignin peroxidasepGAPZαAHeterologous proteinsPichia pastorisMicrobiología industrial - Tesis y disertaciones académicasLignocelulosaProteínas recombinantesDiseño experimentalExpresión de Lignino peroxidasa en Pichia pastoris X-33 bajo el control del promotor constitutivo GAPLignin peroxidase expression in Pichia pastoris X-33 under the control of the constitutive promoter GAPTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALTrabajo de grado Erika Duarte.pdfTrabajo de grado Erika Duarte.pdfDocumentoapplication/pdf791989http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/50234/1/Trabajo%20de%20grado%20Erika%20Duarte.pdf46e7f926edfd430fe1ddf7df66d5eceaMD51open accessCarta Directores Tesis Erika Duarte.pdfCarta Directores Tesis Erika Duarte.pdfCarta aprobación directoresapplication/pdf166169http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/50234/2/Carta%20Directores%20Tesis%20Erika%20Duarte.pdfd725d5d1a36cbbd9448567403ad8c17dMD52metadata only accessCarta de autorizacion Erika Duarte.pdfCarta de autorizacion Erika Duarte.pdfLicencia de usoapplication/pdf160404http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/50234/3/Carta%20de%20autorizacion%20Erika%20Duarte.pdf695dca66398ef34c4970c3f22948ec1bMD53metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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