Rol de los microRNAs (miRNAs) 451a y 1225-5p en la progresión del cáncer mamario
La progresión tumoral obedece a las habilidades y capacidades de las células tumorales de desencadenar mecanismos bioquímicos, físicos y mecánicos que favorecen su proliferación en un microambiente altamente especializado que contiene una variedad de biomoléculas y células las cuales logran un ambie...
- Autores:
-
Hernández Velandia, Yohany Andres
- Tipo de recurso:
- Doctoral thesis
- Fecha de publicación:
- 2023
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/68246
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/68246
- Palabra clave:
- Cancer
microRNA
Cancer
microRNA
Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Neoplasmas de la mama
MicroARNs
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La progresión tumoral obedece a las habilidades y capacidades de las células tumorales de desencadenar mecanismos bioquímicos, físicos y mecánicos que favorecen su proliferación en un microambiente altamente especializado que contiene una variedad de biomoléculas y células las cuales logran un ambiente favorecedor para la progresión tumoral. Dentro del conjunto de moléculas disponibles en el microambiente tumoral, se encuentran los microRNAs, definidos como RNAs cortos no codificantes con actividad biológica en la regulación génica en condiciones normales y patológicas. Estudios previos han demostrado y validado los mecanismos biológicos que permiten el desarrollo placentario normal y como estos procesos se presentan similares a escala molecular respecto al desarrollo y progresión tumoral. Un conjunto de microRNAs han sido evaluados previamente y se ha propuesto su rol en el proceso autorregulado de desarrollo placentario, dentro de los cuales se encuentran el hsa-hsa-miR-451a y hsa-miR-1225-5p. Con base a lo anteriormente expuesto y de acuerdo con el siguiente objetivo “Determinar el rol de los microRNAs hsa-hsa-miR-451a y hsa-miR-1225-5p en la progresión del cáncer mamario”, se pretende responder la problemática. Para poder darle alcance al objetivo propuesto, planeamos una serie de aproximaciones metodológicas, las cuales abarcaron herramientas bioinformáticas que permitieron descargar y analizar los datos de repositorios de datos públicos validados, inicialmente con el fin de validar en tumores mamarios la ausencia de expresión de los microRNAs de este proyecto, y adicionalmente, seleccionar los genes blanco de los microRNAs estudiados. Para evaluar el rol funcional de los microRNAs, fueron seleccionadas 4 líneas celulares tumorales caracterizadas correspondientes a subtipos moleculares: MCF7 luminal A; BT474 luminal B; MDA-MB-231 triple negativo; MDA-MB-453 receptor andrógeno positivo, receptor de progesterona negativo, receptor estrógeno negativo. Todas fueron transfectadas con microRNAs sintéticos (mimics®) de hsa-miR-451a y hsa-miR-1225-5p (ThermoFisher Scientific). Una vez confirmada la transfección, se ejecutaron los ensayos funcionales de proliferación, sobrevida, migración e invasión. Luego, determinada la ausencia de la expresión de los microRNAs en las líneas celulares tumorales mamarias, esas líneas denominadas como control y transfectadas fueron evaluadas para los procesos clásicos de progresión tumoral. Se evidenció la actividad biológica del hsa-miR-451a en las líneas celulares MCF7, BT474, MDA-MB-231 y MDA-MB-453, donde la expresión de este microRNA generó una disminución significativa de la proliferación, la sobrevida, la migración y la invasión celular, respecto a las células control (p<0,05). La actividad biológica del hsa-miR-1225-5p en las líneas celulares MC7 y BT474 mostró una disminución significativa en los resultados de los ensayos funcionales ya descritos, los cuales están relacionados con la progresión tumoral, respecto a las células control (p<0,05). Para el caso de las líneas celulares MDA-MB-231 y MDA-MB-453 se encontró un aumento significativo en los resultados de las pruebas funcionales, cuando las células fueron transfectadas en relación con las células control (p<0,05). Con base en los análisis previos bioinformáticos se evaluó la actividad biológica de los microRNAs seleccionados, mediante análisis de posibles blancos génicos y enriquecimiento de vías de señalización celular relacionadas con procesos de proliferación, migración, invasión y supervivencia celular. Se encontró interacción entre el hsa-miR-451a y los genes AKT1, CAB39 y BRAF, intermediarios en la vía de señalización MAPK, AMPK y MEK/ERK. Para el hsa-miR-1225-5p se encontró interacción con los genes LASP1, MYC, PEG10, los cuales se encuentran inmersos en la vía de señalización TGF-Beta y β-catenina. La expresión génica de los 6 blancos fue evaluada por qPCR, mostrando disminución/ausencia de la expresión en las células transfectadas con los microRNAs. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Aristizabal Pachón, Andres FelipeGarcía Robles, ReggieHernández Velandia, Yohany AndresGarcia Florez, ManuelRondón, Sandra MilenaSerrano Gomez, Silvia JulianaUmaña Perez, AdrianaSalazar Gutierrez, Fredy Roberto2024-08-02T13:22:53Z2024-08-02T13:22:53Z2023-04-12http://hdl.handle.net/10554/68246instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLa progresión tumoral obedece a las habilidades y capacidades de las células tumorales de desencadenar mecanismos bioquímicos, físicos y mecánicos que favorecen su proliferación en un microambiente altamente especializado que contiene una variedad de biomoléculas y células las cuales logran un ambiente favorecedor para la progresión tumoral. 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Para poder darle alcance al objetivo propuesto, planeamos una serie de aproximaciones metodológicas, las cuales abarcaron herramientas bioinformáticas que permitieron descargar y analizar los datos de repositorios de datos públicos validados, inicialmente con el fin de validar en tumores mamarios la ausencia de expresión de los microRNAs de este proyecto, y adicionalmente, seleccionar los genes blanco de los microRNAs estudiados. Para evaluar el rol funcional de los microRNAs, fueron seleccionadas 4 líneas celulares tumorales caracterizadas correspondientes a subtipos moleculares: MCF7 luminal A; BT474 luminal B; MDA-MB-231 triple negativo; MDA-MB-453 receptor andrógeno positivo, receptor de progesterona negativo, receptor estrógeno negativo. Todas fueron transfectadas con microRNAs sintéticos (mimics®) de hsa-miR-451a y hsa-miR-1225-5p (ThermoFisher Scientific). 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Para el caso de las líneas celulares MDA-MB-231 y MDA-MB-453 se encontró un aumento significativo en los resultados de las pruebas funcionales, cuando las células fueron transfectadas en relación con las células control (p<0,05). Con base en los análisis previos bioinformáticos se evaluó la actividad biológica de los microRNAs seleccionados, mediante análisis de posibles blancos génicos y enriquecimiento de vías de señalización celular relacionadas con procesos de proliferación, migración, invasión y supervivencia celular. Se encontró interacción entre el hsa-miR-451a y los genes AKT1, CAB39 y BRAF, intermediarios en la vía de señalización MAPK, AMPK y MEK/ERK. Para el hsa-miR-1225-5p se encontró interacción con los genes LASP1, MYC, PEG10, los cuales se encuentran inmersos en la vía de señalización TGF-Beta y β-catenina. La expresión génica de los 6 blancos fue evaluada por qPCR, mostrando disminución/ausencia de la expresión en las células transfectadas con los microRNAs.Tumor progression is due to the abilities and capacities of tumor cells to trigger biochemical, physical, and mechanical mechanisms that favor their proliferation in a highly specialized microenvironment that contains a variety of biomolecules and cells that create an environment that favors tumor progression. Among the set of molecules available in the tumor microenvironment are microRNAs, defined as short non-coding RNAs with biological activity in gene regulation under normal and pathological conditions. Previous studies have demonstrated and validated the biological mechanisms that allow normal placental development and how these processes are similar at the molecular level with respect to tumor development and progression. A set of microRNAs have been previously evaluated and their role in the self-regulated process of placental development has been proposed, among which are hsa-hsa-miR-451a and hsa-miR-1225-5p. Based on the above and in accordance with the following objective “To determine the role of microRNAs hsa-hsa-miR-451a and hsa-miR-1225-5p in the progression of breast cancer”, we intend to answer the problem. In order to achieve the proposed objective, we planned a series of methodological approaches, which included bioinformatics tools that allowed downloading and analyzing data from validated public data repositories, initially in order to validate the absence of expression of the microRNAs of this project in breast tumors, and additionally, to select the target genes of the studied microRNAs. To evaluate the functional role of microRNAs, 4 characterized tumor cell lines corresponding to molecular subtypes were selected: MCF7 luminal A; BT474 luminal B; MDA-MB-231 triple negative; MDA-MB-453 androgen receptor positive, progesterone receptor negative, estrogen receptor negative. All cells were transfected with synthetic microRNAs (mimics®) of hsa-miR-451a and hsa-miR-1225-5p (ThermoFisher Scientific). Once transfection was confirmed, functional assays of proliferation, survival, migration and invasion were performed. Then, after determining the absence of expression of microRNAs in the mammary tumor cell lines, these lines, designated as control and transfected, were evaluated for the classic processes of tumor progression. The biological activity of hsa-miR-451a was evident in the MCF7, BT474, MDA-MB-231 and MDA-MB-453 cell lines, where the expression of this microRNA generated a significant decrease in cell proliferation, survival, migration and invasion, compared to control cells (p<0.05). The biological activity of hsa-miR-1225-5p in MC7 and BT474 cell lines showed a significant decrease in the results of the functional assays already described, which are related to tumor progression, compared to control cells (p<0.05). In the case of the MDA-MB-231 and MDA-MB-453 cell lines, a significant increase was found in the results of the functional tests when the cells were transfected in relation to the control cells (p<0.05). Based on the previous bioinformatics analyses, the biological activity of the selected microRNAs was evaluated by analyzing possible gene targets and enrichment of cell signaling pathways related to proliferation, migration, invasion and cell survival processes. Interaction was found between hsa-miR-451a and the genes AKT1, CAB39 and BRAF, intermediaries in the MAPK, AMPK and MEK/ERK signaling pathways. For hsa-miR-1225-5p, interaction was found with the genes LASP1, MYC, PEG10, which are involved in the TGF-Beta and β-catenin signaling pathway. The gene expression of the 6 targets was evaluated by qPCR, showing decreased/absence of expression in cells transfected with the microRNAs.Doctor en Ciencias BiológicasDoctoradohttps://orcid.org/0000-0001-5913-8125PDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaDoctorado en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasCancermicroRNACancermicroRNADoctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasNeoplasmas de la mamaMicroARNsRol de los microRNAs (miRNAs) 451a y 1225-5p en la progresión del cáncer mamarioRole of microRNAs (miRNAs) 451a and 1225-5p in breast cancer progressionTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisORIGINALTesis Doctoral Andres Hernandez Velandia 2023 APROBADA.pdfTesis Doctoral Andres Hernandez Velandia 2023 APROBADA.pdfDocumentoapplication/pdf2015018http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/68246/1/Tesis%20Doctoral%20Andres%20Hernandez%20Velandia%202023%20APROBADA.pdff8fd16a5e1da2ca6f4611b5edd75c705MD51open accessmir1225.pdfmir1225.pdfAnexo 1application/pdf1751568http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/68246/6/mir1225.pdf3f4c6119b16a7fc27dc4732c1d94f25aMD56open accessmir451.pdfmir451.pdfAnexo 2application/pdf767504http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/68246/7/mir451.pdf00a1a5cf975a1f87d07a1813fde7d29eMD57open accessCarta de autorizacion HERNANDEZ VELANDIA.pdfCarta de autorizacion HERNANDEZ VELANDIA.pdfLicencia de usoapplication/pdf182108http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/68246/3/Carta%20de%20autorizacion%20HERNANDEZ%20VELANDIA.pdff647cbe74f7488ed3e4a9913e842f3a7MD53metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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