"Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"

En el presente trabajo se evaluó el efecto del tamaño de la muestra, sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana. Se seleccionaron tres tamaños de muestra (0,25-0.5 y 5 gramos de suelo) provenientes de bosque Llanos, Amazonas y Valle del Cauca. Se realizaron dos extr...

Full description

Autores:
Corredor Sáenz, Viviana Catalina
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2012
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/55318
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/55318
Palabra clave:
Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
id JAVERIANA2_724d9f95545348006829493615df1739
oai_identifier_str oai:repository.javeriana.edu.co:10554/55318
network_acronym_str JAVERIANA2
network_name_str Repositorio Universidad Javeriana
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
title "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
spellingShingle "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
title_short "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
title_full "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
title_fullStr "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
title_full_unstemmed "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
title_sort "Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"
dc.creator.fl_str_mv Corredor Sáenz, Viviana Catalina
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Arbeli, Ziv, Dir.
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Corredor Sáenz, Viviana Catalina
dc.subject.spa.fl_str_mv Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
topic Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
dc.subject.armarc.spa.fl_str_mv Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
Genética bacteriana
Genética bacteriana - Análisis
description En el presente trabajo se evaluó el efecto del tamaño de la muestra, sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana. Se seleccionaron tres tamaños de muestra (0,25-0.5 y 5 gramos de suelo) provenientes de bosque Llanos, Amazonas y Valle del Cauca. Se realizaron dos extracciones de ADN metagenómico (replica 1 y 2), se cuantifico y se evaluó la calidad del ADN, luego para verificar la calidad del ADN extraído se realizo PCR, y posteriormente se realizó la técnica de huella genética RISA (del inglés Ribosomal Intergenic SpacerAnalysis) (2 repeticiones). El análisis genético de las comunidades estudiadas reveló una alta diversidad bacteriana en el suelo de Bosque Valle del Cauca, determinada por el gran número de bandas detectadas por RISA. El análisis de MDS (Multidimensional Scaling) evidenció cambios significativos en la estructura de las comunidades asociadas. Por otro lado las diferencias encontradas entre los tamaños de muestra dependen del suelo empleado, encontrando que la estructura y diversidad de las comunidades bacterianas del Bosque Amazonas se vió menos afectada por cambios en el tamaño de muestra empleado.
publishDate 2012
dc.date.created.none.fl_str_mv 2012
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-07-23T18:44:30Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-07-23T18:44:30Z
dc.type.local.spa.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.driver.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10554/55318
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javeriana
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv repourl:https://repository.javeriana.edu.co
url http://hdl.handle.net/10554/55318
identifier_str_mv instname:Pontificia Universidad Javeriana
reponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javeriana
repourl:https://repository.javeriana.edu.co
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.licence.*.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.spa.fl_str_mv PDF
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Pontificia Universidad Javeriana
dc.publisher.program.spa.fl_str_mv Microbiología Industrial
dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv Facultad de Ciencias
institution Pontificia Universidad Javeriana
bitstream.url.fl_str_mv http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/1/CorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdf
http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/2/Licencia%20de%20uso.pdf
http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/3/license.txt
http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/4/CorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdf.jpg
http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/5/Licencia%20de%20uso.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv d96fafbf905ea20d5e657c2020990489
835ba0f044ad0bd5cc5a24ea2ae38ad7
2070d280cc89439d983d9eee1b17df53
bc91d8e29113d6be280f4fab741baa6e
e38344bb1c24d62654af5310ba82d445
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javeriana
repository.mail.fl_str_mv repositorio@javeriana.edu.co
_version_ 1811671134144299008
spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Arbeli, Ziv, Dir.Corredor Sáenz, Viviana Catalina2021-07-23T18:44:30Z2021-07-23T18:44:30Z2012http://hdl.handle.net/10554/55318instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coEn el presente trabajo se evaluó el efecto del tamaño de la muestra, sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana. Se seleccionaron tres tamaños de muestra (0,25-0.5 y 5 gramos de suelo) provenientes de bosque Llanos, Amazonas y Valle del Cauca. Se realizaron dos extracciones de ADN metagenómico (replica 1 y 2), se cuantifico y se evaluó la calidad del ADN, luego para verificar la calidad del ADN extraído se realizo PCR, y posteriormente se realizó la técnica de huella genética RISA (del inglés Ribosomal Intergenic SpacerAnalysis) (2 repeticiones). El análisis genético de las comunidades estudiadas reveló una alta diversidad bacteriana en el suelo de Bosque Valle del Cauca, determinada por el gran número de bandas detectadas por RISA. El análisis de MDS (Multidimensional Scaling) evidenció cambios significativos en la estructura de las comunidades asociadas. Por otro lado las diferencias encontradas entre los tamaños de muestra dependen del suelo empleado, encontrando que la estructura y diversidad de las comunidades bacterianas del Bosque Amazonas se vió menos afectada por cambios en el tamaño de muestra empleado.Microbiólogo (a) IndustrialPregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaMicrobiología IndustrialFacultad de CienciasGenética bacterianaGenética bacteriana - AnálisisMicrobiología industrial - Tesis y disertaciones académicasGenética bacterianaGenética bacteriana - Análisis"Evaluación del efecto del tamaño de la muestra de suelo y la técnica de huella genética risa sobre la estimación de la estructura y diversidad de la comunidad bacteriana"Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALCorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdfCorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdfDocumentoapplication/pdf937993http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/1/CorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdfd96fafbf905ea20d5e657c2020990489MD51open accessLicencia de uso.pdfLicencia de uso.pdfLicencia de usoapplication/pdf289570http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/2/Licencia%20de%20uso.pdf835ba0f044ad0bd5cc5a24ea2ae38ad7MD52metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82603http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/3/license.txt2070d280cc89439d983d9eee1b17df53MD53open accessTHUMBNAILCorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdf.jpgCorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5210http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/4/CorredorSaenzVivianaCatalina2012.pdf.jpgbc91d8e29113d6be280f4fab741baa6eMD54open accessLicencia de uso.pdf.jpgLicencia de uso.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7216http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/55318/5/Licencia%20de%20uso.pdf.jpge38344bb1c24d62654af5310ba82d445MD55open access10554/55318oai:repository.javeriana.edu.co:10554/553182022-05-03 08:55:48.3Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.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