Identificación de genes potencialmente indicadores de capacidad germinativa, vigor, longevidad y dormancia en semillas de diferentes especies de pasifloras a partir de sus ortólogos en a. thaliana
La baja calidad de las semillas en los cultivos de pasifloras, asociada a una capacidad germinativa y longevidad reducidas, constituyen un factor limitante en términos de propagación para los productores en Colombia. Aunque se han desarrollado estudios con tratamientos pregerminativos para mejorar l...
- Autores:
-
Ariza Peña, Stephanie
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2015
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/17915
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/17915
- Palabra clave:
- Vigor
Gen At3g08030
Longevidad
Dormancia
Passifloraceae
Vigor
At3g08030 gen
Longevity
Dormance
Passifloraceae
Biología - Tesis y disertaciones académicas
Passiflora
Germinación
Gulupas
Granadillas
Maracuyás
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- openAccess
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- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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La baja calidad de las semillas en los cultivos de pasifloras, asociada a una capacidad germinativa y longevidad reducidas, constituyen un factor limitante en términos de propagación para los productores en Colombia. Aunque se han desarrollado estudios con tratamientos pregerminativos para mejorar la calidad de las semillas, los mecanismos moleculares que controlan algunos rasgos indicadores de calidad como el vigor, la capacidad germinativa o la longevidad, son un aspecto aún desconocido en las pasifloras, por lo que se hace necesario generar conocimiento básico acerca de estos procesos biológicos. Objetivo: Identificar genes potencialmente indicadores de vigor, capacidad germinativa, longevidad y dormancia en semillas de cuatro especies de pasifloras: Granadilla (P. ligularis Juss.), gulupa (P. edulis Sims.), cholupa (P. maliformis L.) y maracuyá (P. edulis f. flavicarpa O. Deg.), a partir de sus ortólogos en Arabidopsis thaliana. Metodología: A partir de la selección de siete genes (At3g08030, AtLIGÓ, CYP707A1, CYP707A2, DOG1, PIMT1 y PIMT2) previamente reportados como asociados con rasgos de calidad (capacidad germinativa, vigor y longevidad) e identificados en la planta modelo A. thaliana, se diseñaron primers degenerados sobre las regiones proteicas más conservadas por medio del software CODEHOP, con el fin de amplificar las respectivas secuencias génicas parciales en diferentes especies del género Passiflora. Los productos de PCR se clonaron en el vector PGEM-T Easy (Promega) y posteriormente se enviaron a secuenciar los insertos. A partir de las secuencias obtenidas, se verificó la identidad de la secuencia génica y se realizó un alineamiento múltiple contra las secuencias reportadas en las bases de datos publicas con el fin de analizar las relaciones filogenéticas de la secuencia con sus homologas en diferentes especies vegetales. Resultados: Primer reporte del gen At3g08030 en una especie de la familia Passifloraceae (granadilla), un marcador molecular de longevidad y vigor de las semillas de A. thaliana. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Terán Pérez, WilsonAriza Peña, Stephanie2016-08-10T21:27:06Z2020-04-15T16:18:52Z2016-08-10T21:27:06Z2020-04-15T16:18:52Z2015http://hdl.handle.net/10554/17915instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLa baja calidad de las semillas en los cultivos de pasifloras, asociada a una capacidad germinativa y longevidad reducidas, constituyen un factor limitante en términos de propagación para los productores en Colombia. Aunque se han desarrollado estudios con tratamientos pregerminativos para mejorar la calidad de las semillas, los mecanismos moleculares que controlan algunos rasgos indicadores de calidad como el vigor, la capacidad germinativa o la longevidad, son un aspecto aún desconocido en las pasifloras, por lo que se hace necesario generar conocimiento básico acerca de estos procesos biológicos. Objetivo: Identificar genes potencialmente indicadores de vigor, capacidad germinativa, longevidad y dormancia en semillas de cuatro especies de pasifloras: Granadilla (P. ligularis Juss.), gulupa (P. edulis Sims.), cholupa (P. maliformis L.) y maracuyá (P. edulis f. flavicarpa O. Deg.), a partir de sus ortólogos en Arabidopsis thaliana. Metodología: A partir de la selección de siete genes (At3g08030, AtLIGÓ, CYP707A1, CYP707A2, DOG1, PIMT1 y PIMT2) previamente reportados como asociados con rasgos de calidad (capacidad germinativa, vigor y longevidad) e identificados en la planta modelo A. thaliana, se diseñaron primers degenerados sobre las regiones proteicas más conservadas por medio del software CODEHOP, con el fin de amplificar las respectivas secuencias génicas parciales en diferentes especies del género Passiflora. Los productos de PCR se clonaron en el vector PGEM-T Easy (Promega) y posteriormente se enviaron a secuenciar los insertos. A partir de las secuencias obtenidas, se verificó la identidad de la secuencia génica y se realizó un alineamiento múltiple contra las secuencias reportadas en las bases de datos publicas con el fin de analizar las relaciones filogenéticas de la secuencia con sus homologas en diferentes especies vegetales. Resultados: Primer reporte del gen At3g08030 en una especie de la familia Passifloraceae (granadilla), un marcador molecular de longevidad y vigor de las semillas de A. thaliana.The low quality of the crop seeds in Passiflora, associated with a reduced germination and longevity are a limiting factor in terms of spread for producers in Colombia. Although studies have been developed pregerminative to improve the quality of seeds, the molecular mechanisms that control some features quality indicators as vigor, germination capacity or longevity, are still unknown aspect Passiflora, so that necessary to generate basic knowledge about these biological processes. Objective: To identify genes potentially force indicators, germination capacity, longevity and dormancy in seeds of four species of Passiflora: ( P. ligularis Juss) Granadilla, purple passion fruit (P. edulis Sims.), Cholupa (P. maliformis L.) and passion fruit (P. edulis f. flavicarpa. O. Deg.), from its orthologs in Arabidopsis thaliana. Methodology: From the selection of seven genes (At3g08030, AtLIGó, CYP707A1, CYP707A2, DOG1, PIMT1 and PIMT2) previously reported as associated with quality traits (germination, vigor and longevity) and identified in the model plant A. thaliana , degenerate primers to conserved protein regions CODEHOP through software, in order to amplify the respective partial gene sequences in different species of Passiflora were designed. The PCR products were cloned into pGEM-T Easy vector (Promega) and subsequently sent to sequencing the inserts. From the obtained sequences the identity of the gene sequence was verified and a multiple alignment was performed with the sequences reported in the public databases in order to analyze the phylogenetic relationships of the sequence with their counterparts in different plant species. Results: First report of the At3g08030 gene in one species of the family Passifloraceae (passion fruit), a molecular marker of longevity and vigor of the seeds of A. thaliana.Biólogo (a)PregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaBiologíaFacultad de CienciasVigorGen At3g08030LongevidadDormanciaPassifloraceaeVigorAt3g08030 genLongevityDormancePassifloraceaeBiología - Tesis y disertaciones académicasPassifloraGerminaciónGulupasGranadillasMaracuyásIdentificación de genes potencialmente indicadores de capacidad germinativa, vigor, longevidad y dormancia en semillas de diferentes especies de pasifloras a partir de sus ortólogos en a. thalianaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALArizaPenaStephanie2015.pdfapplication/pdf2247013http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/17915/1/ArizaPenaStephanie2015.pdf853c30011cc8c270c698b7807652810cMD51open accessTHUMBNAILArizaPenaStephanie2015.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2895http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/17915/2/ArizaPenaStephanie2015.pdf.jpg1861be62fae678ffdda5087910ac0c5dMD52open access10554/17915oai:repository.javeriana.edu.co:10554/179152022-05-03 16:00:39.717Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.co |