Modelo molecular teórico del receptor serotoninérgico 5HT2A acoplado a proteína G
Objetivo. Construir um modelo molecular teórico da estrutura terciária do receptor 5HT2A de Homo Sapiens, com estruturas obtidas experimentalmente como moldes. Materiais e métodos. Para a elaboração do modelo teórico se utilizou o protocolo estabelecido por Ballesteros e Weinstein para a construção...
- Autores:
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Malagón Bernal, Rafael Eduardo; Facultad de Ciencia y Tecnología, Departamento de Química Farmacéutica, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales, Bogota D.C.
Fernández Navas, Manuel Alejandro; Facultad de Ciencia y Tecnología, Departamento de Química Farmacéutica, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales, Bogota D.C.
Acevedo Sarmiento, Orlando Emilio; Departamento de Física, Pontificia Universidad Javeriana, Bogota D.C., Colombia
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2012
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/31495
- Acceso en línea:
- http://revistas.javeriana.edu.co/index.php/scientarium/article/view/3687
http://hdl.handle.net/10554/31495
- Palabra clave:
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G protein receptor, hydrophobicity profile, Ramachandran plot, orthosteric site, molecular modelling
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- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
| Summary: | Objetivo. Construir um modelo molecular teórico da estrutura terciária do receptor 5HT2A de Homo Sapiens, com estruturas obtidas experimentalmente como moldes. Materiais e métodos. Para a elaboração do modelo teórico se utilizou o protocolo estabelecido por Ballesteros e Weinstein para a construção do receptor acoplado à proteína G, por intermédio de alinhamento da seqüência de aminoácidos, perfis de hidrofobicidade, refinamento de bucles por restrições espaciais e minimização da energia com o campo de força OPLS_2005. Resultados. O modelo obtido foi validado pelo gráfico de Ramachandran com 91,7% dos aminoácidos dentro dos limites estabelecidos para os ângulos phi e psi, e um RMSD de 0,95 Å com respeito à rodopsina de bovino. Conclusões. Obteve-se um modelo teórico validado, útil para a realização de estudos de acoplamento ligante-receptor.Palavras-chave: receptor proteína G, perfil de hidrofobicidade, gráfico Ramachandran, união ortoestérica, modelo molecular. |
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