Utilidad de la Electroforesis en Gel de Campo Pulsado (PFGE) para la tipificación molecular de Listeria monocytogenes

El objetivo principal de este trabajo fue determinar mediante una revisión bibliográfica si la Electroforesis en Gel de Campo Pulsado (PFGE) es la herramienta molecular más adecuada para la tipificación y diferenciación de aislamientos de Listeria monocytogenes. Para cumplir este objetivo se selecci...

Full description

Autores:
Cardozo Bernal, Ángela María
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2012
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/11813
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/11813
Palabra clave:
Electroforesis en gel de campo pulsado
Pulsed field gel electrophoresis
Electroforesis
Listeria monocytogenes
Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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description El objetivo principal de este trabajo fue determinar mediante una revisión bibliográfica si la Electroforesis en Gel de Campo Pulsado (PFGE) es la herramienta molecular más adecuada para la tipificación y diferenciación de aislamientos de Listeria monocytogenes. Para cumplir este objetivo se seleccionaron 70 artículos científicos, los cuales fueron organizados y tabulados por año de publicación, desde 1992 hasta el 2012, lo que permitió obtener información como, el tipo de PFGE y las enzimas de restricción utilizadas, el protocolo empleado y la metodología de análisis de los patrones de bandeo. Se encontró que la PFGE permite la separación de moléculas de ADN de alto peso molecular (hasta 10Mpb) a través del uso de enzimas de restricción que cortan el ADN de L. monocytogenes con una baja frecuencia, generando patrones de restricción simples (10-20 bandas) lo que simplifica el análisis, el cual se realiza a través de un software que permite la comparación rápida y fácil de los aislamientos. La PFGE ha demostrado tener mayor poder discriminativo que la mayoría de técnicas moleculares utilizadas para la tipificación de L. monocytogenes. En el protocolo de PFGE estandarizado (variante CHEF) para la subtipificación de L. monocytogenes se requiere la combinación de las enzimas de restricción ApaI y AscI, lo que permite reducir el tiempo de la corrida a 30h. Mediante el análisis y agrupación de los datos obtenidos en PFGE ha sido posible la agrupación de los aislamientos de L. monocytogenes en 3 linajes genéticos. La nomenclatura de los linajes varía entre investigadores, sin embargo, por lo general se sabe que en el linaje I están incluidos los serotipos 1?2b, 3b, 4b, 4d, 4e y 7, en el linaje II los serotipos 1?2a, 3a, 1?2c y 3c y en el linaje III, los serotipos 4a y 4c, así como algunas cepas del serotipo 4b. Sin embargo, se ha reportado la existencia de un linaje IV el cual fue identificado por primera vez mediante la técnica MLGT (Multilocus genotyping) y se compone de los serotipos 4a, 4b y 4c, los cuales difieren considerablemente de los miembros del linaje III. Ninguno de los artículos científicos revisados menciona la agrupación de cepas del linaje IV a través de la PFGE, lo que sugiere que esta técnica, podría no ser la que mejor para discriminar entre los linajes III y IV.
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spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Poutou Piñales, Raúl AlbertoCarrascal Camacho, Ana KarinaCardozo Bernal, Ángela María2015-01-17T21:22:18Z2016-03-29T14:24:23Z2020-04-15T20:13:24Z2015-01-17T21:22:18Z2016-03-29T14:24:23Z2020-04-15T20:13:24Z2012http://hdl.handle.net/10554/11813instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coEl objetivo principal de este trabajo fue determinar mediante una revisión bibliográfica si la Electroforesis en Gel de Campo Pulsado (PFGE) es la herramienta molecular más adecuada para la tipificación y diferenciación de aislamientos de Listeria monocytogenes. Para cumplir este objetivo se seleccionaron 70 artículos científicos, los cuales fueron organizados y tabulados por año de publicación, desde 1992 hasta el 2012, lo que permitió obtener información como, el tipo de PFGE y las enzimas de restricción utilizadas, el protocolo empleado y la metodología de análisis de los patrones de bandeo. Se encontró que la PFGE permite la separación de moléculas de ADN de alto peso molecular (hasta 10Mpb) a través del uso de enzimas de restricción que cortan el ADN de L. monocytogenes con una baja frecuencia, generando patrones de restricción simples (10-20 bandas) lo que simplifica el análisis, el cual se realiza a través de un software que permite la comparación rápida y fácil de los aislamientos. La PFGE ha demostrado tener mayor poder discriminativo que la mayoría de técnicas moleculares utilizadas para la tipificación de L. monocytogenes. En el protocolo de PFGE estandarizado (variante CHEF) para la subtipificación de L. monocytogenes se requiere la combinación de las enzimas de restricción ApaI y AscI, lo que permite reducir el tiempo de la corrida a 30h. Mediante el análisis y agrupación de los datos obtenidos en PFGE ha sido posible la agrupación de los aislamientos de L. monocytogenes en 3 linajes genéticos. La nomenclatura de los linajes varía entre investigadores, sin embargo, por lo general se sabe que en el linaje I están incluidos los serotipos 1?2b, 3b, 4b, 4d, 4e y 7, en el linaje II los serotipos 1?2a, 3a, 1?2c y 3c y en el linaje III, los serotipos 4a y 4c, así como algunas cepas del serotipo 4b. Sin embargo, se ha reportado la existencia de un linaje IV el cual fue identificado por primera vez mediante la técnica MLGT (Multilocus genotyping) y se compone de los serotipos 4a, 4b y 4c, los cuales difieren considerablemente de los miembros del linaje III. Ninguno de los artículos científicos revisados menciona la agrupación de cepas del linaje IV a través de la PFGE, lo que sugiere que esta técnica, podría no ser la que mejor para discriminar entre los linajes III y IV.The main objective of this study was to determine through literature review if Pulse Field Gel Electrophoresis (PFGE) is the most appropriate tool for the molecular characterization and differentiation of Listeria monocytogenes isolates. To meet this goal we selected 70 scientific papers, which were organized and tabulated by year of publication, since 1992 to 2012, which allowed getting information such as the type of PFGE and restriction enzymes used, the most relevant results, the protocol used and the methodology of analysis of banding patterns. PFGE was found allowing the separation of DNA molecules of high molecular weight (up 10Mpb) through the use of restriction enzymes that cut the DNA of L. monocytogenes with a low frequency, generating simple restriction patterns (10-20 bands) thereby simplifying the analysis, which is performed through a software that allows fast and easy comparison of isolates. The PFGE has shown more discriminative power than most used molecular techniques for L. monocytogenes typing. The standardized PFGE protocol (CHEF variant) for subtyping of L. monocytogenes requires the combination of the restriction enzymes ApaI and AscI, thus reducing the running time at 30h. By analyzing and clustering data from PFGE was possible grouping L. monocytogenes isolates in three genetic lineages. The nomenclature of the lineages varies between researchers, however, generally it is known that lineage I include serotypes 1/2b, 3b, 4b, 4d, 4e, and 7, lineage II serotypes 1/2a, 3a, 3c and 1/2c, and lineage III serotypes 4a and 4c, as well as some strains of serotype 4b. However, it has been reported the existence of a lineage IV which was first identified using the technique MLGT (Multilocus genotyping) and consists of serotype 4a, 4b and 4c, which differ considerably from lineage III members. None of the papers reviewed mentioned the clustering of strains from lineage IV through PFGE, suggesting that this technique may not be the best for discriminating between lineages III and IV.Microbiólogo (a) IndustrialPregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaMicrobiología IndustrialFacultad de CienciasElectroforesis en gel de campo pulsadoPulsed field gel electrophoresisElectroforesisListeria monocytogenesMicrobiología industrial - Tesis y disertaciones académicasUtilidad de la Electroforesis en Gel de Campo Pulsado (PFGE) para la tipificación molecular de Listeria monocytogenesTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALCardozoBernalAngelaMaria2012.pdfapplication/pdf969124http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11813/1/CardozoBernalAngelaMaria2012.pdfbbe41df995f43acfda3dbef7044713b8MD51open accessTHUMBNAILCardozoBernalAngelaMaria2012.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2907http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11813/2/CardozoBernalAngelaMaria2012.pdf.jpg24c6f312dd36a14539107a0560828e78MD52open access10554/11813oai:repository.javeriana.edu.co:10554/118132022-05-03 16:00:34.925Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.co