Filogenómica de aislamientos colombianos de Helicobacter pylori procedentes de una zona de alto riesgo de cáncer gástrico
H. pylori es una bacteria que coloniza la mucosa gástrica del 50% de la población mundial y está asociada a la aparición de patologías como gastritis, úlceras pépticas y cáncer gástrico. En Colombia, el 80% de la población está infectada con H. pylori y el cáncer gástrico es la primera causa de muer...
- Autores:
-
Gutierrez Escobar, Andrés Julián
- Tipo de recurso:
- Doctoral thesis
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
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- Palabra clave:
- Helicobacter pylori
Cáncer gástrico
Filogenómica
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Helicobacter pylori
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Neoplasias gástricas
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Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
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H. pylori es una bacteria que coloniza la mucosa gástrica del 50% de la población mundial y está asociada a la aparición de patologías como gastritis, úlceras pépticas y cáncer gástrico. En Colombia, el 80% de la población está infectada con H. pylori y el cáncer gástrico es la primera causa de muerte por cáncer en hombres y la tercera para mujeres. Esta bacteria ha coevolucionado con su hospedero humano desde su salida de África. El objetivo de este trabajo fue describir las relaciones filogenómicas de 103 aislamientos colombianos de H. pylori obtenidos en las ciudades de Bogotá, Tunja y poblaciones aledañas. Se identificaron linajes evolutivos independientes de la bacteria en la zona de estudio y análisis filogenéticos y poblacionales de los genes: AlpA, VacA, HorB y Tipα indicaron que su evolución fue producto de una rápida expansión poblacional que acompaño el proceso de mestizaje de la población humana bajo procesos de divergencia funcional que dieron forma a la microevolución de estos linajes en esta región del país. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Acevedo, OrlandoBravo, María MercedesMendez, GinaGutierrez Escobar, Andrés JuliánOtero Regino, WilliamAnzola, Juan ManuelAristizabal, Andrés FelipePazos, ÁlvaroZabaleta, Jovanny2018-11-30T19:43:20Z2020-04-16T14:53:01Z2018-11-30T19:43:20Z2020-04-16T14:53:01Z2018-11-11http://hdl.handle.net/10554/38971https://doi.org/10.11144/Javeriana.10554.38971instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coH. pylori es una bacteria que coloniza la mucosa gástrica del 50% de la población mundial y está asociada a la aparición de patologías como gastritis, úlceras pépticas y cáncer gástrico. En Colombia, el 80% de la población está infectada con H. pylori y el cáncer gástrico es la primera causa de muerte por cáncer en hombres y la tercera para mujeres. Esta bacteria ha coevolucionado con su hospedero humano desde su salida de África. El objetivo de este trabajo fue describir las relaciones filogenómicas de 103 aislamientos colombianos de H. pylori obtenidos en las ciudades de Bogotá, Tunja y poblaciones aledañas. Se identificaron linajes evolutivos independientes de la bacteria en la zona de estudio y análisis filogenéticos y poblacionales de los genes: AlpA, VacA, HorB y Tipα indicaron que su evolución fue producto de una rápida expansión poblacional que acompaño el proceso de mestizaje de la población humana bajo procesos de divergencia funcional que dieron forma a la microevolución de estos linajes en esta región del país.Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.AColciencias (599-2014)Instituto Nacional de Cancerología (41030610588)H. pylori infect the stomach of the half of the human population, and the infection is associated with gastritis, ulcers, and gastric cancer. In Colombia, 80% of the population has the infection, and gastric cancer is a severe health problem. The goal of the present study was to analyze the phylogenomic relationships of 103 isolates of the bacteria from a high-risk gastric cancer region of Colombia. Independent evolutionary lineages of H. pylori were identified in this region, and alongside with phylogenetic and topological analysis of virulence factors showed that its microevolution was due to a rapid population expansion under a robust functional divergence process that accompanies the admixture suffered by the human population during the conquest.Doctor en Ciencias BiológicasDoctoradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaDoctorado en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasHelicobacter pyloriCáncer gástricoFilogenómicaEvolución molecularHelicobacter pyloriGastric cancerPhylogenomicsMolecular evolutionNeoplasias gástricasHelicobacter pyloriEvolución molecularDoctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasFilogenómica de aislamientos colombianos de Helicobacter pylori procedentes de una zona de alto riesgo de cáncer gástricoTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisLICENSElicense.txttext/plain2603http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/1/license.txt2070d280cc89439d983d9eee1b17df53MD51open accessORIGINALTESIS.pdfDocumentoapplication/pdf4428880http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/2/TESIS.pdfd0dfdaadba62e10cdb1cc147eb0a34f2MD52open accessAnexo_2.pdfAnexo 2application/pdf577703http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/3/Anexo_2.pdf1f402a5546ce703da5439d9928cc76ddMD53metadata only accessArtículo_1.pdfArtículoapplication/pdf2292677http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/4/Art%c3%adculo_1.pdf5490ccb9888d4b989d925d46dd6b2215MD54open accessArtículo_2.pdfArtículo 2application/pdf6206383http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/5/Art%c3%adculo_2.pdf073dd5b3a69c3b6083c7e45c4bd6462fMD55open accessTHUMBNAILTESIS.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2314http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/6/TESIS.pdf.jpg3fb5053717f61b78f1fe1c2e270296cdMD56open accessAnexo_2.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5885http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/7/Anexo_2.pdf.jpgaf3c53da394d392b9ebab4fc23a70a23MD57open accessArtículo_1.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6550http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/8/Art%c3%adculo_1.pdf.jpgcfef92bca14b160dd6164b397b3b1c69MD58open accessArtículo_2.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7648http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/38971/9/Art%c3%adculo_2.pdf.jpg6924521b1a200db87dce173359003488MD59open access10554/38971oai:repository.javeriana.edu.co:10554/389712022-04-29 12:33:55.624Repositorio Institucional - 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