Genotipificación de 14 variedades de arroz (oryza sativa) mediante marcadores moleculares aflp
Con el fin de determinar la utilidad de la técnica AFLP como herramienta de soporte para los diagnósticos morfológicos en variedades pertenecientes al programa de Derechos de Obtentor de Variedades Vegetales del Instituto Colombiano Agropecuario -ICA-, se genotipificó una población constituida por 1...
- Autores:
-
Camargo Camacho, Enrique Arturo
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2008
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/11857
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/11857
- Palabra clave:
- Genotipificación
Genotyping
Marcadores genéticos
Biología - Tesis y disertaciones académicas
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- openAccess
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- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Con el fin de determinar la utilidad de la técnica AFLP como herramienta de soporte para los diagnósticos morfológicos en variedades pertenecientes al programa de Derechos de Obtentor de Variedades Vegetales del Instituto Colombiano Agropecuario -ICA-, se genotipificó una población constituida por 14 variedades de arroz (O. Sativa). Se probaron dos nuevas combinaciones de iniciadores AFLP y cuatro reportadas en literatura, evidenciándose la mayor resolución y porcentaje de polimorfismo con las combinaciones E-AGC, M-CAC y E-AAC, M-CTA, los resultados obtenidos arrojaron un polimorfismo entre 60 y 100%, con un rango de 25-46 bandas totales y cinco bandas únicas, datos afines con la literatura y estudios recientes adelantados por el ICA con marcadores moleculares RAMS. Se construyeron dendogramas empleando el coeficiente de Dice y el algoritmo UPGMA, lo que permitió evidenciar el agrupamiento de las variedades Oryzica Caribe 8, Oryzica Yacu-9, Oryzica 1, Progreso 4-25, Inproarroz 1525, Coprosem 1 y Aceituno 25-40, en el cual los mayores porcentajes de similaridad se presentaron entre las variedades Oryzica 1, Aceituno 25-40 y Coprosem 1, con más del 90%. Las variedades Coprosem 2 y Selecta se mostraron como las más disímiles. La técnica AFLP permitió establecer diferencias entre las variedades de estudio, poniendo en evidencia su capacidad para diferenciar genotipos o variedades previamente establecidas y de esta forma contribuir y apoyar las pruebas de distinción, homogeneidad y estabilidad (DHE) empleadas en el programa de Protección a los Derechos de Obtentor de Variedades Vegetales. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Álvarez Méndez, Elsa LeonorCamargo Camacho, Enrique Arturo2015-01-17T21:41:09Z2016-03-29T14:27:44Z2020-04-15T16:18:40Z2015-01-17T21:41:09Z2016-03-29T14:27:44Z2020-04-15T16:18:40Z2008http://hdl.handle.net/10554/11857instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coCon el fin de determinar la utilidad de la técnica AFLP como herramienta de soporte para los diagnósticos morfológicos en variedades pertenecientes al programa de Derechos de Obtentor de Variedades Vegetales del Instituto Colombiano Agropecuario -ICA-, se genotipificó una población constituida por 14 variedades de arroz (O. Sativa). Se probaron dos nuevas combinaciones de iniciadores AFLP y cuatro reportadas en literatura, evidenciándose la mayor resolución y porcentaje de polimorfismo con las combinaciones E-AGC, M-CAC y E-AAC, M-CTA, los resultados obtenidos arrojaron un polimorfismo entre 60 y 100%, con un rango de 25-46 bandas totales y cinco bandas únicas, datos afines con la literatura y estudios recientes adelantados por el ICA con marcadores moleculares RAMS. Se construyeron dendogramas empleando el coeficiente de Dice y el algoritmo UPGMA, lo que permitió evidenciar el agrupamiento de las variedades Oryzica Caribe 8, Oryzica Yacu-9, Oryzica 1, Progreso 4-25, Inproarroz 1525, Coprosem 1 y Aceituno 25-40, en el cual los mayores porcentajes de similaridad se presentaron entre las variedades Oryzica 1, Aceituno 25-40 y Coprosem 1, con más del 90%. Las variedades Coprosem 2 y Selecta se mostraron como las más disímiles. La técnica AFLP permitió establecer diferencias entre las variedades de estudio, poniendo en evidencia su capacidad para diferenciar genotipos o variedades previamente establecidas y de esta forma contribuir y apoyar las pruebas de distinción, homogeneidad y estabilidad (DHE) empleadas en el programa de Protección a los Derechos de Obtentor de Variedades Vegetales.In order to determine AFLP technique usefulness as support tool for morphological diagnosis of varieties belonging to the Plant Varieties Breeder's Right Protection Programs of Colombian Agricultural Institute -ICA-, a population consisting of 14 varieties of rice (O. Sativa) was genotyped through AFLP molecular markers. Two new primer combinations of AFLP and six reported in literature were tested, finding the highest resolution and polymorphism percentage with E-AGC, M-ACC and E-AAC, MCTA combinations, the obtained results revealed a polymorphism between 60 and 100%, 25-46 total bands and five unique bands. These data show affinity with those found in literature and recent studies with Random Amplified Microsatellites (RAMs) developed by ICA. Cluster analysis was constructed using UPGMA algorithm and Dice coefficient, which resulted in the formation of a single group that includes Oryzica Caribe 8, Oryzica Yacu-9, Oryzica 1, Progreso 4-25, Inproarroz 1525, Coprosem 1 and Aceituno 25-40 varieties, largest percentages of similarity over 90% were presented by Oryzica 1, Aceituno 25-40 and Coprosem 1. The varieties Coprosem 2 and Selecta were the most dissimilar. The AFLP technique allowed to establish differences between the study varieties, putting in evidence the ability to differentiate genotypes or varieties previously recognized, therefore contribute to the characterization studies developed by Plant Varieties Breeder's Right Protection Programs.Biólogo (a)PregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaBiologíaFacultad de CienciasGenotipificaciónGenotypingMarcadores genéticosBiología - Tesis y disertaciones académicasGenotipificación de 14 variedades de arroz (oryza sativa) mediante marcadores moleculares aflpTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (1).pdfCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (1).pdfDocumentoapplication/pdf779586http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11857/3/CamargoCamachoEnriqueArturo2008%20%281%29.pdfcd92f60f0516516be2f2e80d41954cfdMD53open accessCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (2).pdfCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (2).pdfLicencia de usoapplication/pdf5248http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11857/4/CamargoCamachoEnriqueArturo2008%20%282%29.pdf9e14c87d6cc31b8ae55a963e3e31149dMD54metadata only accessTHUMBNAILCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (1).pdf.jpgCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (1).pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4046http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11857/5/CamargoCamachoEnriqueArturo2008%20%281%29.pdf.jpg08e73d933c4e3c082ede34eed90bab50MD55open accessCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (2).pdf.jpgCamargoCamachoEnriqueArturo2008 (2).pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6383http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/11857/6/CamargoCamachoEnriqueArturo2008%20%282%29.pdf.jpgdcb26ecd2cd5ea9f61eea96b445998e1MD56open access10554/11857oai:repository.javeriana.edu.co:10554/118572022-05-03 10:49:25.658Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.co |