Identificación taxonómica de bacterias cultivables asociadas a los ciclos del carbono y nitrógeno en las cuencas de los ríos La Vieja y Otún (Eje Cafetero- Colombia)
El objetivo del presente estudio fue identificar taxonómicamente los aislamientos obtenidos para cuatro grupos funcionales bacterianos cultivables asociados a los ciclos del carbono (bacterias degradadoras de HCs - BDH) y del nitrógeno denitrificantes y oxidadoras de nitrito - BON y amonio - BOA) en...
- Autores:
-
Cubillos Cárdenas, Ana María
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2009
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/14577
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/14577
- Palabra clave:
- Bacterias edáficas
Edafic bacterias
Bacterias
Biología - Tesis y disertaciones académicas
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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El objetivo del presente estudio fue identificar taxonómicamente los aislamientos obtenidos para cuatro grupos funcionales bacterianos cultivables asociados a los ciclos del carbono (bacterias degradadoras de HCs - BDH) y del nitrógeno denitrificantes y oxidadoras de nitrito - BON y amonio - BOA) en las cuencas de los ríos La vieja y Otún en la región cafetera colombiana. Se realizaron dos eventos de muestreo, los cuales corresponden a épocas transicionales de lluvias (Junio y Septiembre de 2006) seleccionando tres usos del suelo representativos para cada cuenca. Para cada uso del suelo se eligieron dos fincas y en cada una se tomaron tres puntos, obteniéndose 96 muestras de suelo (48 en cada muestreo). Las muestras de suelo fueron procesadas por otros investigadores en estudios anteriores, donde se aislaron un gran número de bacterias, las cuales fueron identificadas taxonómicamente en el presente estudio utilizando técnicas moleculares como PCR de la subunidad 16S rDNA y posterior secuenciación. Se obtuvo un mayor número de aislamientos identificados para el grupo de bacterias degradadoras de hidrocarburos en comparación con los grupos de bacterias asociadas al ciclo del nitrógeno. El número de aislamientos bacterianos diferentes de BDH fue variable entre los diferentes usos del suelo y entre las épocas de muestreo, observándose una tendencia de aumento en el mes de Septiembre. Los usos del suelo se asociaron de acuerdo a la composición de las comunidades de bacterias cultivables y se observaron agrupaciones de aquellos suelos intervenidos por el hombre. En cuanto a BON y BOA, se obtuvieron muy pocos aislamientos identificados, y un gran número de aislamientos mostraron similaridad con secuencias de 16S rDNA de bacterias no cultivadas hasta el momento. |
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Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Roldán García, Fabio AugustoCubillos Cárdenas, Ana María2015-02-02T17:25:49Z2016-03-29T14:27:48Z2020-04-15T16:18:43Z2015-02-02T17:25:49Z2016-03-29T14:27:48Z2020-04-15T16:18:43Z2009http://hdl.handle.net/10554/14577instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coEl objetivo del presente estudio fue identificar taxonómicamente los aislamientos obtenidos para cuatro grupos funcionales bacterianos cultivables asociados a los ciclos del carbono (bacterias degradadoras de HCs - BDH) y del nitrógeno denitrificantes y oxidadoras de nitrito - BON y amonio - BOA) en las cuencas de los ríos La vieja y Otún en la región cafetera colombiana. Se realizaron dos eventos de muestreo, los cuales corresponden a épocas transicionales de lluvias (Junio y Septiembre de 2006) seleccionando tres usos del suelo representativos para cada cuenca. Para cada uso del suelo se eligieron dos fincas y en cada una se tomaron tres puntos, obteniéndose 96 muestras de suelo (48 en cada muestreo). Las muestras de suelo fueron procesadas por otros investigadores en estudios anteriores, donde se aislaron un gran número de bacterias, las cuales fueron identificadas taxonómicamente en el presente estudio utilizando técnicas moleculares como PCR de la subunidad 16S rDNA y posterior secuenciación. Se obtuvo un mayor número de aislamientos identificados para el grupo de bacterias degradadoras de hidrocarburos en comparación con los grupos de bacterias asociadas al ciclo del nitrógeno. El número de aislamientos bacterianos diferentes de BDH fue variable entre los diferentes usos del suelo y entre las épocas de muestreo, observándose una tendencia de aumento en el mes de Septiembre. Los usos del suelo se asociaron de acuerdo a la composición de las comunidades de bacterias cultivables y se observaron agrupaciones de aquellos suelos intervenidos por el hombre. En cuanto a BON y BOA, se obtuvieron muy pocos aislamientos identificados, y un gran número de aislamientos mostraron similaridad con secuencias de 16S rDNA de bacterias no cultivadas hasta el momento.The objective of the present study was to do a taxonomic identification of bacterial isolates belonging to four cultivable bacterial functional groups linked to the carbon cycle (hydrocarbon degrading bacteria HDB) and nitrogen cycle (denitrifying, nitrite oxidizer NOB and ammonium oxidizer AOB) in the La vieja and Otún basin rivers in the colombian coffee region. We carried out two sampling event, corresponding to transitional periods of precipitations (June and September, 2006) selecting three representative soil uses for each basin. In each soil use we choose two representative farms and in each of them we choose three sites, obtaining a sum of 96 soil samples (48 for each sampling event). The soil samples were processed by other researchers in past investigations, where they isolate a great number of bacterias, and in this study they were submitted to taxonomic identification through PCR of the 16S rDNA and posterior sequencing. We obtained a bigger number of isolates for the hydrocarbon bacterial group in comparison with groups linked to the nitrogen cycle. The number of different isolates of HDB was variable between the different soil uses and between the sampling events, observing a rising for September. The soil uses clustered in agreement with the composition of the cultivable bacterial communities, and we observed clusters formed by those soils most disturbed by man. With respect to NOB and AOB, we obtain very few identified isolates, and a great number of isolates genetically related with 16S ribosomal parcial sequences belonging to non cultivable bacteria at this time.Biólogo (a)PregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaBiologíaFacultad de CienciasBacterias edáficasEdafic bacteriasBacteriasBiología - Tesis y disertaciones académicasIdentificación taxonómica de bacterias cultivables asociadas a los ciclos del carbono y nitrógeno en las cuencas de los ríos La Vieja y Otún (Eje Cafetero- Colombia)Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALCubillosCardenasAnaMaria2009.pdfapplication/pdf1566025http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/14577/1/CubillosCardenasAnaMaria2009.pdff096796709f4124390a7e745becb964fMD51open accessTHUMBNAILCubillosCardenasAnaMaria2009.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3059http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/14577/2/CubillosCardenasAnaMaria2009.pdf.jpg3bbd3691851b85608d9ce7718b9a1a07MD52open access10554/14577oai:repository.javeriana.edu.co:10554/145772022-05-03 16:05:29.434Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.co |