Evaluación de la cepa huésped E.coli (CB390) para la detección simultánea de fagos somáticos y F+ totales como herramienta para evidenciar contaminación viral en aguas del río Bogotá y en efluentes de plantas de tratamiento de aguas residuales domésticas

La contaminación en los diferentes cuerpos de agua ha venido aumentando por el crecimiento poblacional, lo que genera un riesgo en la salud de las personas que están en contacto con este tipo de aguas, ya que se encuentran bacterias, virus y parásitos patógenos. Por esta razón, identificar los micro...

Full description

Autores:
Leiton López, Natalia
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2018
Institución:
Pontificia Universidad Javeriana
Repositorio:
Repositorio Universidad Javeriana
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.javeriana.edu.co:10554/39214
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10554/39214
Palabra clave:
Contaminación viral
E. coli CB390
Fagos somáticos
Fagos F+ totales
Río Bogotá y plantas de tratamiento de aguas residuales domésticas
Viral contamination
E. coli CB390
Somatic phages
Total F + phages
Bogotá River and domestic wastewater treatment plants
Microbiología industrial - Tesis y disertaciones académicas
Aguas residuales - Purificación - Tratamiento biológico
Río Bogotá (Colombia)
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openAccess
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description La contaminación en los diferentes cuerpos de agua ha venido aumentando por el crecimiento poblacional, lo que genera un riesgo en la salud de las personas que están en contacto con este tipo de aguas, ya que se encuentran bacterias, virus y parásitos patógenos. Por esta razón, identificar los microrganismos patógenos es de gran importancia, pero su detección en el laboratorio puede llegar a ser una tarea difícil. Como consecuencia se proponen microorganismos indicadores de contaminación de origen fecal en los diferentes tipos de aguas, ya que, son de fácil, rápida y económica detección. Como ejemplo de indicadores bacterianos tenemos Coliformes Fecales, Coliformes Totales y E. coli; Virales como fagos somáticos, fagos F+ RNA específicos y fagos que infectan Bacteroides fragilis, y parásitarios como huevos de helminto y Giardia y Cryptosporidium. En la actualidad se cuenta con una cepa de E. coli CB390 como alternativa al uso de fagos somáticos y F+, para poder ahorrar tiempo, recursos económicos y poder dar resultados en tiempo real de la posible presencia de virus patógenos en el agua. En este estudio se utilizaron indicadores virales (fagos somáticos, F+ totales y CB390) para evidenciar contaminación viral de origen fecal en la cuenca del río Bogotá y efluentes de plantas de tratamiento de aguas residuales domésticas (Guasca, Chiquinquirá y El Salitre). Se analizaron por medio de las técnicas estandarizadas, para fagos somáticos, ISO 10705-2 (2000), para fagos F+ totales, ISO 10705-1 (1999) y para fagos CB390, ISO 10705-2 (2000), modificada por Guzmán et al (2008). Se encontró presencia de estos indicadores en los dos tipos de aguas. En la cuenca del río Bogotá la media en unidades logarítmicas (UL) para fagos somáticos fue de 3.2, para F+ totales de 2.8 y para CB390 fue de 3.1. Por otro lado, para el caso de las PTARD, la media en UL para fagos somáticos de 5.2, para F+ totales de 3.8, y por último para CB390 de 5.1. El análisis realizado con la prueba Kolmogorov-Smirnov demostró que no había normalidad entre los datos, por esta razón se llevó a cabo la prueba no paramétrica Kruskal Wallis que no asume normalidad (P<0.05) en donde se observó que no hay diferencias significativas entre la suma de fagos somáticos y los F+ totales y la cepa evaluada CB390. Con estos resultados se puede concluir que estos indicadores sirven para evaluar presencia de virus en aguas y que la cepa CB390 es una alternativa para la detección simultanea de fagos somáticos y F+ totales.
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spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, “Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores”, los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Campos Pinilla, María ClaudiaLeiton López, NataliaGuzmán Luna, Carolina2018-12-10T20:39:28Z2020-04-15T20:20:37Z2018-12-10T20:39:28Z2020-04-15T20:20:37Z2018-11-30http://hdl.handle.net/10554/39214instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.coLa contaminación en los diferentes cuerpos de agua ha venido aumentando por el crecimiento poblacional, lo que genera un riesgo en la salud de las personas que están en contacto con este tipo de aguas, ya que se encuentran bacterias, virus y parásitos patógenos. Por esta razón, identificar los microrganismos patógenos es de gran importancia, pero su detección en el laboratorio puede llegar a ser una tarea difícil. Como consecuencia se proponen microorganismos indicadores de contaminación de origen fecal en los diferentes tipos de aguas, ya que, son de fácil, rápida y económica detección. Como ejemplo de indicadores bacterianos tenemos Coliformes Fecales, Coliformes Totales y E. coli; Virales como fagos somáticos, fagos F+ RNA específicos y fagos que infectan Bacteroides fragilis, y parásitarios como huevos de helminto y Giardia y Cryptosporidium. En la actualidad se cuenta con una cepa de E. coli CB390 como alternativa al uso de fagos somáticos y F+, para poder ahorrar tiempo, recursos económicos y poder dar resultados en tiempo real de la posible presencia de virus patógenos en el agua. En este estudio se utilizaron indicadores virales (fagos somáticos, F+ totales y CB390) para evidenciar contaminación viral de origen fecal en la cuenca del río Bogotá y efluentes de plantas de tratamiento de aguas residuales domésticas (Guasca, Chiquinquirá y El Salitre). Se analizaron por medio de las técnicas estandarizadas, para fagos somáticos, ISO 10705-2 (2000), para fagos F+ totales, ISO 10705-1 (1999) y para fagos CB390, ISO 10705-2 (2000), modificada por Guzmán et al (2008). Se encontró presencia de estos indicadores en los dos tipos de aguas. En la cuenca del río Bogotá la media en unidades logarítmicas (UL) para fagos somáticos fue de 3.2, para F+ totales de 2.8 y para CB390 fue de 3.1. Por otro lado, para el caso de las PTARD, la media en UL para fagos somáticos de 5.2, para F+ totales de 3.8, y por último para CB390 de 5.1. El análisis realizado con la prueba Kolmogorov-Smirnov demostró que no había normalidad entre los datos, por esta razón se llevó a cabo la prueba no paramétrica Kruskal Wallis que no asume normalidad (P<0.05) en donde se observó que no hay diferencias significativas entre la suma de fagos somáticos y los F+ totales y la cepa evaluada CB390. Con estos resultados se puede concluir que estos indicadores sirven para evaluar presencia de virus en aguas y que la cepa CB390 es una alternativa para la detección simultanea de fagos somáticos y F+ totales.Pollution in different bodies of water has been increasing due to population growth, which creates a risk in health of people who are in contact with this type of water, there are bacteria, viruses and pathogenic parasites. For this reason, identifying pathogenic microorganisms is of great importance, but their detection in the laboratory can be a difficult task. As a consequence, microorganisms that are indicators of contamination of fecal origin in different types of waters are proposed, because they are easy, quick and economical to detect. As an example of bacterial indicators we have Fecal Coliforms, Total Coliforms and E. coli; Virals such as somatic phage, specific F + RNA phage and phage infecting Bacteroides fragilis, and parasites such as helminth eggs and Giardia and Cryptosporidium. At present, a strain of E. coli CB390 is available as an alternative to the use of somatic phage and phage F +, in order to save time, economic resources and be able to give real-time results of the possible presence of pathogenic viruses in water. In this study, viral indicators (somatic phages, total F + and CB390) were used to show viral contamination of fecal origin in the Bogotá river basin and effluents from domestic wastewater treatment plants (Guasca, Chiquinquirá and El Salitre). They were analyzed by means of standardized techniques, for somatic phages, ISO 10705-2 (2000), for total F + phage, ISO 10705-1 (1999) and for phage CB390, ISO 10705-2 (2000), modified by Guzmán et al. (2008). The presence of these indicators was found in both types of waters. In the Bogotá river basin, the average in logarithmic units (UL) for somatic phages was 3.2, for total F + of 2.8 and for CB390 it was 3.1. On the other hand, in the case of PTARDs, the UL average for somatic phages of 5.2, for total F + of 3.8, and finally for CB390 of 5.1. The analysis carried out with the Kolmogorov-Smirnov test showed that there was no normality between the data, for this reason the non-parametric Kruskal Wallis test was carried out, which does not assume normality (P <0.05), where it was observed that there are no significant differences between the sum of somatic phages and the total F + and the evaluated CB390 strain. With these results it can be concluded that these indicators serve to evaluate the presence of viruses in waters and the strain CB390 is an alternative for the simultaneous detection of somatic phages and total F +Microbiólogo (a) IndustrialPregradoPDFapplication/pdfspaPontificia Universidad JaverianaMicrobiología IndustrialFacultad de CienciasContaminación viralE. coli CB390Fagos somáticosFagos F+ totalesRío Bogotá y plantas de tratamiento de aguas residuales domésticasViral contaminationE. coli CB390Somatic phagesTotal F + phagesBogotá River and domestic wastewater treatment plantsMicrobiología industrial - Tesis y disertaciones académicasAguas residuales - Purificación - Tratamiento biológicoRío Bogotá (Colombia)Evaluación de la cepa huésped E.coli (CB390) para la detección simultánea de fagos somáticos y F+ totales como herramienta para evidenciar contaminación viral en aguas del río Bogotá y en efluentes de plantas de tratamiento de aguas residuales domésticasTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALDoc. Repositorio.pdfDocumentoapplication/pdf7561126http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/39214/1/Doc.%20Repositorio.pdf196a1396a7edf08c886dbf51f3777e90MD51open accessDoc. Repositorio_Cartas.pdfCartasapplication/pdf1812826http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/39214/2/Doc.%20Repositorio_Cartas.pdfae5056b44d5e918786b7b865af01dc85MD52metadata only accessLICENSElicense.txttext/plain2603http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/39214/3/license.txt2070d280cc89439d983d9eee1b17df53MD53open accessTHUMBNAILDoc. Repositorio.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2908http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/39214/4/Doc.%20Repositorio.pdf.jpga70743f3c5225ef407b86d4f69ac2beaMD54open accessDoc. Repositorio_Cartas.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5852http://repository.javeriana.edu.co/bitstream/10554/39214/5/Doc.%20Repositorio_Cartas.pdf.jpg9c2c6d634c1b45e8e3647cd9a8608995MD55open access10554/39214oai:repository.javeriana.edu.co:10554/392142022-05-03 11:35:48.972Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepositorio@javeriana.edu.coTElDRU5DSUEgWSBBVVRPUklaQUNJw5NOIERFIExPUyBBVVRPUkVTIFBBUkEgUFVCTElDQVIgWSBQRVJNSVRJUiBMQSBDT05TVUxUQSBZIFVTTy4KClBhcnRlIDEuIFTDqXJtaW5vcyBkZSBsYSBsaWNlbmNpYSBnZW5lcmFsIHBhcmEgcHVibGljYWNpw7NuIGRlIG9icmFzIGVuIGVsIHJlcG9zaXRvcmlvIGluc3RpdHVjaW9uYWwKQ29tbyB0aXR1bGFyIChlcykgZGVsIGRlcmVjaG8gZGUgYXV0b3IsIGNvbmZpZXJvIChlcmltb3MpIGEgbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgdW5hIGxpY2VuY2lhIG5vIGV4Y2x1c2l2YSwgbGltaXRhZGEgeSBncmF0dWl0YSBzb2JyZSBsYSBvYnJhIHF1ZSBzZSBpbnRlZ3JhcsOhIGVuIGVsIFJlcG9zaXRvcmlvIEluc3RpdHVjaW9uYWwsIHF1ZSBzZSBhanVzdGEgYSBsYXMgc2lndWllbnRlcyBjYXJhY3RlcsOtc3RpY2FzOgphKSAgICAgIEVzdGFyw6EgdmlnZW50ZSBhIHBhcnRpciBkZSBsYSBmZWNoYSBkZSBpbmNsdXNpw7NuIGVuIGVsIHJlcG9zaXRvcmlvLCBwb3IgdW4gcGxhem8gZGUgNSBhw7FvcywgcXVlIHNlcsOhbiBwcm9ycm9nYWJsZXMgaW5kZWZpbmlkYW1lbnRlIHBvciBlbCB0aWVtcG8gcXVlIGR1cmUgZWwgZGVyZWNobyBwYXRyaW1vbmlhbCBkZWwgYXV0b3IuIEVsIGF1dG9yIHBvZHLDoSBkYXIgcG9yIHRlcm1pbmFkYSBsYSBsaWNlbmNpYSBzb2xpY2l0w6FuZG9sbyBhIGxhIFVuaXZlcnNpZGFkIHBvciBlc2NyaXRvLgpiKSAgICAgIEF1dG9yaXphIGEgbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgYSBwdWJsaWNhciBsYSBvYnJhIGVuIGRpZ2l0YWwsIGNvbm9jaWVuZG8gcXVlLCBkYWRvIHF1ZSBzZSBwdWJsaWNhIGVuIEludGVybmV0LCBwb3IgZXN0ZSBoZWNobyBjaXJjdWxhIGNvbiB1biBhbGNhbmNlIG11bmRpYWwuCmMpICAgICAgTG9zIGF1dG9yZXMgYWNlcHRhbiBxdWUgbGEgYXV0b3JpemFjacOzbiBzZSBoYWNlIGEgdMOtdHVsbyBncmF0dWl0bywgcG9yIGxvIHRhbnRvIHJlbnVuY2lhbiBhIHJlY2liaXIgYmVuZWZpY2lvIGFsZ3VubyBwb3IgbGEgcHVibGljYWNpw7NuLCBkaXN0cmlidWNpw7NuLCBjb211bmljYWNpw7NuIHDDumJsaWNhIHkgY3VhbHF1aWVyIG90cm8gdXNvIHF1ZSBzZSBoYWdhIGVuIGxvcyB0w6lybWlub3MgZGUgbGEgcHJlc2VudGUgbGljZW5jaWEgeSBkZSBsYSBsaWNlbmNpYSBkZSB1c28gY29uIHF1ZSBzZSBwdWJsaWNhLgpkKSAgICAgIExvcyBhdXRvcmVzIG1hbmlmaWVzdGFuIHF1ZSBzZSB0cmF0YSBkZSB1bmEgb2JyYSBvcmlnaW5hbCBzb2JyZSBsYSBxdWUgdGllbmVuIGxvcyBkZXJlY2hvcyBxdWUgYXV0b3JpemFuIHkgcXVlIHNvbiBlbGxvcyBxdWllbmVzIGFzdW1lbiB0b3RhbCByZXNwb25zYWJpbGlkYWQgcG9yIGVsIGNvbnRlbmlkbyBkZSBzdSBvYnJhIGFudGUgbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgeSBhbnRlIHRlcmNlcm9zLiBFbiB0b2RvIGNhc28gbGEgUG9udGlmaWNpYSBVbml2ZXJzaWRhZCBKYXZlcmlhbmEgc2UgY29tcHJvbWV0ZSBhIGluZGljYXIgc2llbXByZSBsYSBhdXRvcsOtYSBpbmNsdXllbmRvIGVsIG5vbWJyZSBkZWwgYXV0b3IgeSBsYSBmZWNoYSBkZSBwdWJsaWNhY2nDs24uCmUpICAgICAgQXV0b3Jpem8gKGFtb3MpIGEgbGEgVW5pdmVyc2lkYWQgcGFyYSBpbmNsdWlyIGxhIG9icmEgZW4gbG9zIMOtbmRpY2VzIHkgYnVzY2Fkb3JlcyBxdWUgZXN0aW1lbiBuZWNlc2FyaW9zIHBhcmEgcHJvbW92ZXIgc3UgZGlmdXNpw7NuLgpmKSAgICAgIEFjZXB0byAoYW1vcykgcXVlIGxhIFBvbnRpZmljaWEgVW5pdmVyc2lkYWQgSmF2ZXJpYW5hIHB1ZWRhIGNvbnZlcnRpciBlbCBkb2N1bWVudG8gYSBjdWFscXVpZXIgbWVkaW8gbyBmb3JtYXRvIHBhcmEgcHJvcMOzc2l0b3MgZGUgcHJlc2VydmFjacOzbiBkaWdpdGFsLgpnKSAgICAgIEF1dG9yaXpvIChhbW9zKSBxdWUgbGEgb2JyYSBzZWEgcHVlc3RhIGEgZGlzcG9zaWNpw7NuIGRlbCBww7pibGljbyBlbiBsb3MgdMOpcm1pbm9zIGF1dG9yaXphZG9zIGVuIGxvcyBsaXRlcmFsZXMgYW50ZXJpb3JlcyBiYWpvIGxvcyBsw61taXRlcyBkZWZpbmlkb3MgcG9yIGxhIHVuaXZlcnNpZGFkIGVuIGxhcyDigJxDb25kaWNpb25lcyBkZSB1c28gZGUgZXN0cmljdG8gY3VtcGxpbWllbnRv4oCdIGRlIGxvcyByZWN1cnNvcyBwdWJsaWNhZG9zIGVuIFJlcG9zaXRvcmlvIEluc3RpdHVjaW9uYWwgUFVKICwgY3V5byB0ZXh0byBjb21wbGV0byBzZSBwdWVkZSBjb25zdWx0YXIgZW4gaHR0cDovL3JlcG9zaXRvcnkuamF2ZXJpYW5hLmVkdS5jby8KClNJIEVMIERPQ1VNRU5UTyBTRSBCQVNBIEVOIFVOIFRSQUJBSk8gUVVFIEhBIFNJRE8gUEFUUk9DSU5BRE8gTyBBUE9ZQURPIFBPUiBVTkEgQUdFTkNJQSBPIFVOQSBPUkdBTklaQUNJw5NOLCBDT04gRVhDRVBDScOTTiBERSBMQSBQT05USUZJQ0lBIFVOSVZFUlNJREFEIEpBVkVSSUFOQSwgRUwgKExPUykgQVVUT1IoRVMpIEdBUkFOVElaQShNT1MpIFFVRSBTRSBIQSBDVU1QTElETyBDT04gTE9TIERFUkVDSE9TIFkgT0JMSUdBQ0lPTkVTIFJFUVVFUklET1MgUE9SIEVMIFJFU1BFQ1RJVk8gQ09OVFJBVE8gTyBBQ1VFUkRPLgo=