Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote
El Departamento de Ingeniería Bioquímica de la Universidad Icesi cuenta con un cepario de microorganismos en donde, parte de los hongos que componen la colección, aún no han sido identificados a nivel de género y especie. Por lo anterior, el objetivo de este trabajo fue realizar la identificación mo...
- Autores:
-
Caicedo Ortega, Nelson Hernando
Blanco Cruz, Liseth Dayanna
Osorio V., Liseth S.
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad ICESI
- Repositorio:
- Repositorio ICESI
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.icesi.edu.co:10906/99819
- Acceso en línea:
- http://repository.icesi.edu.co/biblioteca_digital/handle/10906/99819
http://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib?oid=359992
- Palabra clave:
- Región ITS
Amplificación
Análisis filogenético
Microorganismos - Clasificación
Trabajos de grado
Ingeniería Bioquímica
Departamento Ingeniería Bioquímica
- Rights
- openAccess
- License
- https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
| id |
ICESI2_aaa727d58c37e5ff7a87489cdd21c3db |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repository.icesi.edu.co:10906/99819 |
| network_acronym_str |
ICESI2 |
| network_name_str |
Repositorio ICESI |
| repository_id_str |
|
| dc.title.none.fl_str_mv |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote |
| dc.title.alternative.none.fl_str_mv |
Molecular identification of fungi belonging to the Ascomycota phylum: A challenge that remains afloat. |
| title |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote |
| spellingShingle |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote Región ITS Amplificación Análisis filogenético Microorganismos - Clasificación Trabajos de grado Ingeniería Bioquímica Departamento Ingeniería Bioquímica |
| title_short |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote |
| title_full |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote |
| title_fullStr |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote |
| title_full_unstemmed |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote |
| title_sort |
Identificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a flote |
| dc.creator.fl_str_mv |
Caicedo Ortega, Nelson Hernando Blanco Cruz, Liseth Dayanna Osorio V., Liseth S. |
| dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Ramírez Castrillón, Mauricio |
| dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Caicedo Ortega, Nelson Hernando Blanco Cruz, Liseth Dayanna Osorio V., Liseth S. |
| dc.contributor.role.none.fl_str_mv |
Asesor Tesis |
| dc.subject.none.fl_str_mv |
Región ITS Amplificación Análisis filogenético Microorganismos - Clasificación Trabajos de grado Ingeniería Bioquímica Departamento Ingeniería Bioquímica |
| topic |
Región ITS Amplificación Análisis filogenético Microorganismos - Clasificación Trabajos de grado Ingeniería Bioquímica Departamento Ingeniería Bioquímica |
| description |
El Departamento de Ingeniería Bioquímica de la Universidad Icesi cuenta con un cepario de microorganismos en donde, parte de los hongos que componen la colección, aún no han sido identificados a nivel de género y especie. Por lo anterior, el objetivo de este trabajo fue realizar la identificación molecular de hongos ascomicetos pertenecientes a la micoteca. Se reactivaron 20 cepas en agar PDA previamente conservados con aceite mineral a temperatura ambiente. Posteriormente se realizó su caracterización macroscópica y microscópica de algunos ejemplares para una verificación de identificaciones previas y clasificación inicial por fenotipos. Se realizó extracción de ADN genómico de las cepas fúngicas para seguidamente, amplificar y secuenciar la región ITS1-5.8S-ITS2 del ADNr usando la técnica PCR y secuenciación Sanger, respectivamente. Se identificaron catorce cepas a nivel de género mediante la comparación de secuencias contra las cepas de referencia, usando el algoritmo BLAST, y cinco de ellas fueron clasificadas a nivel de especie mediante análisis filogenético. La cepa EBB-62 no amplificó bajo las combinaciones de cebadores empleados en este estudio. Para este caso particular, se llevó a cabo un diseño experimental variando la concentración de la Taq polimerasa y condiciones del régimen de ciclado. Estos resultados aportan a la corrección de conservación de pureza de los aislados y brinda una metodología para la identificación a nivel de genero. |
| publishDate |
2021 |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2021-01-01 2023-03-13T07:41:57Z |
| dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2021-01-01 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2023-03-13T07:41:57Z |
| dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| dc.type.coar.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| dc.type.local.none.fl_str_mv |
Trabajo de grado |
| dc.type.version.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.coarversion.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
| format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.other.none.fl_str_mv |
359992 |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://repository.icesi.edu.co/biblioteca_digital/handle/10906/99819 |
| dc.identifier.OLIB.none.fl_str_mv |
http://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib?oid=359992 |
| dc.identifier.instname.none.fl_str_mv |
instname: Universidad Icesi |
| dc.identifier.reponame.none.fl_str_mv |
reponame: Biblioteca Digital |
| dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv |
repourl: https://repository.icesi.edu.co/ |
| identifier_str_mv |
359992 instname: Universidad Icesi reponame: Biblioteca Digital repourl: https://repository.icesi.edu.co/ |
| url |
http://repository.icesi.edu.co/biblioteca_digital/handle/10906/99819 http://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib?oid=359992 |
| dc.language.iso.none.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.rights.uri.none.fl_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
| dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| dc.rights.license.none.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) |
| dc.rights.coar.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.extent.none.fl_str_mv |
29 páginas |
| dc.format.medium.none.fl_str_mv |
Digital |
| dc.format.mimetype.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.spatial.none.fl_str_mv |
Cali de Lat: 03 24 00 N degrees minutes Lat: 3.4000 decimal degrees Long: 076 30 00 W degrees minutes Long: -76.5000 decimal degrees. |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Icesi |
| dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv |
Facultad de Ingeniería y Diseño |
| dc.publisher.department.none.fl_str_mv |
Departamento Ingeniería Bioquímica |
| dc.publisher.place.none.fl_str_mv |
Santiago de Cali |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Icesi |
| institution |
Universidad ICESI |
| bitstream.url.fl_str_mv |
http://repository.icesi.edu.co/biblioteca_digital/bitstream/10906/99819/1/TG03705.pdf |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
7c2be65d44c8d1263f296739913520d0 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital - Universidad icesi |
| repository.mail.fl_str_mv |
cdcriollo@icesi.edu.co |
| _version_ |
1814094977527971840 |
| spelling |
Ramírez Castrillón, MauricioCaicedo Ortega, Nelson HernandoBlanco Cruz, Liseth DayannaOsorio V., Liseth S.Asesor TesisCali de Lat: 03 24 00 N degrees minutes Lat: 3.4000 decimal degrees Long: 076 30 00 W degrees minutes Long: -76.5000 decimal degrees.2023-03-13T07:41:57Z2021-01-012023-03-13T07:41:57Z2021-01-01359992http://repository.icesi.edu.co/biblioteca_digital/handle/10906/99819http://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib?oid=359992instname: Universidad Icesireponame: Biblioteca Digitalrepourl: https://repository.icesi.edu.co/El Departamento de Ingeniería Bioquímica de la Universidad Icesi cuenta con un cepario de microorganismos en donde, parte de los hongos que componen la colección, aún no han sido identificados a nivel de género y especie. Por lo anterior, el objetivo de este trabajo fue realizar la identificación molecular de hongos ascomicetos pertenecientes a la micoteca. Se reactivaron 20 cepas en agar PDA previamente conservados con aceite mineral a temperatura ambiente. Posteriormente se realizó su caracterización macroscópica y microscópica de algunos ejemplares para una verificación de identificaciones previas y clasificación inicial por fenotipos. Se realizó extracción de ADN genómico de las cepas fúngicas para seguidamente, amplificar y secuenciar la región ITS1-5.8S-ITS2 del ADNr usando la técnica PCR y secuenciación Sanger, respectivamente. Se identificaron catorce cepas a nivel de género mediante la comparación de secuencias contra las cepas de referencia, usando el algoritmo BLAST, y cinco de ellas fueron clasificadas a nivel de especie mediante análisis filogenético. La cepa EBB-62 no amplificó bajo las combinaciones de cebadores empleados en este estudio. Para este caso particular, se llevó a cabo un diseño experimental variando la concentración de la Taq polimerasa y condiciones del régimen de ciclado. Estos resultados aportan a la corrección de conservación de pureza de los aislados y brinda una metodología para la identificación a nivel de genero.29 páginasDigitalapplication/pdfspaUniversidad IcesiFacultad de Ingeniería y DiseñoDepartamento Ingeniería BioquímicaSantiago de CaliEL AUTOR, expresa que la obra objeto de la presente autorización es original y la elaboró sin quebrantar ni suplantar los derechos de autor de terceros, y de tal forma, la obra es de su exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre éste. PARÁGRAFO: en caso de queja o acción por parte de un tercero referente a los derechos de autor sobre el artículo, folleto o libro en cuestión, EL AUTOR, asumirá la responsabilidad total, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos, la Universidad Icesi actúa como un tercero de buena fe. Esta autorización, permite a la Universidad Icesi, de forma indefinida, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, la Ley 44 de 1993, leyes y jurisprudencia vigente al respecto, haga publicación de este con fines educativos Todo persona que consulte ya sea la biblioteca o en medio electrónico podrá copiar apartes del texto citando siempre la fuentes, es decir el título del trabajo y el autor.https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Región ITSAmplificaciónAnálisis filogenéticoMicroorganismos - ClasificaciónTrabajos de gradoIngeniería BioquímicaDepartamento Ingeniería BioquímicaIdentificación molecular de hongos pertenecientes al filo Ascomycota : un desafío que sigue a floteMolecular identification of fungi belonging to the Ascomycota phylum: A challenge that remains afloat.info:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTrabajo de gradoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85ORIGINALTG03705.pdfapplication/pdf747934http://repository.icesi.edu.co/biblioteca_digital/bitstream/10906/99819/1/TG03705.pdf7c2be65d44c8d1263f296739913520d0MD5110906/99819oai:repository.icesi.edu.co:10906/998192023-03-13 02:41:58.553Biblioteca Digital - Universidad icesicdcriollo@icesi.edu.co |