Alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos usando algoritmos genéticos
El presente artículo describe un algoritmo genético y su implementación, que permite el alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos mediante reacomodaciones que simulan la inserción de gaps (huecos) y acciones de recombinación para obtener puntajes más altos en el alineamiento. Tales puntaje...
- Autores:
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Solanilla, Luis Felipe
- Tipo de recurso:
- Article of investigation
- Fecha de publicación:
- 2006
- Institución:
- Universidad ICESI
- Repositorio:
- Repositorio ICESI
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- Palabra clave:
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Solanilla, Luis FelipeCali de Lat: 03 24 00 N degrees minutes Lat: 3.4000 decimal degrees Long: 076 30 00 W degrees minutes Long: -76.5000 decimal degrees2006-10-11T17:48:42Z2006-10-11T17:48:42Z2006-10-1116925238http://hdl.handle.net/10906/828http://www.icesi.edu.co/revistas/index.php/sistemas_telematica/article/view/946http://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib/?infile=details.glu&loid=150228https://doi.org/10.18046/syt.v3i5.946instname: Universidad Icesireponame: Biblioteca Digitalrepourl: https://repository.icesi.edu.co/El presente artículo describe un algoritmo genético y su implementación, que permite el alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos mediante reacomodaciones que simulan la inserción de gaps (huecos) y acciones de recombinación para obtener puntajes más altos en el alineamiento. Tales puntajes se obtienen mediante el método de la suma de pares, en el cual se consideran todas las posibles combinaciones de aminoácidos en cada columna del alineamiento y se califican basándose en las puntuaciones de la matriz BLOSUM62.This article describes a genetic algorithm and its implementation that it allows the alignment of multiple sequences of amino acids by means of relocations that simulate the gaps insertion (holes) and actions of recombination to obtain higher scores in the alignment. Such scores are obtained by means of the method of the sum of even, in which there are considered all the possible combinations of amino acids in each column of the alignment and they are qualified being based on the punctuations of the matrix BLOSUM62.18 páginasDigitalapplication/pdfspaUniversidad IcesiFacultad de IngenieríaSantiago de CaliSistemas y Telemática;No.5 - 2006EL AUTOR, expresa que la obra objeto de la presente autorización es original y la elaboró sin quebrantar ni suplantar los derechos de autor de terceros, y de tal forma, la obra es de su exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre éste. PARÁGRAFO: en caso de queja o acción por parte de un tercero referente a los derechos de autor sobre el artículo, folleto o libro en cuestión, EL AUTOR, asumirá la responsabilidad total, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos, la Universidad Icesi actúa como un tercero de buena fe. Esta autorización, permite a la Universidad Icesi, de forma indefinida, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, la Ley 44 de 1993, leyes y jurisprudencia vigente al respecto, haga publicación de este con fines educativos Toda persona que consulte ya sea la biblioteca o en medio electróico podrá copiar apartes del texto citando siempre la fuentes, es decir el título del trabajo y el autor.https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2BIOINFORMÁTICAALGORITMOS GENÉTICOSGENÓMICAALINEAMINETO DE MÚLTIPLES SECUENCIASFACULTAD DE INGENIERÍAPRODUCCIÓN INTELECTUAL REGISTRADA - UNIVERSIDAD ICESISISTEMA & TELEMÁTICABIOINFORMATICSGENETIC ALGORITHMSTelecommunicationSystems engineeringIngeniería de sistemas y comunicacionesTelecomunicacionesAutomatización y sistemas de controlCommand and control systemAlineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos usando algoritmos genéticosinfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Artículoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Comunidad Universidad Icesi55371ORIGINALDocumento.htmlDocumento.htmltext/html283http://repository.icesi.edu.co/biblioteca_digital/bitstream/10906/828/1/Documento.html3e0bc712243ce7f721a5fa51d0b84b95MD5110906/828oai:repository.icesi.edu.co:10906/8282018-11-14 14:02:36.891Biblioteca Digital - Universidad icesicdcriollo@icesi.edu.co |
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