Alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos usando algoritmos genéticos

El presente artículo describe un algoritmo genético y su implementación, que permite el alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos mediante reacomodaciones que simulan la inserción de gaps (huecos) y acciones de recombinación para obtener puntajes más altos en el alineamiento. Tales puntaje...

Full description

Autores:
Solanilla, Luis Felipe
Tipo de recurso:
Article of investigation
Fecha de publicación:
2006
Institución:
Universidad ICESI
Repositorio:
Repositorio ICESI
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.icesi.edu.co:10906/828
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10906/828
http://www.icesi.edu.co/revistas/index.php/sistemas_telematica/article/view/946
http://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib/?infile=details.glu&loid=150228
https://doi.org/10.18046/syt.v3i5.946
Palabra clave:
BIOINFORMÁTICA
ALGORITMOS GENÉTICOS
GENÓMICA
ALINEAMINETO DE MÚLTIPLES SECUENCIAS
FACULTAD DE INGENIERÍA
PRODUCCIÓN INTELECTUAL REGISTRADA - UNIVERSIDAD ICESI
SISTEMA & TELEMÁTICA
BIOINFORMATICS
GENETIC ALGORITHMS
Telecommunication
Systems engineering
Ingeniería de sistemas y comunicaciones
Telecomunicaciones
Automatización y sistemas de control
Command and control system
Rights
openAccess
License
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Description
Summary:El presente artículo describe un algoritmo genético y su implementación, que permite el alineamiento de múltiples secuencias de aminoácidos mediante reacomodaciones que simulan la inserción de gaps (huecos) y acciones de recombinación para obtener puntajes más altos en el alineamiento. Tales puntajes se obtienen mediante el método de la suma de pares, en el cual se consideran todas las posibles combinaciones de aminoácidos en cada columna del alineamiento y se califican basándose en las puntuaciones de la matriz BLOSUM62.