Tangbook: herramienta analítica y de visualización para datos metabolómicos
Este proyecto tiene como objetivo desarrollar una herramienta de análisis de datos metabolómicos utilizando bases de datos generalizadas preexistentes. Recientemente, la metabolómica se ha vuelto relevante debido a su prometedora contribución al diagnóstico de enfermedades y la identificación de tra...
- Autores:
-
Ojeda Ávila, Johana Constanza.
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Escuela Colombiana de Ingeniería Julio Garavito
- Repositorio:
- Repositorio Institucional ECI
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:repositorio.escuelaing.edu.co:001/2135
- Acceso en línea:
- https://repositorio.escuelaing.edu.co/handle/001/2135
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- Palabra clave:
- Procesamiento de datos - Metabolómica
Bioinformática -- Biología - Procesamiento de datos
Ingeniería Biomédica
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Este proyecto tiene como objetivo desarrollar una herramienta de análisis de datos metabolómicos utilizando bases de datos generalizadas preexistentes. Recientemente, la metabolómica se ha vuelto relevante debido a su prometedora contribución al diagnóstico de enfermedades y la identificación de tratamientos. Sin embargo, los datos metabolómicos plantean un desafío debido a la gran cantidad de datos generados a partir de muestras biológicas de pacientes, lo que dificulta los análisis para médicos e investigadores. Por lo tanto, los investigadores de diferentes campos requieren herramientas bioinformáticas para procesar datos de manera rápida y confiable. Este proyecto utilizará datos metabolómicos sin procesar de pacientes con encefalopatía metabólica y arritmias relacionadas, afectados por TANGO2-RMEA. TANGO2-RMEA es una enfermedad genética rara descubierta recientemente causada por variantes patogénicas en el gen TANGO2. El mecanismo metabólico subyacente que conduce a los síntomas graves en TANGO2-RMEA no se comprende bien. El análisis tiene como objetivo ayudar a los médicos e investigadores a comprender mejor el defecto en los pacientes TANGO2-RMEA, lo que genera hipótesis que los médicos genetistas y otros especialistas explorarán en detalle, con el objetivo final de encontrar estrategias de tratamiento para esta afección. |
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Este proyecto utilizará datos metabolómicos sin procesar de pacientes con encefalopatía metabólica y arritmias relacionadas, afectados por TANGO2-RMEA. TANGO2-RMEA es una enfermedad genética rara descubierta recientemente causada por variantes patogénicas en el gen TANGO2. El mecanismo metabólico subyacente que conduce a los síntomas graves en TANGO2-RMEA no se comprende bien. El análisis tiene como objetivo ayudar a los médicos e investigadores a comprender mejor el defecto en los pacientes TANGO2-RMEA, lo que genera hipótesis que los médicos genetistas y otros especialistas explorarán en detalle, con el objetivo final de encontrar estrategias de tratamiento para esta afección.The project aims to develop a new metabolomic data analysis tool using preexisting widespread metabolomic da- tabases. Recently, metabolomics has become more relevant due to its promising contribution to diagnosing diseases and identifying treatments. However, metabolomic data poses a challenge due to the vast amount of data generated from patients’biological samples, making analyses difficult for clinicians and researchers. Therefore, investigators from different fields require bioinforma- tic tools to process metabolomic data quickly and reliably. This project will utilize raw metabolomic data from patients affected by TANGO2 Related Metabolic Encephalopathy and Arrhythmias (TANGO2-RMEA) as a patient sample pilot. TANGO2-RMEA is a recently found rare genetic disease caused by pathogenic variants in the TANGO2 gene. The underlying metabolic mechanism leading to the severe symptoms in TANGO2-RMEA is not well understood. The analysis aims to help physicians and researchers better understand the defect in the TANGO2-RMEA patients, leading to hypotheses to be explored in detail by medical geneticists and other specialists, with the ultimate goal of finding treatment strategies for this condition.PregradoIngeniero(a) Biomédico(a)47 páginasapplication/pdfspaTangbook: herramienta analítica y de visualización para datos metabolómicosTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Ingeniería BiomédicaIngeniería BiomédicaN/Ainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Procesamiento de datos - MetabolómicaBioinformática -- Biología - Procesamiento de datosIngeniería BiomédicaProcesamiento de datos - MetabolómicaBioinformática -- Biología - Procesamiento de datosIngeniería BiomédicaData processing - MetabolomicsBioinformatics -- Biology - Data processingBiomedical engineeringTHUMBNAILOjeda Ávila, Johana Constanza-2022.pdf.jpgOjeda Ávila, Johana Constanza-2022.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6415https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2135/5/Ojeda%20%c3%81vila%2c%20Johana%20Constanza-2022.pdf.jpgdd41159482ce653996ed8d4c3fcd9f18MD55open accessAutorización.pdf.jpgAutorización.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg12809https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2135/7/Autorizaci%c3%b3n.pdf.jpg0d6461b839e002826c20d45adaa4742fMD57metadata only accessTEXTOjeda Ávila, Johana Constanza-2022.pdf.txtOjeda Ávila, Johana Constanza-2022.pdf.txtExtracted texttext/plain106770https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2135/4/Ojeda%20%c3%81vila%2c%20Johana%20Constanza-2022.pdf.txtc0b5a4e5740ad682bdd868a842e6d24dMD54open accessAutorización.pdf.txtAutorización.pdf.txtExtracted texttext/plain3441https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2135/6/Autorizaci%c3%b3n.pdf.txta08fe14237fa0f3193fdea1771d888f2MD56metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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