Estudio de fitoconstituyentes mediante docking molecular para el tratamiento de diabetes mellitus gestacional
La diabetes mellitus gestacional (DMG) es una enfermedad grave del embrazo donde se presenta cualquier grado de intolerancia a la glucosa en el cuerpo, generando hiperglucemia en el cuerpo de las mujeres gestantes, ocasionando diferentes enfermedades sobre el feto, bebé y madre. En la actualidad exi...
- Autores:
-
Baron Restrepo, Jose Mateo
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Escuela Colombiana de Ingeniería Julio Garavito
- Repositorio:
- Repositorio Institucional ECI
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- Acceso en línea:
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- Palabra clave:
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Embarazo - Complicaciones
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La diabetes mellitus gestacional (DMG) es una enfermedad grave del embrazo donde se presenta cualquier grado de intolerancia a la glucosa en el cuerpo, generando hiperglucemia en el cuerpo de las mujeres gestantes, ocasionando diferentes enfermedades sobre el feto, bebé y madre. En la actualidad existen tratamientos mediante insulina, gliburidad y metformina, pero cada uno de estos procedimientos presentan efectos secundarios sobre la paciente o sobre su bebé. Es por ello, que se busca encontrar una alternativa diferente a los compuestos para tratar la dibete mellitus gestacional. Por tanto, en esta tesis de grado se busca encontrar proteínas directamente relacionadas con la DMG, encontrar fitoconstituyentes que disminuyan la concentración de glucosa en sangre, encontrar sitios de unión en las proteínas encontradas y realizar docking molecular entre proteínas y fitoconstituyentes en los sitios de unión encontrados. Se encontró evidencia científica sobre la relación entre la DMG y las proteínas 4UV7-3Q4Z, además también se encontraron 72 fitoconstituyentes con características polares y apolares, los cuales fueron clasificados según su solubilidad. Con la proteína 4UV7 y fitoconstituyentes solubles se realizó docking molecular sobre sitios de unión obtenidos mediante software predictivos. Los resultados obtenidos con el docking molecular mostraron una afinidad electrónica muy similar entre los fitoconstituyentes-proteína y fármacos-proteína |
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Por tanto, en esta tesis de grado se busca encontrar proteínas directamente relacionadas con la DMG, encontrar fitoconstituyentes que disminuyan la concentración de glucosa en sangre, encontrar sitios de unión en las proteínas encontradas y realizar docking molecular entre proteínas y fitoconstituyentes en los sitios de unión encontrados. Se encontró evidencia científica sobre la relación entre la DMG y las proteínas 4UV7-3Q4Z, además también se encontraron 72 fitoconstituyentes con características polares y apolares, los cuales fueron clasificados según su solubilidad. Con la proteína 4UV7 y fitoconstituyentes solubles se realizó docking molecular sobre sitios de unión obtenidos mediante software predictivos. Los resultados obtenidos con el docking molecular mostraron una afinidad electrónica muy similar entre los fitoconstituyentes-proteína y fármacos-proteínaGestational diabetes mellitus (GDM) is a serious disease of the arm where any degree of glucose intolerance occurs in the body, generating hyperglycemia in the body of pregnant women, causing different diseases for the fetus, baby and mother. Currently there are treatments using insulin, glyburity and metformin, but each of these procedures has side effects on the patient or their baby. For this reason, we seek to find a different alternative to compounds to treat gestational diabetes mellitus. Therefore, in this degree thesis we seek to find proteins directly related to GDM, find phytoconstituents that reduce the concentration of glucose in the blood, find binding sites in the proteins found and perform molecular docking between proteins and phytoconstituents at the binding sites. . found. Scientific evidence was found on the relationship between DMG and 4UV7-3Q4Z proteins, in addition, 72 phytoconstituents with polar and non-polar characteristics were also found, which were classified according to their solubility. With the 4UV7 protein and soluble phytoconstituents, molecular docking was performed on binding sites obtained using predictive software. The results obtained with molecular docking show a very similar electronic affinity between the phytoconstituents-protein and drugs-protein.INTRODUCCIÓN........................................................................................ 5 1.1. Planteamiento del Problema.............................................................. 10 1.2. Justificación ....................................................................................... 11 1.3. Estado del Arte .................................................................................. 11 1.3.1 Metas no Glicémicas ............................................................ 12 1.3.2.Actividad física ..................................................................... 13 1.3.3. Monitoreo glicémico ............................................................ 13 1.3.4. Insulinoterapia..................................................................... 13 1.3.5. Antidiabéticos Orales........................................................... 13 1.3.6. Alternativas a Tratamientos................................................. 14 2. OBJETIVOS ............................................................................................. 15 2.1. General.............................................................................................. 15 2.2. Específicos ........................................................................................ 15 3. MARCO TEÓRICO................................................................................... 15 3.1. Diabetes Mellitus Gestacional............................................................ 16 •Factores de riesgo en la Diabetes mellitus Gestacional ..................... 16 •Fisiopatología de la Diabetes Mellitus Gestacional ............................ 16 3.3. Resistencia a la insulina.................................................................. 21 3.4. Transporte placentario, aminoácidos y ácidos grasos........................ 23 3.5. Proteínas e Interacciones .................................................................. 23 •Estructura Primaria ............................................................................ 23 •Estructura Secundaria........................................................................ 24 •Estructura terciaria............................................................................. 25 •Estructura cuaternaria........................................................................ 25 3.6. Interacciones con otras moléculas ..................................................... 25 •Interacción del ligando con la proteína............................................... 26 •Complejo inhibidor de enzimas .......................................................... 26 •Ecuación de Michaelis-Menten .......................................................... 26 •Energía libre de la interacción ligando proteína ................................. 27 •Bases físicas de las interacciones ligando proteína ........................... 27 •Interacciones no polares y puentes de hidrogeno .............................. 28 •nteracciones hidrofóbicas ................................................................. 28 4 3.7. Fitoquímicos ...................................................................................... 28 3.8. Softwares bioinformáticos.................................................................. 29 •BIOVA Discovery Studio Visualizer.................................................... 29 •ProBis ................................................................................................ 31 •PrankWeb.......................................................................................... 33 •Coach ................................................................................................ 34 4. METODOLOGÍA....................................................................................... 35 4.1. Búsqueda de principales proteínas de estudio................................... 35 4.2. Búsqueda y selección de fitoconstituyentes o fitoquímicos. ............... 36 4.4. Docking Molecular ............................................................................. 37 •Molecular Docking on Autodock......................................................... 37 5. RESULTADOS ......................................................................................... 40 5.1. Selección de principales proteínas..................................................... 41 5.2. Clasificación de fitoconstituyentes o fitoquímicos............................... 42 5.3. Selección de sitios de unión............................................................... 46 5.4. Docking molecular ............................................................................. 48 6. DISCUSIÓN.............................................................................................. 51 7. RECOMENDACIONES Y TRABAJOS FUTUROS.................................... 52 8. CONCLUSIONES..................................................................................... 52 9. REFERENCIAS ........................................................................................................... 53 ANEXOS.......................................................................................................................... 59PregradoIngeniero(a) Biomédico(a)63 p.application/pdfspaEscuela Colombiana de IngenieríaBogotáIngeniería Biomédicahttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Estudio de fitoconstituyentes mediante docking molecular para el tratamiento de diabetes mellitus gestacionalTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85N/ACuidado prenatalEmbarazo - ComplicacionesDiabetes mellitus gestacionalDocking molecularFitoconstituyentesFitoquímicosBioinformáticaProteínasTHUMBNAILTesis MateoBaron.pdf.jpgTesis MateoBaron.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7289https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2977/7/Tesis%20MateoBaron.pdf.jpg6fa92c3ac14dea249588d94167fa1a59MD57open accessAutorizacion_MateoBaron.pdf.jpgAutorizacion_MateoBaron.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg14206https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2977/9/Autorizacion_MateoBaron.pdf.jpgcaa4acf080cb37939d52754dbe70beb7MD59metadata only accessTEXTTesis MateoBaron.pdf.txtTesis MateoBaron.pdf.txtExtracted texttext/plain139353https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2977/6/Tesis%20MateoBaron.pdf.txt18a50aa6993f50744026fb73c8c2a126MD56open accessAutorizacion_MateoBaron.pdf.txtAutorizacion_MateoBaron.pdf.txtExtracted texttext/plain3437https://repositorio.escuelaing.edu.co/bitstream/001/2977/8/Autorizacion_MateoBaron.pdf.txted04baa528abc456a3910b2b9f0ccfc5MD58metadata only accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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