Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers.
La enfermedad de Chagas es una enfermedad tropical y sistémica causada por el parásito Trypanosoma cruzi . Este parásito se ha dividido en seis unidades de tipado discreto (DTU) debido a su alta diversidad genética. T. cruziI (TcI) es la DTU más prevalente en Colombia y recientemente asociada a card...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2012
- Institución:
- Universidad del Rosario
- Repositorio:
- Repositorio EdocUR - U. Rosario
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repository.urosario.edu.co:10336/26626
- Acceso en línea:
- https://doi.org/10.1016/j.exppara.2012.09.017
https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/26626
- Palabra clave:
- DTU's
Recombinación
Genotipos
Citocromo b
Redes filogenéticas
Máxima verosimilitud
DTU's
Recombination
Genotypes
Cytochrome b
Phylogenetic networks
Maximum likelihood
- Rights
- License
- Restringido (Acceso a grupos específicos)
id |
EDOCUR2_f55dc2a7e1502499403f685f31feb127 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repository.urosario.edu.co:10336/26626 |
network_acronym_str |
EDOCUR2 |
network_name_str |
Repositorio EdocUR - U. Rosario |
repository_id_str |
|
spelling |
1011716118600a34b10e4-f719-4e6a-9d4f-0717561679ccd93c3203-c244-4e1f-9f4a-abd382e2692d194d1702-daa4-4eab-964e-0a5aa7cb95a9a5752733-d32e-4887-b4fc-628d379214ff2020-08-19T14:39:55Z2020-08-19T14:39:55Z2012-12-01La enfermedad de Chagas es una enfermedad tropical y sistémica causada por el parásito Trypanosoma cruzi . Este parásito se ha dividido en seis unidades de tipado discreto (DTU) debido a su alta diversidad genética. T. cruziI (TcI) es la DTU más prevalente en Colombia y recientemente asociada a cardiomiopatías. El objetivo de este estudio fue desentrañar la variabilidad genética entre un conjunto de 70 clones TcI de células individuales de diferentes regiones geográficas y huéspedes utilizando las secuencias de ADNc de Cytb y SSU. Los resultados mostraron dos genotipos asociados a los ciclos de transmisión de la enfermedad de Chagas en Colombia y respaldan las descripciones anteriores utilizando SL-IR. Las redes filogenéticas se desarrollaron detectando eventos de recombinación dentro de TcI. También probamos las relaciones filogenéticas debajo de los clones TcI y las secuencias TcIII / TcIV observando la alta relación de los clones TcI del ciclo selvático con TcIII / TcIV. Corroboramos la alta diversidad genética que muestra TcI, la recombinación plausible dentro de esta DTU que respalda el modelo previo de intercambio genético propuesto enT. cruzi poblaciones. Concluimos indagando sobre la necesidad de realizar nuevos estudios para dilucidar la estructura genética de TcI en los países endémicos de la enfermedad de Chagas.Chagas disease is a tropical and systemic disease caused by the Trypanosoma cruzi parasite. This parasite has been divided into six discrete typing units (DTU) due to its high genetic diversity. T. cruziI (TcI) is the most prevalent DTU in Colombia and recently associated with cardiomyopathies. The aim of this study was to unravel the genetic variability between a set of 70 TcI clones of individual cells from different geographic regions and hosts using the cDNA sequences of Cytb and SSU. The results showed two genotypes associated with the transmission cycles of Chagas disease in Colombia and support the previous descriptions using SL-IR. Phylogenetic networks were developed by detecting recombination events within TcI. We also tested the phylogenetic relationships below the TcI clones and the TcIII / TcIV sequences by noting the high ratio of the jungle cycle TcI clones to TcIII / TcIV. We corroborate the high genetic diversity shown by TcI, the plausible recombination within this DTU that supports the previous model of genetic exchange proposed in T. cruzi populations. We conclude by inquiring about the need for new studies to elucidate the genetic structure of TcI in endemic countries of Chagas disease.application/pdfhttps://doi.org/10.1016/j.exppara.2012.09.017ISSN: 0014-4894https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/26626engElsevier494No. 4487Experimental ParasitologyVol. 132Parasitología Experimental, ISSN.0014-4894, Vol.132, No.4 (diciembre-2012);pp. 487-494https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0014489412002962?via%3DihubRestringido (Acceso a grupos específicos)http://purl.org/coar/access_right/c_16ecExperimental Parasitologyinstname:Universidad del Rosarioreponame:Repositorio Institucional EdocURDTU'sRecombinaciónGenotiposCitocromo bRedes filogenéticasMáxima verosimilitudDTU'sRecombinationGenotypesCytochrome bPhylogenetic networksMaximum likelihoodNatural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers.Genotipos naturales y emergentes de Trypanosoma cruzi I revelados por marcadores genéticos mitocondriales (Cytb) y nucleares (SSU rDNA).articleArtículohttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85http://purl.org/coar/resource_type/c_6501Ramírez, Juan DavidDuque,María ClaraMontilla,MarlenyCucunubá,ZulmaGuhl,Felipe10336/26626oai:repository.urosario.edu.co:10336/266262021-10-05 06:56:04.393https://repository.urosario.edu.coRepositorio institucional EdocURedocur@urosario.edu.co |
dc.title.spa.fl_str_mv |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. |
dc.title.TranslatedTitle.spa.fl_str_mv |
Genotipos naturales y emergentes de Trypanosoma cruzi I revelados por marcadores genéticos mitocondriales (Cytb) y nucleares (SSU rDNA). |
title |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. |
spellingShingle |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. DTU's Recombinación Genotipos Citocromo b Redes filogenéticas Máxima verosimilitud DTU's Recombination Genotypes Cytochrome b Phylogenetic networks Maximum likelihood |
title_short |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. |
title_full |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. |
title_fullStr |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. |
title_full_unstemmed |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. |
title_sort |
Natural and emergent Trypanosoma cruzi I genotypes revealed by mitochondrial (Cytb) and nuclear (SSU rDNA) genetic markers. |
dc.subject.spa.fl_str_mv |
DTU's Recombinación Genotipos Citocromo b Redes filogenéticas Máxima verosimilitud |
topic |
DTU's Recombinación Genotipos Citocromo b Redes filogenéticas Máxima verosimilitud DTU's Recombination Genotypes Cytochrome b Phylogenetic networks Maximum likelihood |
dc.subject.keyword.spa.fl_str_mv |
DTU's Recombination Genotypes Cytochrome b Phylogenetic networks Maximum likelihood |
description |
La enfermedad de Chagas es una enfermedad tropical y sistémica causada por el parásito Trypanosoma cruzi . Este parásito se ha dividido en seis unidades de tipado discreto (DTU) debido a su alta diversidad genética. T. cruziI (TcI) es la DTU más prevalente en Colombia y recientemente asociada a cardiomiopatías. El objetivo de este estudio fue desentrañar la variabilidad genética entre un conjunto de 70 clones TcI de células individuales de diferentes regiones geográficas y huéspedes utilizando las secuencias de ADNc de Cytb y SSU. Los resultados mostraron dos genotipos asociados a los ciclos de transmisión de la enfermedad de Chagas en Colombia y respaldan las descripciones anteriores utilizando SL-IR. Las redes filogenéticas se desarrollaron detectando eventos de recombinación dentro de TcI. También probamos las relaciones filogenéticas debajo de los clones TcI y las secuencias TcIII / TcIV observando la alta relación de los clones TcI del ciclo selvático con TcIII / TcIV. Corroboramos la alta diversidad genética que muestra TcI, la recombinación plausible dentro de esta DTU que respalda el modelo previo de intercambio genético propuesto enT. cruzi poblaciones. Concluimos indagando sobre la necesidad de realizar nuevos estudios para dilucidar la estructura genética de TcI en los países endémicos de la enfermedad de Chagas. |
publishDate |
2012 |
dc.date.created.spa.fl_str_mv |
2012-12-01 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2020-08-19T14:39:55Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2020-08-19T14:39:55Z |
dc.type.eng.fl_str_mv |
article |
dc.type.coarversion.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
dc.type.spa.spa.fl_str_mv |
Artículo |
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv |
https://doi.org/10.1016/j.exppara.2012.09.017 |
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv |
ISSN: 0014-4894 |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/26626 |
url |
https://doi.org/10.1016/j.exppara.2012.09.017 https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/26626 |
identifier_str_mv |
ISSN: 0014-4894 |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.relation.citationEndPage.none.fl_str_mv |
494 |
dc.relation.citationIssue.none.fl_str_mv |
No. 4 |
dc.relation.citationStartPage.none.fl_str_mv |
487 |
dc.relation.citationTitle.none.fl_str_mv |
Experimental Parasitology |
dc.relation.citationVolume.none.fl_str_mv |
Vol. 132 |
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Parasitología Experimental, ISSN.0014-4894, Vol.132, No.4 (diciembre-2012);pp. 487-494 |
dc.relation.uri.spa.fl_str_mv |
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0014489412002962?via%3Dihub |
dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_16ec |
dc.rights.acceso.spa.fl_str_mv |
Restringido (Acceso a grupos específicos) |
rights_invalid_str_mv |
Restringido (Acceso a grupos específicos) http://purl.org/coar/access_right/c_16ec |
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.spa.fl_str_mv |
Elsevier |
dc.source.spa.fl_str_mv |
Experimental Parasitology |
institution |
Universidad del Rosario |
dc.source.instname.none.fl_str_mv |
instname:Universidad del Rosario |
dc.source.reponame.none.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Institucional EdocUR |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio institucional EdocUR |
repository.mail.fl_str_mv |
edocur@urosario.edu.co |
_version_ |
1814167738742996992 |